Protein–RNA interactions for Protein: P43124

NSE4, Non-structural maintenance of chromosome element 4, yeastyeast

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4P43124 NSR1YGR159C 1245 nt15.74■□□□□ 0.11
NSE4P43124 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.05■□□□□ -0
NSE4P43124 MDJ1YFL016C 1536 nt14.78□□□□□ -0.04
NSE4P43124 NOP1YDL014W 984 nt14.29□□□□□ -0.12
NSE4P43124 SSA3YBL075C 1950 nt13.69□□□□□ -0.22
NSE4P43124 YJL027CYJL027C 417 nt13.51□□□□□ -0.25
NSE4P43124 YBR190WYBR190W 312 nt12.83□□□□□ -0.36
NSE4P43124 DBP2YNL112W 1641 nt12.79□□□□□ -0.36
NSE4P43124 SRX1YKL086W 384 nt12.52□□□□□ -0.41
NSE4P43124 RTC3YHR087W 336 nt12.42□□□□□ -0.42
NSE4P43124 YKL036CYKL036C 393 nt12.4□□□□□ -0.42
NSE4P43124 PUT4YOR348C 1884 nt12.35□□□□□ -0.43
NSE4P43124 Q0297Q0297 156 nt12.29□□□□□ -0.44
NSE4P43124 SPT5YML010W 3192 nt12□□□□□ -0.49
NSE4P43124 SSA4YER103W 1929 nt11.92□□□□□ -0.5
NSE4P43124 ARE1YCR048W 1833 nt11.86□□□□□ -0.51
NSE4P43124 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.85□□□□□ -0.51
NSE4P43124 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.85□□□□□ -0.51
NSE4P43124 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.85□□□□□ -0.51
NSE4P43124 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.85□□□□□ -0.51
NSE4P43124 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.85□□□□□ -0.51
NSE4P43124 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.85□□□□□ -0.51
NSE4P43124 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.85□□□□□ -0.51
NSE4P43124 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.85□□□□□ -0.51
NSE4P43124 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.85□□□□□ -0.51
NSE4P43124 POA1YBR022W 534 nt11.83□□□□□ -0.52
NSE4P43124 BSC6YOL137W 1494 nt11.76□□□□□ -0.53
NSE4P43124 YCR051WYCR051W 669 nt11.75□□□□□ -0.53
NSE4P43124 RVS167YDR388W 1449 nt11.72□□□□□ -0.53
NSE4P43124 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.67□□□□□ -0.54
NSE4P43124 CCC1YLR220W 969 nt11.63□□□□□ -0.55
NSE4P43124 BDF1YLR399C 2061 nt11.61□□□□□ -0.55
NSE4P43124 SCJ1YMR214W 1134 nt11.58□□□□□ -0.56
NSE4P43124 SAH1YER043C 1350 nt11.54□□□□□ -0.56
NSE4P43124 TAT1YBR069C 1860 nt11.43□□□□□ -0.58
NSE4P43124 URN1YPR152C 1398 nt11.42□□□□□ -0.58
NSE4P43124 OPI9YLR338W 858 nt11.41□□□□□ -0.58
NSE4P43124 PAC11YDR488C 1602 nt11.41□□□□□ -0.58
NSE4P43124 BUD23YCR047C 828 nt11.28□□□□□ -0.6
NSE4P43124 NVJ2YPR091C 2313 nt11.21□□□□□ -0.62
NSE4P43124 SHR5YOL110W 714 nt11.16□□□□□ -0.62
NSE4P43124 MEP2YNL142W 1500 nt11.14□□□□□ -0.63
NSE4P43124 DEP1YAL013W 1218 nt11.09□□□□□ -0.63
NSE4P43124 PTC2YER089C 1395 nt11.04□□□□□ -0.64
NSE4P43124 PUN1YLR414C 792 nt11.04□□□□□ -0.64
NSE4P43124 NAB2YGL122C 1578 nt11.03□□□□□ -0.64
