RNA–Protein interactions for RNA: YMR189W

GCV2, Transcript of P subunit of the mitochondrial glycine decarboxylase complex, yeast

Gene GCV2, Length 3,105 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCV2	YMR189W	NNF1	P47149	201 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	WHI5	Q12416	295 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	ORC6	P38826	435 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	STB3	Q12427	513 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	GDB1	Q06625	1536 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	ASF1	P32447	279 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	SEC8	P32855	1065 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	TOM20	P35180	183 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	MDJ2	P42834	146 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	OSW7	P43611	510 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	POL32	P47110	350 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	GIN4	Q12263	1142 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	PDR1	P12383	1068 aa		3.42	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	TEA1	P47988	759 aa		3.42	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	RAD59	Q12223	238 aa		3.42	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	YOL098C	Q12496	1037 aa		3.42	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	EDE1	P34216	1381 aa		3.42	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	SCJ1	P25303	377 aa		3.42	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	ATH1	P48016	1211 aa		3.42	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	SEC20	P28791	383 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	CSE4	P36012	229 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	CIT2	P08679	460 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	PEP12	P32854	288 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	YHL050C	P38721	697 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	YHR219W	P38900	624 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	IOC3	P43596	787 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	RIM21	P48565	533 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	NIS1	P53939	407 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	VPS72	Q03388	795 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	YMR196W	Q04336	1088 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	BNR1	P40450	1375 aa		3.4	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	YJU3	P28321	313 aa		3.4	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	MDG1	P53885	366 aa		3.4	□□□□□ -1.86
GCV2	YMR189W	RGR1	P19263	1082 aa		3.4	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	GTT3	P39996	337 aa		3.4	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	SVF1	Q05515	481 aa		3.4	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	GYP5	Q12344	894 aa		3.4	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	MYO4	P32492	1471 aa		3.4	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	AI4	P03878	556 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	MPH3	P0CE00	602 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	ESS1	P22696	170 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	FPK1	P53739	893 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	ECM23	Q02710	187 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	TSR4	P25040	408 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	HST2	P53686	357 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	ALD3	P54114	506 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	RAD54	P32863	898 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	YOL036W	Q08206	761 aa		3.39	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	SPP41	P38904	1435 aa		3.38	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	PDR12	Q02785	1511 aa		3.38	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	RSC30	P38781	883 aa		3.38	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	VAC8	P39968	578 aa		3.38	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	ALG12	P53730	551 aa		3.38	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	YJR107W	P47145	328 aa		3.38	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	PPG1	P32838	368 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	SIS2	P36024	562 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	PPX1	P38698	397 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	YMR074C	Q04773	145 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	MNL2	Q12205	849 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	ULS1	Q08562	1619 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	MET1	P36150	593 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	BUD6	P41697	788 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	GRX4	P32642	244 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	MMP1	Q12372	583 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	MET4	P32389	672 aa		3.36	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	KAR5	Q04746	504 aa		3.36	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	FRT1	Q99332	602 aa		3.36	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	SLI15	P38283	698 aa		3.36	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	STU1	P38198	1513 aa		3.36	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	UBX7	P38349	436 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	KIC1	P38692	1080 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	KTR7	P40504	517 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GCV2	YMR189W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87

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