RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-215ENST00000626257 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.12■■■■□ 3.37
CCZ1B-215ENST00000626257 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.12■■■■□ 3.37
CCZ1B-215ENST00000626257 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
CCZ1B-215ENST00000626257 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
CCZ1B-215ENST00000626257 PLCH2O75038 1416 aa36.08■■■■□ 3.37
CCZ1B-215ENST00000626257 ZBED9Q6R2W3 1325 aa36.08■■■■□ 3.37
CCZ1B-215ENST00000626257 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.08■■■■□ 3.37
CCZ1B-215ENST00000626257 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.07■■■■□ 3.36
CCZ1B-215ENST00000626257 PLA2R1Q13018 1463 aa36.07■■■■□ 3.36
CCZ1B-215ENST00000626257 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.05■■■■□ 3.36
CCZ1B-215ENST00000626257 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.05■■■■□ 3.36
CCZ1B-215ENST00000626257 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.02■■■■□ 3.36
CCZ1B-215ENST00000626257 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.01■■■■□ 3.36
CCZ1B-215ENST00000626257 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
CCZ1B-215ENST00000626257 ERBINQ96RT1 1412 aa35.98■■■■□ 3.35
CCZ1B-215ENST00000626257 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.98■■■■□ 3.35
CCZ1B-215ENST00000626257 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.97■■■■□ 3.35
CCZ1B-215ENST00000626257 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
CCZ1B-215ENST00000626257 RGL3Q3MIN7 710 aa35.96■■■■□ 3.35
CCZ1B-215ENST00000626257 ABCC1P33527 1531 aa35.96■■■■□ 3.35
CCZ1B-215ENST00000626257 A2MP01023 1474 aa35.94■■■■□ 3.34
CCZ1B-215ENST00000626257 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.91■■■■□ 3.34
CCZ1B-215ENST00000626257 ATP10AO60312 1499 aa35.89■■■■□ 3.34
CCZ1B-215ENST00000626257 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.87■■■■□ 3.33
CCZ1B-215ENST00000626257 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.87■■■■□ 3.33
CCZ1B-215ENST00000626257 E9PCH4 1651 aa35.85■■■■□ 3.33
CCZ1B-215ENST00000626257 ERICH6BQ5W0A0 696 aa35.85■■■■□ 3.33
CCZ1B-215ENST00000626257 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.8■■■■□ 3.32
CCZ1B-215ENST00000626257 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
CCZ1B-215ENST00000626257 LAMC1P11047 1609 aa35.79■■■■□ 3.32
CCZ1B-215ENST00000626257 TMC1Q8TDI8 760 aa35.79■■■■□ 3.32
CCZ1B-215ENST00000626257 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
CCZ1B-215ENST00000626257 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
CCZ1B-215ENST00000626257 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
CCZ1B-215ENST00000626257 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
CCZ1B-215ENST00000626257 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.76■■■■□ 3.31
CCZ1B-215ENST00000626257 RALBP1Q15311 655 aa35.75■■■■□ 3.31
CCZ1B-215ENST00000626257 AFAP1Q8N556 730 aa35.75■■■■□ 3.31
CCZ1B-215ENST00000626257 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
CCZ1B-215ENST00000626257 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
CCZ1B-215ENST00000626257 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.73■■■■□ 3.31
CCZ1B-215ENST00000626257 PPP4R2Q9NY27 417 aa35.72■■■■□ 3.31
CCZ1B-215ENST00000626257 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CCZ1B-215ENST00000626257 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.7■■■■□ 3.31
CCZ1B-215ENST00000626257 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
CCZ1B-215ENST00000626257 TESK2Q96S53 571 aa35.68■■■■□ 3.3
CCZ1B-215ENST00000626257 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
CCZ1B-215ENST00000626257 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
CCZ1B-215ENST00000626257 MYT1Q01538 1121 aa35.65■■■■□ 3.3
