RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	PNS1	Q12412	539 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	IZH4	Q99393	312 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	UBR2	Q07963	1872 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YEF1	P32622	495 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RSM22	P36056	628 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	FES1	P38260	290 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RCK2	P38623	610 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YFL040W	P43562	540 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	HOC1	P47124	396 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	TOS2	P50078	622 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RTC4	P53850	401 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	SPR6	Q01684	191 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	BET5	Q03630	159 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	CAC2	Q04199	468 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	NDE2	Q07500	545 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	TIP41	Q12199	356 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	SNF8	Q12483	233 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	VPS13	Q07878	3144 aa		3.9	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YMR31	P19955	123 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	SPO11	P23179	398 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	PPZ1	P26570	692 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	MKK1	P32490	508 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	SSO1	P32867	290 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	PPZ2	P33329	710 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YKL063C	P35725	167 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	ATG7	P38862	630 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	ERG28	P40030	148 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	SLM1	P40485	686 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YGR067C	P53243	804 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	SLI1	P53304	468 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	CAF40	P53829	373 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	NUP100	Q02629	959 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	ODC1	Q03028	310 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	VBA1	Q04301	562 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	DIC1	Q06143	298 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	VPS74	Q06385	345 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	THI20	Q08224	551 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	DSE3	Q08729	430 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YPQ1	Q12010	308 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	RKM5	Q12367	367 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	MYO1	P08964	1928 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	CBF1	P17106	351 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	SNF6	P18888	332 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	HCM1	P25364	564 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	IES6	P32617	166 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	ZRT1	P32804	376 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	MRPL6	P32904	214 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	AST1	P35183	429 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YCR041W	P37265	110 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	MIC12	P38341	106 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	FRT2	P39734	528 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	PCL6	P40038	420 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	SIM1	P40472	476 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	IDP2	P41939	412 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YJL043W	P47053	257 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	TIS11	P47977	285 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YPT11	P48559	417 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	STB4	P50104	949 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	FRE4	P53746	719 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YPL080C	Q02826	108 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	OST6	Q03723	332 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	RIM13	Q03792	727 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	TMN2	Q04562	672 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	CSM3	Q04659	317 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	FAR8	Q05040	523 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	BSP1	Q06604	576 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	ASR1	Q06834	288 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YET3	Q07451	203 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	NCA2	Q12374	616 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	TAO3	P40468	2376 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	RPN13	O13563	156 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	QCR7	P00128	127 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	HTB2	P02294	131 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79

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