RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	VPS17	P32913	551 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	THI2	P38141	450 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	CCZ1	P38273	704 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YBR242W	P38331	238 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MLH1	P38920	769 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.95	□□□□□ -1.46	not detected
MIA40	YKL195W	PZF1	P39933	429 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HIS6	P40545	261 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	CFD1	P40558	293 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PAM16	P42949	149 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	TRM9	P49957	279 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	TPN1	P53099	579 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	NUP116	Q02630	1113 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	NCE101	Q02820	53 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MSS11	Q03825	758 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PLP1	Q04004	230 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ORM2	Q06144	216 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	TAZ1	Q06510	381 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	CAN1	P04817	590 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HIS3	P06633	220 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	BAR1	P12630	587 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	STE12	P13574	688 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YPK2	P18961	677 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	BOS1	P25385	244 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YCL002C	P25565	263 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MXR2	P25566	168 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PBN1	P25580	416 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ITR1	P30605	584 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SLC1	P33333	303 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MTH1	P35198	433 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	GPX1	P36014	167 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YKL071W	P36086	256 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MRPL15	P36523	253 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MAL32	P38158	584 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPS27B	P38711	82 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	FET3	P38993	636 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PMT5	P52867	743 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ORM1	P53224	222 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MAL12	P53341	584 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MRPL50	P53724	139 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YMR252C	Q04814	134 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	FRE6	Q12473	712 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	QCR7	P00128	127 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PET54	P10834	293 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ATG22	P25568	528 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	KRE6	P32486	720 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MKK2	P32491	506 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PET112	P33893	541 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	NIC96	P34077	839 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	CLG1	P35190	452 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	CHK1	P38147	527 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ALG3	P38179	458 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	DOC1	P53068	250 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SAY1	P53324	424 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PLB2	Q03674	706 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	AIM36	Q03798	255 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	TPO3	Q06451	622 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	CYK3	Q07533	885 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	AIM6	Q07716	390 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YOL073C	Q08232	322 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YDL109C	Q12103	647 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MDM32	Q12171	622 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MTR10	Q99189	972 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YPR117W	Q06116	2489 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SOD2	P00447	233 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	CDC9	P04819	755 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SPS2	P08459	502 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HMG1	P12683	1054 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	NUP1	P20676	1076 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PRE4	P30657	266 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.92	□□□□□ -1.46	not detected
MIA40	YKL195W	PAU2	P32612	120 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PPQ1	P32945	549 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	DUT1	P33317	147 aa		5.92	□□□□□ -1.46

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