RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	LDB7	P38210	180 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ERV15	P38312	142 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YHR122W	P38829	231 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ALP1	P38971	573 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	UME6	P39001	836 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RMD6	P39975	231 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YND1	P40009	630 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PGD1	P40356	397 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	IME4	P41833	600 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RMD8	P43620	662 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YJL016W	P47072	561 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SNN1	P48232	102 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YGL159W	P53110	370 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	OCA2	P53949	197 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	VBA1	Q04301	562 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	DCR2	Q05924	578 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	LDB18	Q07887	179 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RKM5	Q12367	367 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	DCN1	Q12395	269 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YPR096C	O13587	100 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SUR1	P33300	382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RGI2	P40188	164 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RFC2	P40348	353 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YIR035C	P40579	254 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	POP1	P41812	875 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MRX5	P47007	382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	LOH1	P47055	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	TAD2	P47058	250 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MOG1	P47123	218 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MRX6	P48564	524 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YGL260W	P53056	76 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	VOA1	P53262	265 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ELP6	Q04868	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SCW10	Q04951	389 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SPO77	Q06134	477 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	GAS2	Q06135	555 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ANT1	Q06497	328 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	AIM6	Q07716	390 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SFM1	Q12314	213 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MHT1	Q12525	324 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	QCR7	P00128	127 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PUT1	P09368	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	REV1	P12689	985 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CDC23	P16522	626 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SNF6	P18888	332 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MGR1	P25573	417 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YIM1	P28625	365 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SPO23	P33757	523 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	TUL1	P36096	758 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	AVT5	P38176	459 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SHE1	P38200	338 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	BMT2	P38278	337 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	UBA4	P38820	440 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	LNP1	P38878	278 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RTT105	P40063	208 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MEP1	P40260	492 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ALG8	P40351	577 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	BMT5	P40493	336 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YGR201C	P42936	225 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PRM10	P42946	383 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	NSE4	P43124	402 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MCM22	P47167	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SRB7	P47822	140 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	DOC1	P53068	250 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SDT1	P53078	280 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YSA1	Q01976	231 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PEX25	Q02969	394 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MET31	Q03081	177 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CAC2	Q04199	468 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	VID22	Q05934	901 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MHR1	Q06630	226 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	GRC3	Q07845	632 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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