RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C RBG1P39729 369 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C VPS52P39904 641 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YJL068CP40363 299 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C UTP25P40498 721 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RTS2P40962 232 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ALB1P47019 175 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ILM1P47155 203 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPS12P48589 143 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TOM22P49334 152 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ATP22P50273 684 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YGR016WP53209 190 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YNR068CP53754 272 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C IGO1P53897 168 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YNL095CP53932 642 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CTL1Q03220 320 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PFA5Q03289 374 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PEX12Q04370 399 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YKU80Q04437 629 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ATG38Q05789 226 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YEH1Q07804 573 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C THP1Q08231 455 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C FDH1Q08911 376 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GLE1Q12315 538 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C WTM1Q12363 437 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YDL199CQ12407 687 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MHF2Q3E829 80 aa2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C BEM2P39960 2167 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C UTP20P35194 2493 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RAD7P06779 565 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C HOM3P10869 527 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ZWF1P11412 505 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YAK1P14680 807 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GLK1P17709 500 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C URA4P20051 364 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C DBP3P20447 523 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MCK1P21965 375 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C CLB3P24870 427 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C CTR86P25355 563 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C STP22P25604 385 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YIM1P28625 365 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C NTG1P31378 399 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PTR2P32901 601 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C LHP1P33399 275 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C NUF2P33895 451 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TUL1P36096 758 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C VPS51P36116 164 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RIB1P38066 345 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YBR241CP38142 488 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C FES1P38260 290 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ICE2P40499 491 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C FMP33P46998 180 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C APS3P47064 194 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C AAD10P47182 288 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RMR1P53060 241 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C DSL1P53847 754 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SPR6Q01684 191 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PEX25Q02969 394 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RAD30Q04049 632 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C KRE28Q04431 385 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ARP10Q04549 284 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C VID22Q05934 901 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SPO77Q06134 477 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YPR172WQ06608 200 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YPR091CQ06833 770 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RRT8Q08219 342 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C DCI1Q08558 271 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOR365CQ08844 703 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SFM1Q12314 213 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PSY3Q12318 242 aa2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TIM9O74700 87 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GPH1P06738 902 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YML003WP0CF16 290 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SNF4P12904 322 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C AAC3P18238 307 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GPI12P23797 304 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GRR1P24814 1151 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C CLB4P24871 460 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RER1P25560 188 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PMT2P31382 759 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C APE2P32454 952 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GDH2P33327 1092 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C AST1P35183 429 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TEF4P36008 412 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOR062CP36025 268 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SPC34P36131 295 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C IFA38P38286 347 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C BIG1P38813 335 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MTC6P38849 526 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MPM1P40364 252 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C CUP9P41817 306 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YGR201CP42936 225 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C IKS1P47042 667 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
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