RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602111.5

FCHO1-236, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-236ENST00000602111 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.93■■□□□ 1.26
FCHO1-236ENST00000602111 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.269e-6■□□□□ 9.6
FCHO1-236ENST00000602111 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FCHO1-236ENST00000602111 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
FCHO1-236ENST00000602111 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.89■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.89■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 PZPP20742 1482 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 IQGAP1P46940 1657 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.84■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.83■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 DEPDC5O75140 1603 aa22.83■■□□□ 1.25
FCHO1-236ENST00000602111 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.82■■□□□ 1.24
FCHO1-236ENST00000602111 SYNMO15061 1565 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-236ENST00000602111 MED14O60244 1454 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-236ENST00000602111 KIF3BO15066 747 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-236ENST00000602111 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
FCHO1-236ENST00000602111 NLRP1Q9C000 1473 aa22.79■■□□□ 1.24
FCHO1-236ENST00000602111 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
FCHO1-236ENST00000602111 MIA2Q96PC5 1412 aa22.77■■□□□ 1.24
FCHO1-236ENST00000602111 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.77■■□□□ 1.24
FCHO1-236ENST00000602111 TIAM1Q13009 1591 aa22.76■■□□□ 1.23
FCHO1-236ENST00000602111 MBD5Q9P267 1494 aa22.76■■□□□ 1.23
FCHO1-236ENST00000602111 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.75■■□□□ 1.23
FCHO1-236ENST00000602111 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.74■■□□□ 1.23
FCHO1-236ENST00000602111 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-236ENST00000602111 POTEAQ6S8J7 498 aa22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-236ENST00000602111 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-236ENST00000602111 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-236ENST00000602111 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-236ENST00000602111 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-236ENST00000602111 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-236ENST00000602111 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-236ENST00000602111 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-236ENST00000602111 ABCC3O15438 1527 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-236ENST00000602111 ERVK-7P63135 1459 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-236ENST00000602111 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-236ENST00000602111 CEP162Q5TB80 1403 aa22.56■■□□□ 1.2
FCHO1-236ENST00000602111 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
FCHO1-236ENST00000602111 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.55■■□□□ 1.2
FCHO1-236ENST00000602111 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.55■■□□□ 1.2
FCHO1-236ENST00000602111 NCOA2Q15596 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
FCHO1-236ENST00000602111 CEP152O94986 1710 aa22.54■■□□□ 1.2
FCHO1-236ENST00000602111 LTKP29376 864 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-236ENST00000602111 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-236ENST00000602111 TMEM94Q12767 1356 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-236ENST00000602111 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-236ENST00000602111 SLIT1O75093 1534 aa22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-236ENST00000602111 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-236ENST00000602111 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-236ENST00000602111 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-236ENST00000602111 TSPY4P0CV99 314 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-236ENST00000602111 TSPY10P0CW01 314 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-236ENST00000602111 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-236ENST00000602111 MAP3K1Q13233 1512 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-236ENST00000602111 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-236ENST00000602111 EID1Q9Y6B2 187 aa22.44■■□□□ 1.18
FCHO1-236ENST00000602111 PHLPP1O60346 1717 aa22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-236ENST00000602111 PIK3C2BO00750 1634 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-236ENST00000602111 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-236ENST00000602111 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-236ENST00000602111 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.39■■□□□ 1.18
FCHO1-236ENST00000602111 TRIM52Q96A61 297 aa22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-236ENST00000602111 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-236ENST00000602111 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-236ENST00000602111 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-236ENST00000602111 JCADQ9P266 1359 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-236ENST00000602111 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.36■■□□□ 1.17
FCHO1-236ENST00000602111 KCNA6P17658 529 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-236ENST00000602111 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-236ENST00000602111 LRP6O75581 1613 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-236ENST00000602111 MSH6P52701 1360 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-236ENST00000602111 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-236ENST00000602111 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-236ENST00000602111 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-236ENST00000602111 NWD1Q149M9 1564 aa22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-236ENST00000602111 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-236ENST00000602111 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.31■■□□□ 1.16
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FCHO1-236ENST00000602111 SLAIN2Q9P270 581 aa22.29■■□□□ 1.16
FCHO1-236ENST00000602111 TET3O43151 1660 aa22.29■■□□□ 1.16
FCHO1-236ENST00000602111 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
FCHO1-236ENST00000602111 BCANQ96GW7 911 aa22.27■■□□□ 1.16
FCHO1-236ENST00000602111 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
FCHO1-236ENST00000602111 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-236ENST00000602111 KIF15Q9NS87 1388 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-236ENST00000602111 IDI1Q13907 227 aa22.22■■□□□ 1.15
FCHO1-236ENST00000602111 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.22■■□□□ 1.15
FCHO1-236ENST00000602111 ADGRB3O60242 1522 aa22.21■■□□□ 1.15
FCHO1-236ENST00000602111 RXRBP28702 533 aa22.19■■□□□ 1.14
FCHO1-236ENST00000602111 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.19■■□□□ 1.14
FCHO1-236ENST00000602111 ERBINQ96RT1 1412 aa22.19■■□□□ 1.14
FCHO1-236ENST00000602111 SHPRHQ149N8 1683 aa22.18■■□□□ 1.14
FCHO1-236ENST00000602111 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.18■■□□□ 1.14
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