RNA–Protein interactions for RNA: YKL036C

YKL036C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL036C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL036CYKL036C DSD1P53095 428 aa24.07■■□□□ 1.44
YKL036CYKL036C BUG1Q12191 341 aa24.07■■□□□ 1.44
YKL036CYKL036C PAP2P53632 584 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
YKL036CYKL036C SSA1P10591 642 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
YKL036CYKL036C RAD4P14736 754 aa24.05■■□□□ 1.44
YKL036CYKL036C HSP104P31539 908 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
YKL036CYKL036C CTF4Q01454 927 aa24.04■■□□□ 1.44
YKL036CYKL036C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
YKL036CYKL036C YBP2P53169 641 aa24.02■■□□□ 1.44
YKL036CYKL036C NUP145P49687 1317 aa23.99■■□□□ 1.43
YKL036CYKL036C TRK1P12685 1235 aa23.98■■□□□ 1.43
YKL036CYKL036C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
YKL036CYKL036C UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
YKL036CYKL036C NST1P53935 1240 aa23.95■■□□□ 1.42
YKL036CYKL036C TOS1P38288 455 aa23.89■■□□□ 1.41
YKL036CYKL036C AOS1Q06624 347 aa23.89■■□□□ 1.41
YKL036CYKL036C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
YKL036CYKL036C SAP155P43612 1002 aa23.86■■□□□ 1.41
YKL036CYKL036C HPC2Q01448 625 aa23.85■■□□□ 1.41
YKL036CYKL036C EAF6P47128 113 aa23.79■■□□□ 1.4
YKL036CYKL036C RMT2Q03305 412 aa23.79■■□□□ 1.4
YKL036CYKL036C KCC4P25389 1037 aa23.77■■□□□ 1.4
YKL036CYKL036C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
YKL036CYKL036C NTH2P35172 780 aa23.76■■□□□ 1.39
YKL036CYKL036C MSN5P52918 1224 aa23.74■■□□□ 1.39
YKL036CYKL036C NYV1Q12255 253 aa23.72■■□□□ 1.39
YKL036CYKL036C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
YKL036CYKL036C RIX7Q07844 837 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
YKL036CYKL036C RRT14P40470 206 aa23.7■■□□□ 1.38
YKL036CYKL036C ALE1Q08548 619 aa23.69■■□□□ 1.38
YKL036CYKL036C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
YKL036CYKL036C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data23.68■■□□□ 1.38not detected
YKL036CYKL036C MDG1P53885 366 aa23.68■■□□□ 1.38
YKL036CYKL036C TEA1P47988 759 aa23.67■■□□□ 1.38
YKL036CYKL036C CTT1P06115 562 aa23.65■■□□□ 1.38
YKL036CYKL036C UGA3P26370 528 aa23.62■■□□□ 1.37
YKL036CYKL036C YKL222CP35995 705 aa23.61■■□□□ 1.37
YKL036CYKL036C CTI6Q08923 506 aa23.61■■□□□ 1.37
YKL036CYKL036C PHM7Q12252 991 aa23.61■■□□□ 1.37
YKL036CYKL036C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
YKL036CYKL036C YNL050CP53952 270 aa23.59■■□□□ 1.37
YKL036CYKL036C SER1P33330 395 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
YKL036CYKL036C YER156CP40093 338 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
YKL036CYKL036C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
YKL036CYKL036C ERT1P38140 529 aa23.57■■□□□ 1.36
YKL036CYKL036C NSE3Q05541 303 aa23.57■■□□□ 1.36
YKL036CYKL036C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
YKL036CYKL036C SSP2Q08646 371 aa23.55■■□□□ 1.36
YKL036CYKL036C CWH41P53008 833 aa23.54■■□□□ 1.36
YKL036CYKL036C IOC4Q04213 475 aa23.54■■□□□ 1.36
YKL036CYKL036C LPD1P09624 499 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
YKL036CYKL036C PRD1P25375 712 aa23.51■■□□□ 1.35
YKL036CYKL036C KIN4Q01919 800 aa23.5■■□□□ 1.35
YKL036CYKL036C YGL082WP53155 381 aa23.48■■□□□ 1.35
YKL036CYKL036C RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
YKL036CYKL036C PFF1P38244 976 aa23.46■■□□□ 1.35
YKL036CYKL036C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
YKL036CYKL036C LYS2P07702 1392 aa23.43■■□□□ 1.34
YKL036CYKL036C MAM1P40065 302 aa23.42■■□□□ 1.34
YKL036CYKL036C SQS1P53866 767 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
YKL036CYKL036C SMY1P32364 656 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
YKL036CYKL036C DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
YKL036CYKL036C ARG8P18544 423 aa23.36■■□□□ 1.33
YKL036CYKL036C IRC3Q06683 689 aa23.36■■□□□ 1.33
YKL036CYKL036C BDF2Q07442 638 aa23.36■■□□□ 1.33
YKL036CYKL036C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
YKL036CYKL036C THI22Q06490 572 aa23.34■■□□□ 1.33
YKL036CYKL036C COQ4O13525 335 aa23.33■■□□□ 1.33
YKL036CYKL036C MPP10P47083 593 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
YKL036CYKL036C APL2P36000 726 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
YKL036CYKL036C ERO1Q03103 563 aa23.31■■□□□ 1.32
YKL036CYKL036C DCD1P06773 312 aa23.3■■□□□ 1.32
YKL036CYKL036C YPR204WQ08995 1032 aa23.3■■□□□ 1.32
YKL036CYKL036C YBR287WP38355 427 aa23.29■■□□□ 1.32
YKL036CYKL036C VPS64Q03944 604 aa23.28■■□□□ 1.32
YKL036CYKL036C GYP7P48365 746 aa23.27■■□□□ 1.32
YKL036CYKL036C RTT109Q07794 436 aa23.27■■□□□ 1.32
YKL036CYKL036C ZDS2P54786 942 aa23.26■■□□□ 1.31
YKL036CYKL036C PMD1P32634 1753 aa23.24■■□□□ 1.31
YKL036CYKL036C YDL144CQ07589 356 aa23.24■■□□□ 1.31
YKL036CYKL036C SIT4P20604 311 aa23.23■■□□□ 1.31
YKL036CYKL036C FPK1P53739 893 aa23.23■■□□□ 1.31
YKL036CYKL036C HAT1Q12341 374 aa23.22■■□□□ 1.31
YKL036CYKL036C YOL057WQ08225 711 aa23.21■■□□□ 1.31
YKL036CYKL036C SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
YKL036CYKL036C TOP1P04786 769 aa23.2■■□□□ 1.3
YKL036CYKL036C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
YKL036CYKL036C CAF20P12962 161 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
YKL036CYKL036C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
YKL036CYKL036C TPD3P31383 635 aa23.17■■□□□ 1.3
YKL036CYKL036C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
YKL036CYKL036C YKU70P32807 602 aa23.14■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C YLR271WQ06152 274 aa23.14■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C GRX6Q12438 231 aa23.14■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C DNM1P54861 757 aa23.13■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C UBP16Q02863 499 aa23.13■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C RPN1P38764 993 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C SHC1P39000 512 aa23.12■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C PKH1Q03407 766 aa23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms