RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W SCL1P21243 252 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W HXT2P23585 541 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W DBR1P24309 405 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W GPX1P36014 167 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W KAP104P38217 918 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W TCB2P48231 1178 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RET3P53600 189 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YLR162WQ06235 118 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W IPK1Q06667 281 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MED1Q12321 566 aa-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MRP7P12687 371 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W UTR1P21373 530 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MDH2P22133 377 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W EFB1P32471 206 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SCM4P32564 187 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YBR062CP38239 180 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W TIF34P40217 347 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W BMT5P40493 336 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YFL064CP43540 174 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RPE1P46969 238 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SNX4P47057 423 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W LIF1P53150 421 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W AIM33Q04516 312 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W CTR3Q06686 241 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YPL278CQ08990 100 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W GLE1Q12315 538 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W PRM4Q12498 284 aa-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W RAD1P06777 1100 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W FBA1P14540 359 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W ARF2P19146 181 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W ADK2P26364 225 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MSK1P32048 576 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W MRPL6P32904 214 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W PES4P39684 611 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YEL067CP39978 195 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W AVT6P40074 448 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W LSM5P40089 93 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W PRM10P42946 383 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W PRP24P49960 444 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W KEL2P50090 882 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YNL143CP53908 130 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YDL144CQ07589 356 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W DCI1Q08558 271 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W VIK1Q12045 647 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YPL119C-AQ3E751 87 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W YBL112CQ3E7Y4 105 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W FSH3Q99369 266 aa-0.47□□□□□ -2.48
RDS3YPR094W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W CKI1P20485 582 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W MXR2P25566 168 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W DPB3P27344 201 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W ERG9P29704 444 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W TPO5P36029 618 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W SIF2P38262 535 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W IML3P38265 245 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W YHB1P39676 399 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W AVT2P39981 480 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data-0.48□□□□□ -2.49not detected
RDS3YPR094W ICE2P40499 491 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W YGR111WP53265 400 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W HCH1P53834 153 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W CYT2Q00873 224 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W YPL039WQ03080 316 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W NAT4Q04751 285 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W SFI1Q12369 946 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W SFG1Q12507 346 aa-0.48□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W AQY2P0CD90 149 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W VMA2P16140 517 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W PPH21P23594 369 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W GRR1P24814 1151 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W IMP1P28627 190 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W PEX4P29340 183 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W MRPL3P36516 390 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W YHR022CP38763 256 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W ZIM17P42844 174 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W COG7P53195 279 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W UBC7Q02159 165 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W YMR007WQ03675 126 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W PEX12Q04370 399 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W ECM18Q04623 453 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W YLL007CQ07799 665 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W MHT1Q12525 324 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W ISD11Q6Q560 94 aa-0.49□□□□□ -2.49
RDS3YPR094W DDI2P0CH63 225 aa-0.5□□□□□ -2.49
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