RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 DDRGK1Q96HY6 314 aa13.16□□□□□ -0.3
HCG18-242ENST00000602319 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
HCG18-242ENST00000602319 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
HCG18-242ENST00000602319 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
HCG18-242ENST00000602319 TMC1Q8TDI8 760 aa13.15□□□□□ -0.3
HCG18-242ENST00000602319 KDM2BQ8NHM5 1336 aa13.15□□□□□ -0.3
HCG18-242ENST00000602319 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.14□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.13□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.13□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.12□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 GSE1Q14687 1217 aa13.12□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa13.11□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.11□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 NLRP13Q86W25 1043 aa13.1□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 UNC13BO14795 1591 aa13.1□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.09□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.09□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.09□□□□□ -0.31
HCG18-242ENST00000602319 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 NFKBIBQ15653 356 aa13.08□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 SYNJ2O15056 1496 aa13.06□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 PKD2Q13563 968 aa13.06□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 ABCA8O94911 1581 aa13.05□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.05□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 IQGAP1P46940 1657 aa13.04□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.04□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.04□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 C8orf34Q49A92 452 aa13.04□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.04□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 PLXNC1O60486 1568 aa13.03□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 CRBNQ96SW2 442 aa13.03□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 ABCC2Q92887 1545 aa13.03□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.03□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.03□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.03□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
HCG18-242ENST00000602319 NUP160Q12769 1436 aa13.02□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 ZNF521Q96K83 1311 aa13.01□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.01□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 MYOM1P52179 1685 aa13.01□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 FAM43AQ8N2R8 423 aa13.01□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.01□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 SYNMO15061 1565 aa13.01□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 A2MP01023 1474 aa13□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 GRIN2AQ12879 1464 aa13□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 NLRP1Q9C000 1473 aa13□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 FAM161AQ3B820 660 aa13□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 PREX2Q70Z35 1606 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 ATP10AO60312 1499 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 MAGI2Q86UL8 1455 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 NUP155O75694 1391 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 PLA2R1Q13018 1463 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 IFT140Q96RY7 1462 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 DISP3Q9P2K9 1392 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 ERBINQ96RT1 1412 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 WDR7Q9Y4E6 1490 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 CCDC144AA2RUR9 1427 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-242ENST00000602319 PLIN1O60240 522 aa12.96□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 TESK2Q96S53 571 aa12.96□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.96□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 MADDQ8WXG6 1647 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 ZMYM3Q14202 1370 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 SKAP1Q86WV1 359 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.94□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 PIK3C2GO75747 1445 aa12.94□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 USP19O94966 1318 aa12.94□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa12.94□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa12.92□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 DCAF11Q8TEB1 546 aa12.91□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa12.91□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 CEP152O94986 1710 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 SHROOM2Q13796 1616 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 DUOX2Q9NRD8 1548 aa12.9□□□□□ -0.34
HCG18-242ENST00000602319 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.35
HCG18-242ENST00000602319 SLC4A3P48751 1232 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms