RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	ICE2	P40499	491 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	FET5	P43561	622 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YGL235W	P53071	178 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PAU12	P53343	120 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	SUN4	P53616	420 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	AI1	P03875	834 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	JEN1	P36035	616 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	CCZ1	P38273	704 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	SYG1	P40528	902 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HIS6	P40545	261 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MSS11	Q03825	758 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YPR127W	Q06494	345 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	DFG16	Q99234	619 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	QCR7	P00128	127 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	KIN28	P06242	306 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PET122	P10355	254 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	STE12	P13574	688 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PBN1	P25580	416 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	TIM12	P32830	109 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	THI2	P38141	450 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HPA3	P39979	161 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PMT5	P52867	743 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YGR012W	P53206	393 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	STP3	Q05937	343 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YLR030W	Q07967	263 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	FRE6	Q12473	712 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	CAN1	P04817	590 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HMG1	P12683	1054 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HAP4	P14064	554 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HCM1	P25364	564 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YCL002C	P25565	263 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	ERG9	P29704	444 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	DOA4	P32571	926 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YBR242W	P38331	238 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MLH1	P38920	769 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PPT1	P53043	513 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YNR062C	P53748	327 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MFB1	Q04922	465 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PHO92	Q06390	306 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	TPO3	Q06451	622 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PSF1	Q12488	208 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	GCN4	P03069	281 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	STF2	P16965	84 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	VPS17	P32913	551 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PPQ1	P32945	549 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PHO90	P39535	881 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	SFH5	P47008	294 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	VOA1	P53262	265 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MRPL50	P53724	139 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	BNA5	Q05979	453 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MRPL35	Q06678	367 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PET54	P10834	293 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	ATG22	P25568	528 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	IMG1	P25626	169 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MTH1	P35198	433 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MAL32	P38158	584 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	IFA38	P38286	347 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.54	□□□□□ -1.2	not detected
GGA2	YHR108W	PZF1	P39933	429 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PAM16	P42949	149 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	RPE1	P46969	238 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MNN5	P46982	586 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MAL12	P53341	584 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PLB2	Q03674	706 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	AIM36	Q03798	255 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	FLP1	P03870	423 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	BAR1	P12630	587 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YPK2	P18961	677 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	GPI12	P23797	304 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	ITR1	P30605	584 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	RNP1	P32385	249 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	DCG1	P32460	244 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	KRE6	P32486	720 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	NIC96	P34077	839 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	RPS27B	P38711	82 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	SKN7	P38889	622 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PMT6	P42934	759 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	NCE101	Q02820	53 aa		7.53	□□□□□ -1.2

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