RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF3BO15066 747 aa25■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PZPP20742 1482 aa24.98■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.98■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MBD5Q9P267 1494 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.93■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NLRP1Q9C000 1473 aa24.93■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MIA2Q96PC5 1412 aa24.93■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MED14O60244 1454 aa24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TIAM1Q13009 1591 aa24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DEPDC5O75140 1603 aa24.89■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ALKQ9UM73 1620 aa24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IQGAP1P46940 1657 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.84■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEP162Q5TB80 1403 aa24.8■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SYNMO15061 1565 aa24.8■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TSPY4P0CV99 314 aa24.78■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TSPY10P0CW01 314 aa24.78■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.77■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ERVK-7P63135 1459 aa24.69■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NCOA2Q15596 1464 aa24.69■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC3O15438 1527 aa24.68■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.66■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.65■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EID1Q9Y6B2 187 aa24.63■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LTKP29376 864 aa24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.6■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POTEAQ6S8J7 498 aa24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLIT1O75093 1534 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEP152O94986 1710 aa24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM94Q12767 1356 aa24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCNA6P17658 529 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.45■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.53e-7■■■□□ 14.6
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIK3C2BO00750 1634 aa24.43■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.42■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MSH6P52701 1360 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KANK1Q14678 1352 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BCANQ96GW7 911 aa24.4■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF15Q9NS87 1388 aa24.4■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAP3K1Q13233 1512 aa24.4■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.4■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 JCADQ9P266 1359 aa24.39■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ERBINQ96RT1 1412 aa24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IDI1Q13907 227 aa24.36■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLAIN2Q9P270 581 aa24.36■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PHLPP1O60346 1717 aa24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TET3O43151 1660 aa24.33■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NWD1Q149M9 1564 aa24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.483e-7■□□□□ 10.1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRIM52Q96A61 297 aa24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADGRB3O60242 1522 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C14orf37Q86TY3 774 aa24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms