RNA–Protein interactions for RNA: YMR118C

SHH3, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane protein of unknown function, yeast

Gene SHH3, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHH3	YMR118C	TRM13	Q12383	476 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SHH3	YMR118C	EAF3	Q12432	401 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SHH3	YMR118C	FRE6	Q12473	712 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SHH3	YMR118C	PRM4	Q12498	284 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SHH3	YMR118C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SHH3	YMR118C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SHH3	YMR118C	PUT1	P09368	476 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	HOM3	P10869	527 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	APA2	P22108	325 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	EPT1	P22140	391 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ATS1	P31386	333 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SUA5	P32579	426 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PPG1	P32838	368 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	THI2	P38141	450 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ALG3	P38179	458 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SEN34	P39707	275 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	AIM2	P39721	246 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	JHD1	P40034	492 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PGD1	P40356	397 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YJL068C	P40363	299 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SDP1	P40479	209 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	POP1	P41812	875 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	UBX6	P47049	396 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PRM1	P53835	661 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	NRK1	P53915	240 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MTQ1	P53944	314 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YMR206W	Q03695	313 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	HLR1	Q04429	423 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YMR252C	Q04814	134 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CRR1	Q05790	422 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YPR127W	Q06494	345 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ICL2	Q12031	575 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MED4	Q12343	284 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	FSH3	Q99369	266 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	KIN28	P06242	306 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	STE7	P06784	515 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PRB1	P09232	635 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YOL162W	P0CF19	215 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	REV1	P12689	985 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ZRC1	P20107	442 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SED4	P25365	1065 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	NTH1	P32356	751 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ORC2	P32833	620 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ECT1	P33412	323 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YKL162C	P36052	402 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	GGC1	P38988	300 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	POG1	P40473	351 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YIL089W	P40500	205 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	APQ12	P40532	138 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PFA3	P42836	336 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PMT6	P42934	759 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PRM10	P42946	383 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	NSE4	P43124	402 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MRX5	P47007	382 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	IBA57	P47158	497 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SWC4	P53201	476 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	VHT1	P53241	593 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	GIM3	P53900	129 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YKR011C	Q02209	353 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MSC1	Q03104	513 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	SPC19	Q03954	165 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CAC2	Q04199	468 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	MDM30	Q05930	598 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	GAS2	Q06135	555 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	PEX30	Q06169	523 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	EAF1	Q06337	982 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CRT10	Q08226	957 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	YPR063C	Q12160	140 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	RRI1	Q12468	440 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SHH3	YMR118C	ECM29	P38737	1868 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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