RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W THR4P16120 514 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W SIT1P39980 628 aa5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W BNI5P53890 448 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W SEC6P32844 805 aa5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W BEM4P39011 633 aa5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W IES2P40154 320 aa5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W TPM2P40414 161 aa5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W APL6P46682 809 aa5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W ALD2P47771 506 aa5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W HUL5P53119 910 aa5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W HST2P53686 357 aa5.89□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W YNL050CP53952 270 aa5.88□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W SEC39Q12745 709 aa5.88□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W NDC80P40460 691 aa5.88□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W RIA1P53893 1110 aa5.88□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W LSO1Q3E827 93 aa5.88□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W EFB1P32471 206 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W KDX1P36005 433 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W RSC2Q06488 889 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W PEX19Q07418 342 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W MAM3Q12296 706 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W APC2Q12440 853 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W REV3P14284 1504 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W GYP7P48365 746 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W ATG26Q06321 1198 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W HSP42Q12329 375 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W CHD1P32657 1468 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W MMS22Q06164 1454 aa5.87□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W SRB8P25648 1427 aa5.86□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W NUF2P33895 451 aa5.86□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W OCA5P38738 679 aa5.86□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W TCD1P38756 429 aa5.86□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W AAD16Q02895 342 aa5.86□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W SSK2P53599 1579 aa5.86□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W MPE1P35728 441 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W EXO84P38261 753 aa5.86□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W BTN2P53286 410 aa5.85□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W YML119WQ03208 357 aa5.85□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W YOL087CQ99247 1116 aa5.85□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W MSM1P22438 575 aa5.85□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W RAD16P31244 790 aa5.85□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W UBX5Q06682 500 aa5.85□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W TOM71P38825 639 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W SEC26P41810 973 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W SAC3P46674 1301 aa5.84□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W CDC31P06704 161 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W SEC23P15303 768 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W YDR338CQ05497 695 aa5.84□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W STE5P32917 917 aa5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W TIF3P34167 436 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W PRP43P53131 767 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W NKP1Q12493 238 aa5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W RAD50P12753 1312 aa5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W PDI1P17967 522 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W MSP1P28737 362 aa5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W OLA1P38219 394 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W MPH1P40562 993 aa5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W DNM1P54861 757 aa5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W CEX1Q12453 761 aa5.83□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W ARL1P38116 183 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W EFM2P38347 419 aa5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W SHE4P51534 789 aa5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W AVO1Q08236 1176 aa5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W ATG2P53855 1592 aa5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W PCT1P13259 424 aa5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W PEX5P35056 612 aa5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YLF2P38746 405 aa5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YGL081WP53156 320 aa5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W SPO19Q03029 223 aa5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W APC5Q08683 685 aa5.82□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W CMP2P14747 604 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W SLX4Q12098 748 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YPK9Q12697 1472 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W RAD9P14737 1309 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W FAR1P21268 830 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W ELM1P32801 640 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W RPC37P36121 282 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W BFA1P47113 574 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W HEH2Q03281 663 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W OPI1P21957 404 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W RRN6P32786 894 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.3 ms