RNA–Protein interactions for RNA: YBL039C

URA7, Transcript of Major CTP synthase isozyme (see also URA8), yeast

Gene URA7, Length 1,740 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA7	YBL039C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	SAD1	P43589	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RPC17	P47076	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	VPS25	P47142	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	CAF40	P53829	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RTT103	Q05543	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	ASR1	Q06834	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TIM18	Q08749	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	ATP7	P30902	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	IES6	P32617	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	ECM15	P35195	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YHR035W	P38769	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	PAC2	P39937	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	DDI1	P40087	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	DSN1	P40568	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YCH1	P42937	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YFL040W	P43562	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	ABM1	P47146	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	VPS74	Q06385	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	NUP159	P40477	1460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	PEX3	P28795	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	MIC12	P38341	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	GEP4	P38812	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TAD2	P47058	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YGL082W	P53155	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	GAT3	Q07928	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RGT2	Q12300	763 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	SNF8	Q12483	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	MBR1	P23493	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	GPX2	P38143	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	MRX3	P38172	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	ERG28	P40030	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RTS2	P40962	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YPT11	P48559	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	STP1	Q00947	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YAP7	Q08182	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	MUM3	Q08750	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	IZH4	Q99393	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	CBF1	P17106	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	PTP1	P25044	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	COQ3	P27680	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	CSE1	P33307	960 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TIR2	P33890	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YKL063C	P35725	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RCK2	P38623	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YHK8	P38776	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	DIA1	P54005	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	VBA1	Q04301	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	CSM4	Q08955	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TIP41	Q12199	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	SPO14	P36126	1683 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	CAP2	P13517	287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	ADE1	P27616	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	VPS51	P36116	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	PCL6	P40038	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YIL001W	P40560	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	SFH5	P47008	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	HOC1	P47124	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TIS11	P47977	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	CPD1	P53314	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	CDC123	Q05791	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	POM33	Q12164	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	NUP170	P38181	1502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YMR31	P19955	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	MRPL6	P32904	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	PDR3	P33200	976 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	MTW1	P39731	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	VPS52	P39904	641 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	GWT1	P47026	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YNL181W	P53878	407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	CCE1	Q03702	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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