RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W HSP150P32478 413 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W MDL1P33310 695 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SKN7P38889 622 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data8.07□□□□□ -1.12not detected
DDI1YER143W GDI1P39958 451 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W AIM10P39965 576 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YIL166CP40445 542 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W CUP9P41817 306 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SSY5P47002 699 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W PMT3P47190 753 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SHE4P51534 789 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W BUD17P53727 317 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W RHO5P53879 331 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YPQ2Q06328 317 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W CYK3Q07533 885 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W RBD2Q12270 262 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W HSP42Q12329 375 aa8.07□□□□□ -1.12
DDI1YER143W CYT1P07143 309 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W HAP4P14064 554 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SNC1P31109 117 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W RPS20P38701 121 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W MDM31P38880 579 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W HXT9P40885 567 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W LEM3P42838 414 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W VPS73P53142 486 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YNR062CP53748 327 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W PGA1P53896 198 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W HXT11P54862 567 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W MAK3Q03503 176 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W DML1Q03652 475 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W EKI1Q03764 534 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YPS7Q06325 596 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YOR389WQ08912 624 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YOS9Q99220 542 aa8.06□□□□□ -1.12
DDI1YER143W ARF1P11076 181 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W NCP1P16603 691 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W HSP30P25619 332 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YEF1P32622 495 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SUR1P33300 382 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W JEN1P36035 616 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W MRPL16P38064 232 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W MTC4P38335 694 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W PCL6P40038 420 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W DDI1P40087 428 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W CIN1P40987 1014 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W IDS2P46958 469 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SRL4Q03085 281 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W PLM2Q04383 521 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YLR173WQ06247 608 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YDL114WQ07530 308 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W ENB1Q08299 606 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W AKR2Q12013 749 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W THP3Q12049 470 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W MCP1Q12106 302 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YDL177CQ12257 170 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W IES3Q12345 250 aa8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
DDI1YER143W PHO80P20052 293 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YCL002CP25565 263 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W PRE2P30656 287 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W ARO7P32178 256 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YHR035WP38769 630 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W BUR6P40096 142 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YTA6P40328 754 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W COS10P52924 374 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W CUZ1P53899 274 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W ATG21Q02887 496 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W FIN1Q03898 291 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SNO4Q04902 237 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W DCR2Q05924 578 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W MDM30Q05930 598 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W HDA2Q06629 674 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W MDM36Q06820 579 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YOR376WQ08900 122 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W HSP32Q08992 237 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YDL109CQ12103 647 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W RLM1Q12224 676 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SET6Q12529 373 aa8.04□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YPT1P01123 206 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W PRP28P23394 588 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W TRS65P32893 560 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W NIC96P34077 839 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YKL071WP36086 256 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SHE1P38200 338 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data8.03□□□□□ -1.12not detected
DDI1YER143W MDE1P47095 244 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W GRX3Q03835 250 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SPC19Q03954 165 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W MLC2Q06580 163 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W FRE5Q08908 694 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W PCL9Q12477 304 aa8.03□□□□□ -1.12
DDI1YER143W REP1P03871 373 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W CWH43P25618 953 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MSN4P33749 630 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W SEF1P34228 1148 aa8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 225.7 ms