NSE4P43124 RPP1BYDL130W 321 nt11□□□□□ -0.65
NSE4P43124 RPN10YHR200W 807 nt10.97□□□□□ -0.65
NSE4P43124 DCW1YKL046C 1350 nt10.95□□□□□ -0.66
NSE4P43124 YBR220CYBR220C 1683 nt10.9□□□□□ -0.66
NSE4P43124 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.9□□□□□ -0.66
NSE4P43124 YOL085CYOL085C 342 nt10.9□□□□□ -0.66
NSE4P43124 SCS3YGL126W 1143 nt10.88□□□□□ -0.67
NSE4P43124 FIS1YIL065C 468 nt10.85□□□□□ -0.67
NSE4P43124 YNL208WYNL208W 600 nt10.85□□□□□ -0.67
NSE4P43124 YJR018WYJR018W 363 nt10.78□□□□□ -0.68
NSE4P43124 EMI2YDR516C 1503 nt10.77□□□□□ -0.69
NSE4P43124 YPS1YLR120C 1710 nt10.76□□□□□ -0.69
NSE4P43124 DAL1YIR027C 1383 nt10.73□□□□□ -0.69
NSE4P43124 PCH2YBR186W 1695 nt10.72□□□□□ -0.69
NSE4P43124 GUT2YIL155C 1950 nt10.72□□□□□ -0.69
NSE4P43124 YMR090WYMR090W 684 nt10.71□□□□□ -0.69
NSE4P43124 PKP1YIL042C 1185 nt10.7□□□□□ -0.7
NSE4P43124 SDH1YKL148C 1923 nt10.67□□□□□ -0.7
NSE4P43124 FPS1YLL043W 2010 nt10.67□□□□□ -0.7
NSE4P43124 YDL221WYDL221W 552 nt10.63□□□□□ -0.71
NSE4P43124 PHO4YFR034C 939 nt10.63□□□□□ -0.71
NSE4P43124 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.62□□□□□ -0.71
NSE4P43124 PET122YER153C 765 nt10.61□□□□□ -0.71
NSE4P43124 SEC11YIR022W 504 nt10.6□□□□□ -0.71
NSE4P43124 FPR4YLR449W 1179 nt10.6□□□□□ -0.71
NSE4P43124 PIB2YGL023C 1908 nt10.58□□□□□ -0.72
NSE4P43124 YDJ1YNL064C 1230 nt10.57□□□□□ -0.72
NSE4P43124 YDR095CYDR095C 411 nt10.55□□□□□ -0.72
NSE4P43124 YJR120WYJR120W 351 nt10.54□□□□□ -0.72
NSE4P43124 INM2YDR287W 879 nt10.5□□□□□ -0.73
NSE4P43124 CAC2YML102W 1407 nt10.5□□□□□ -0.73
NSE4P43124 SCC4YER147C 1875 nt10.45□□□□□ -0.74
NSE4P43124 PTP1YDL230W 1008 nt10.44□□□□□ -0.74
NSE4P43124 UME6YDR207C 2511 nt10.44□□□□□ -0.74
NSE4P43124 GAR1YHR089C 618 nt10.42□□□□□ -0.74
NSE4P43124 RTF1YGL244W 1677 nt10.35□□□□□ -0.75
NSE4P43124 IRC15YPL017C 1500 nt10.35□□□□□ -0.75
NSE4P43124 YSC84YHR016C 1407 nt10.33□□□□□ -0.76
NSE4P43124 RPP2AYOL039W 321 nt10.32□□□□□ -0.76
NSE4P43124 RPP2BYDR382W 333 nt10.29□□□□□ -0.76
NSE4P43124 GIS3YLR094C 1509 nt10.28□□□□□ -0.76
NSE4P43124 YHL050CYHL050C 2094 nt10.28□□□□□ -0.76
NSE4P43124 YBL100CYBL100C 315 nt10.27□□□□□ -0.77
NSE4P43124 SSA1YAL005C 1929 nt10.27□□□□□ -0.77
NSE4P43124 PTK1YKL198C 1989 nt10.26□□□□□ -0.77
NSE4P43124 BOR1YNL275W 1731 nt10.21□□□□□ -0.77
NSE4P43124 SCR1SCR1 522 nt10.21□□□□□ -0.77
NSE4P43124 RRN5YLR141W 1092 nt10.2□□□□□ -0.78
NSE4P43124 BOP3YNL042W 1191 nt10.2□□□□□ -0.78
NSE4P43124 YJL225CYJL225C 5277 nt10.17□□□□□ -0.78
NSE4P43124 TIR1YER011W 765 nt10.13□□□□□ -0.79
NSE4P43124 FUN26YAL022C 1554 nt10.13□□□□□ -0.79
NSE4P43124 ALF1YNL148C 765 nt10.1□□□□□ -0.79
NSE4P43124 RRT12YCR045C 1476 nt10.1□□□□□ -0.79
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