RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	IST2	P38250	946 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SPO73	P40031	143 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MIG2	P53035	382 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	NDL1	Q06568	189 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YAK1	P14680	807 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SNF6	P18888	332 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MIG1	P27705	504 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	PUP2	P32379	260 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	ECM14	P38836	430 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SCC4	P40090	624 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	IRC4	Q03036	179 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	ABZ2	Q03266	374 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SNX41	Q04053	625 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	CSI1	Q04368	295 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SLD7	Q08457	257 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RAD1	P06777	1100 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	TPO5	P36029	618 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SWC5	P38326	303 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MMS21	P38632	267 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	TAF6	P53040	516 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SWC4	P53201	476 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	TPC1	P53257	314 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	ALE1	Q08548	619 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	TAF10	Q12030	206 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MDY2	Q12285	212 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	HIF1	Q12373	385 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RRT12	P25381	491 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	VAM7	P32912	316 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CSE1	P33307	960 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.46	□□□□□ -2.34	not detected
HAL9	YOL089C	SRB2	P34162	210 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	AIM29	P36154	155 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	EFM1	P38732	585 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PET8	P38921	284 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SEN34	P39707	275 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YNL050C	P53952	270 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YLL007C	Q07799	665 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RPN6	Q12377	434 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SPP41	P38904	1435 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TEL1	P38110	2787 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	GAL7	P08431	366 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TOA2	P32774	122 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RSM27	P53305	110 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SUR7	P54003	302 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YPR078C	Q06813	372 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SLM3	Q12093	417 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YPR063C	Q12160	140 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YPR064W	Q12492	139 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	GAL3	P13045	520 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	FAR1	P21268	830 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RDS1	P25611	832 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	KRE6	P32486	720 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YFL040W	P43562	540 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	COG7	P53195	279 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CAB5	Q03941	241 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PEX10	Q05568	337 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	DXO1	Q06349	442 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SUE1	Q06524	206 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	KRE1	P17260	313 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YPC1	P38298	316 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	APE4	P38821	490 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	APC4	Q04601	652 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	ASR1	Q06834	288 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PST1	Q12355	444 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
HAL9	YOL089C	ERG9	P29704	444 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	AIM20	P40451	204 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	AVT7	P40501	490 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YCH1	P42937	148 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MIC19	P43594	170 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YGL088W	P53151	121 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	DPP1	Q05521	289 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YDR286C	Q05530	114 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SFG1	Q12507	346 aa		0.45	□□□□□ -2.34

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.9 ms