CCZ1B-215ENST00000626257 NUDCQ9Y266 331 aa35.64■■■■□ 3.3
CCZ1B-215ENST00000626257 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.63■■■■□ 3.29
CCZ1B-215ENST00000626257 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.61■■■■□ 3.29
CCZ1B-215ENST00000626257 FANCAO15360 1455 aa35.61■■■■□ 3.29
CCZ1B-215ENST00000626257 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
CCZ1B-215ENST00000626257 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.61■■■■□ 3.29
CCZ1B-215ENST00000626257 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
CCZ1B-215ENST00000626257 TRPM2O94759 1503 aa35.59■■■■□ 3.29
CCZ1B-215ENST00000626257 DEPDC5O75140 1603 aa35.59■■■■□ 3.29
CCZ1B-215ENST00000626257 ATP7AQ04656 1500 aa35.57■■■■□ 3.28
CCZ1B-215ENST00000626257 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
CCZ1B-215ENST00000626257 PTPRTO14522 1441 aa35.56■■■■□ 3.28
CCZ1B-215ENST00000626257 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.55■■■■□ 3.28
CCZ1B-215ENST00000626257 NLRP13Q86W25 1043 aa35.55■■■■□ 3.28
CCZ1B-215ENST00000626257 TMF1P82094 1093 aa35.54■■■■□ 3.28
CCZ1B-215ENST00000626257 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.54■■■■□ 3.28
CCZ1B-215ENST00000626257 MADDQ8WXG6 1647 aa35.53■■■■□ 3.28
CCZ1B-215ENST00000626257 TET3O43151 1660 aa35.51■■■■□ 3.28
CCZ1B-215ENST00000626257 CEP152O94986 1710 aa35.51■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.5■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 ADGRL1O94910 1474 aa35.5■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 RNF123Q5XPI4 1314 aa35.49■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 CLTCL1P53675 1640 aa35.49■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa35.48■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.48■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.48■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 PANK3Q9H999 370 aa35.48■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 KANK1Q14678 1352 aa35.47■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 ASXL2Q76L83 1435 aa35.45■■■■□ 3.27
CCZ1B-215ENST00000626257 KIF3BO15066 747 aa35.44■■■■□ 3.26
CCZ1B-215ENST00000626257 STAC3Q96MF2 364 aa35.44■■■■□ 3.26
CCZ1B-215ENST00000626257 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.44■■■■□ 3.26
CCZ1B-215ENST00000626257 IQGAP1P46940 1657 aa35.42■■■■□ 3.26
CCZ1B-215ENST00000626257 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
CCZ1B-215ENST00000626257 OSCARQ8IYS5 282 aa35.42■■■■□ 3.26
CCZ1B-215ENST00000626257 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.36■■■■□ 3.25
CCZ1B-215ENST00000626257 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
CCZ1B-215ENST00000626257 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.3■■■■□ 3.24
CCZ1B-215ENST00000626257 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.28■■■■□ 3.24
CCZ1B-215ENST00000626257 ANP32EQ9BTT0 268 aa35.28■■■■□ 3.24
CCZ1B-215ENST00000626257 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CCZ1B-215ENST00000626257 INSRP06213 1382 aa35.25■■■■□ 3.23
CCZ1B-215ENST00000626257 CDCA8Q53HL2 280 aa35.24■■■■□ 3.23
CCZ1B-215ENST00000626257 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.24■■■■□ 3.23
CCZ1B-215ENST00000626257 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.24■■■■□ 3.23
CCZ1B-215ENST00000626257 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.23■■■■□ 3.23
CCZ1B-215ENST00000626257 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.23■■■■□ 3.23
CCZ1B-215ENST00000626257 PDE3BQ13370 1112 aa35.22■■■■□ 3.23
CCZ1B-215ENST00000626257 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.22■■■■□ 3.23
CCZ1B-215ENST00000626257 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
CCZ1B-215ENST00000626257 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms