RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SWD1	P39706	426 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YRB2	P40517	327 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
CPR4	YCR069W	YFL015C	P43578	164 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	IRC5	P43610	853 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	MDV1	P47025	714 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	HMS2	P47175	358 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	NRM1	P53718	249 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	MSC1	Q03104	513 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RSM10	Q03201	203 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	NAT4	Q04751	285 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RNH202	Q05635	350 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	NFI1	Q12216	726 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SKS1	Q12505	502 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	REP1	P03871	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RHB1	P25378	209 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ITR2	P30606	609 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YME2	P32843	850 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	GPX1	P36014	167 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YPT10	P38146	199 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	FES1	P38260	290 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RPS27B	P38711	82 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	IPT1	P38954	527 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ALP1	P38971	573 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YJL193W	P39542	402 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YEL068C	P39977	110 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RRG9	P40156	214 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SMK1	P41808	388 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	COS10	P52924	374 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	LCL3	P53153	274 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	PEF1	P53238	335 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YGR266W	P53326	701 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YNL181W	P53878	407 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ASI1	P54074	624 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RSN1	Q03516	953 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RCF1	Q03713	159 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SMP3	Q04174	516 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SYO1	Q07395	620 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	TPO4	Q12256	659 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	HER1	Q12276	1246 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	COX1	P00401	534 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SNC1	P31109	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	DAL3	P32459	195 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SUR1	P33300	382 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	TUL1	P36096	758 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YBR138C	P38277	524 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	APD1	P38281	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YER184C	P39961	794 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	KRE29	P40026	464 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	COG3	P40094	801 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	POP1	P41812	875 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SWP82	P43554	623 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YGL235W	P53071	178 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	MNT4	P53745	580 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	HOT1	Q03213	719 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YMD8	Q03697	442 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	GAL83	Q04739	417 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	FMP42	Q04991	504 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	PSF1	Q12488	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	TIM9	O74700	87 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PHO80	P20052	293 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YCR006C	P25350	157 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75

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