RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638160.1

CHML-205, Transcript of CHM like, Rab escort protein 2, human

TSL 3 BASIC

Gene CHML, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHML-205	ENST00000638160	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.4	■■■■■ 4.22
CHML-205	ENST00000638160	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.4	■■■■■ 4.22
CHML-205	ENST00000638160	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		41.4	■■■■■ 4.22
CHML-205	ENST00000638160	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.39	■■■■■ 4.22
CHML-205	ENST00000638160	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		41.36	■■■■■ 4.21
CHML-205	ENST00000638160	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.36	■■■■■ 4.21
CHML-205	ENST00000638160	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.35	■■■■■ 4.21
CHML-205	ENST00000638160	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.34	■■■■■ 4.21
CHML-205	ENST00000638160	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.34	■■■■■ 4.21
CHML-205	ENST00000638160	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.33	■■■■■ 4.21
CHML-205	ENST00000638160	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.29	■■■■■ 4.2
CHML-205	ENST00000638160	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	41.29	■■■■■ 4.2
CHML-205	ENST00000638160	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.28	■■■■■ 4.2
CHML-205	ENST00000638160	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.21	■■■■■ 4.19
CHML-205	ENST00000638160	PZP	P20742	1482 aa		41.21	■■■■■ 4.19
CHML-205	ENST00000638160	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	41.18	■■■■■ 4.18
CHML-205	ENST00000638160	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.16	■■■■■ 4.18
CHML-205	ENST00000638160	ABCC3	O15438	1527 aa		41.16	■■■■■ 4.18
CHML-205	ENST00000638160	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		41.15	■■■■■ 4.18
CHML-205	ENST00000638160	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		41.15	■■■■■ 4.18
CHML-205	ENST00000638160	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	41.12	■■■■■ 4.17
CHML-205	ENST00000638160	TNR	Q92752	1358 aa		41.12	■■■■■ 4.17
CHML-205	ENST00000638160	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	41.09	■■■■■ 4.17
CHML-205	ENST00000638160	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		41.07	■■■■■ 4.17
CHML-205	ENST00000638160	KANK1	Q14678	1352 aa		41.07	■■■■■ 4.16
CHML-205	ENST00000638160	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	41.07	■■■■■ 4.16
CHML-205	ENST00000638160	ROCK1	Q13464	1354 aa		41.04	■■■■■ 4.16
CHML-205	ENST00000638160	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	41.03	■■■■■ 4.16
CHML-205	ENST00000638160	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.03	■■■■■ 4.16
CHML-205	ENST00000638160	STRC	Q7RTU9	1775 aa		41.03	■■■■■ 4.16
CHML-205	ENST00000638160	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		41.02	■■■■■ 4.16
CHML-205	ENST00000638160	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	41.02	■■■■■ 4.16
CHML-205	ENST00000638160	DEPDC5	O75140	1603 aa		41.01	■■■■■ 4.16
CHML-205	ENST00000638160	ITGAE	P38570	1179 aa		41	■■■■■ 4.15
CHML-205	ENST00000638160	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		41	■■■■■ 4.15
CHML-205	ENST00000638160	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CHML-205	ENST00000638160	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.97	■■■■■ 4.15
CHML-205	ENST00000638160	CEP152	O94986	1710 aa		40.96	■■■■■ 4.15
CHML-205	ENST00000638160	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.96	■■■■■ 4.15
CHML-205	ENST00000638160	PTPRT	O14522	1441 aa		40.95	■■■■■ 4.15
CHML-205	ENST00000638160	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.94	■■■■■ 4.14
CHML-205	ENST00000638160	PKD2	Q13563	968 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CHML-205	ENST00000638160	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CHML-205	ENST00000638160	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CHML-205	ENST00000638160	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.9	■■■■■ 4.14
CHML-205	ENST00000638160	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CHML-205	ENST00000638160	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CHML-205	ENST00000638160	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.88	■■■■■ 4.13
CHML-205	ENST00000638160	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
CHML-205	ENST00000638160	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.79	■■■■■ 4.12
CHML-205	ENST00000638160	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.78	■■■■■ 4.12
CHML-205	ENST00000638160	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CHML-205	ENST00000638160	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CHML-205	ENST00000638160	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CHML-205	ENST00000638160	UNC13B	O14795	1591 aa		40.69	■■■■■ 4.11
CHML-205	ENST00000638160	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.68	■■■■■ 4.1
CHML-205	ENST00000638160	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
CHML-205	ENST00000638160	NOS1	P29475	1434 aa		40.65	■■■■■ 4.1
CHML-205	ENST00000638160	NUP155	O75694	1391 aa		40.63	■■■■■ 4.1
CHML-205	ENST00000638160	IDI1	Q13907	227 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CHML-205	ENST00000638160	TET3	O43151	1660 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CHML-205	ENST00000638160	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CHML-205	ENST00000638160	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CHML-205	ENST00000638160	NAIP	Q13075	1403 aa		40.57	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.56	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	MED14	O60244	1454 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	SYNM	O15061	1565 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
CHML-205	ENST00000638160	HFM1	A2PYH4	1435 aa		40.5	■■■■■ 4.07
CHML-205	ENST00000638160	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CHML-205	ENST00000638160	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CHML-205	ENST00000638160	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CHML-205	ENST00000638160	SLIT1	O75093	1534 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CHML-205	ENST00000638160	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CHML-205	ENST00000638160	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.45	■■■■■ 4.07
CHML-205	ENST00000638160	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
CHML-205	ENST00000638160	LTK	P29376	864 aa		40.44	■■■■■ 4.06
CHML-205	ENST00000638160	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
CHML-205	ENST00000638160		E9PCH4	1651 aa		40.41	■■■■■ 4.06
CHML-205	ENST00000638160	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CHML-205	ENST00000638160	ADGRB3	O60242	1522 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CHML-205	ENST00000638160	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CHML-205	ENST00000638160	TRIM52	Q96A61	297 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CHML-205	ENST00000638160	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
CHML-205	ENST00000638160	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	40.26	■■■■■ 4.04
CHML-205	ENST00000638160	CPS1	P31327	1500 aa		40.24	■■■■■ 4.03
CHML-205	ENST00000638160	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CHML-205	ENST00000638160	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	40.19	■■■■■ 4.02
CHML-205	ENST00000638160	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	40.17	■■■■■ 4.02
CHML-205	ENST00000638160	ZFYVE9	O95405	1425 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CHML-205	ENST00000638160	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CHML-205	ENST00000638160	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
CHML-205	ENST00000638160	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	40.13	■■■■■ 4.01
CHML-205	ENST00000638160	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		40.13	■■■■■ 4.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms