RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FPR4	YLR449W	ALG3	P38179	458 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	CIN1	P40987	1014 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	YGR067C	P53243	804 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	SNO4	Q04902	237 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	YLR456W	Q06199	204 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	HSP32	Q08992	237 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	SET6	Q12529	373 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	FPS1	P23900	669 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	PMT2	P31382	759 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	TRS65	P32893	560 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	GPX1	P36014	167 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	RCN1	P36054	211 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	YKL071W	P36086	256 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	CCZ1	P38273	704 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	RPP1	P38786	293 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	SKN7	P38889	622 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.86	□□□□□ -0.51	not detected
FPR4	YLR449W	MRH4	P53166	561 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	IMO32	P53219	342 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	YLR460C	P54007	376 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	TDA1	Q03533	586 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	TPP1	Q03796	238 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	FRE6	Q12473	712 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	CAN1	P04817	590 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	SIR2	P06700	562 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	HO	P09932	586 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	HOM3	P10869	527 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	SAC7	P17121	654 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	MSN4	P33749	630 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	NSG1	P38837	291 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	FMC1	P40491	155 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	PAU12	P53343	120 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	RSM28	Q03430	361 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	GPN3	Q06543	272 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	YOL036W	Q08206	761 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	AVO1	Q08236	1176 aa		11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	FLP1	P03870	423 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	CAP2	P13517	287 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	YPK2	P18961	677 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	MDL1	P33310	695 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	HXT9	P40885	567 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	MDV1	P47025	714 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	TRM9	P49957	279 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	BUD9	P53226	547 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	YNR062C	P53748	327 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	HXT11	P54862	567 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	PFA5	Q03289	374 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	PEX27	Q08580	376 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	GUP2	Q08929	609 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	YDL109C	Q12103	647 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	MCP1	Q12106	302 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	NPC2	Q12408	173 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FPR4	YLR449W	CYT1	P07143	309 aa		11.83	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	YCL002C	P25565	263 aa		11.83	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	LST4	P34239	828 aa		11.83	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	DTR1	P38125	572 aa		11.83	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	LCL3	P53153	274 aa		11.83	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	RRN9	P53437	365 aa		11.83	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	NRM1	P53718	249 aa		11.83	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	DOA4	P32571	926 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	THI2	P38141	450 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	PAU24	P38155	120 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	MAL32	P38158	584 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	MLH1	P38920	769 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	RTT105	P40063	208 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	YIL165C	P40446	119 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	SHR5	P41912	237 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	SPG5	P42933	373 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	ATG18	P43601	500 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	TPN1	P53099	579 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	MAL12	P53341	584 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	MRPL1	Q04599	285 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	YOS9	Q99220	542 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	COX9	P07255	59 aa		11.81	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	NUP1	P20676	1076 aa		11.81	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	VPS17	P32913	551 aa		11.81	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	LEM3	P42838	414 aa		11.81	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	IRC18	P47056	224 aa		11.81	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	ASK10	P48361	1146 aa		11.81	□□□□□ -0.52
FPR4	YLR449W	MSS11	Q03825	758 aa		11.81	□□□□□ -0.52

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