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Protein–RNA interactions for Protein: P17260
KRE1, Protein KRE1, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
KRE1
P17260
NSR1
YGR159C
1245 nt
12.91
□□□□□ -0.34
KRE1
P17260
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YML009W-B
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KRE1
P17260
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YDL014W
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12.33
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KRE1
P17260
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□□□□□ -0.5
KRE1
P17260
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□□□□□ -0.51
KRE1
P17260
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YKL036C
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11.21
□□□□□ -0.61
KRE1
P17260
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YJL027C
417 nt
10.97
□□□□□ -0.65
KRE1
P17260
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YKL086W
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P17260
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Q0297
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KRE1
P17260
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YBR190W
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KRE1
P17260
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YNL112W
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P17260
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YCR051W
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P17260
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P17260
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P17260
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P17260
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KRE1
P17260
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YPR091C
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KRE1
P17260
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YML010W
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KRE1
P17260
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YLR399C
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KRE1
P17260
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tP(UGG)A
72 nt
9.82
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KRE1
P17260
SUF9
tP(UGG)F
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□□□□□ -0.84
KRE1
P17260
SUF8
tP(UGG)H
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9.82
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KRE1
P17260
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
9.82
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KRE1
P17260
SUF7
tP(UGG)M
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9.82
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KRE1
P17260
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tP(UGG)N1
72 nt
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KRE1
P17260
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tP(UGG)N2
72 nt
9.82
□□□□□ -0.84
KRE1
P17260
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
9.82
□□□□□ -0.84
KRE1
P17260
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
9.82
□□□□□ -0.84
KRE1
P17260
POA1
YBR022W
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KRE1
P17260
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YOL137W
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KRE1
P17260
TAT1
YBR069C
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KRE1
P17260
CCC1
YLR220W
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KRE1
P17260
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YOL085C
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9.7
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KRE1
P17260
FPS1
YLL043W
2010 nt
9.68
□□□□□ -0.86
KRE1
P17260
RVS167
YDR388W
1449 nt
9.66
□□□□□ -0.86
KRE1
P17260
ARE1
YCR048W
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9.63
□□□□□ -0.87
KRE1
P17260
RPP1B
YDL130W
321 nt
9.62
□□□□□ -0.87
KRE1
P17260
YHR049C-A
YHR049C-A
297 nt
9.57
□□□□□ -0.88
KRE1
P17260
PKP1
YIL042C
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KRE1
P17260
SCJ1
YMR214W
1134 nt
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KRE1
P17260
URN1
YPR152C
1398 nt
9.37
□□□□□ -0.91
KRE1
P17260
YJL225C
YJL225C
5277 nt
9.36
□□□□□ -0.91
KRE1
P17260
SAH1
YER043C
1350 nt
9.33
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KRE1
P17260
SSA1
YAL005C
1929 nt
9.33
□□□□□ -0.92
KRE1
P17260
BUD23
YCR047C
828 nt
9.27
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KRE1
P17260
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RDN37-1
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KRE1
P17260
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
9.24
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KRE1
P17260
MEP2
YNL142W
1500 nt
9.24
□□□□□ -0.93
KRE1
P17260
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tP(UGG)O3
72 nt
9.23
□□□□□ -0.93
KRE1
P17260
OPI9
YLR338W
858 nt
9.22
□□□□□ -0.93
KRE1
P17260
PET122
YER153C
765 nt
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KRE1
P17260
UME6
YDR207C
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KRE1
P17260
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YOL110W
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P17260
SCR1
SCR1
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KRE1
P17260
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YBR220C
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KRE1
P17260
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P17260
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KRE1
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YMR090W
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P17260
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YNL064C
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YNL208W
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P17260
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YDL221W
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YJR018W
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YHR165W-A
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KRE1
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KRE1
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YHL050C
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□□□□□ -1.06
KRE1
P17260
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□□□□□ -1.06
KRE1
P17260
PTP1
YDL230W
1008 nt
8.42
□□□□□ -1.06
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