RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589661.2

AC005559.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC005559.1, Length 871 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005559.1-201ENST00000589661 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
AC005559.1-201ENST00000589661 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.33■■■■■ 4.21
AC005559.1-201ENST00000589661 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.3■■■■■ 4.2
AC005559.1-201ENST00000589661 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
AC005559.1-201ENST00000589661 KIF15Q9NS87 1388 aa41.29■■■■■ 4.2
AC005559.1-201ENST00000589661 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.28■■■■■ 4.2
AC005559.1-201ENST00000589661 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.27■■■■■ 4.2
AC005559.1-201ENST00000589661 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
AC005559.1-201ENST00000589661 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.24■■■■■ 4.19
AC005559.1-201ENST00000589661 PTPRKQ15262 1439 aa41.24■■■■■ 4.19
AC005559.1-201ENST00000589661 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.23■■■■■ 4.19
AC005559.1-201ENST00000589661 ERBINQ96RT1 1412 aa41.19■■■■■ 4.18
AC005559.1-201ENST00000589661 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
AC005559.1-201ENST00000589661 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.15■■■■■ 4.18
AC005559.1-201ENST00000589661 NCOA1Q15788 1441 aa41.13■■■■■ 4.17
AC005559.1-201ENST00000589661 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.13■■■■■ 4.17
AC005559.1-201ENST00000589661 PZPP20742 1482 aa41.13■■■■■ 4.17
AC005559.1-201ENST00000589661 ADGRL2O95490 1459 aa41.11■■■■■ 4.17
AC005559.1-201ENST00000589661 ABCC3O15438 1527 aa41.11■■■■■ 4.17
AC005559.1-201ENST00000589661 STRCQ7RTU9 1775 aa41.09■■■■■ 4.17
AC005559.1-201ENST00000589661 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
AC005559.1-201ENST00000589661 CEP152O94986 1710 aa41.07■■■■■ 4.17
AC005559.1-201ENST00000589661 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
AC005559.1-201ENST00000589661 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
AC005559.1-201ENST00000589661 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
AC005559.1-201ENST00000589661 DEPDC5O75140 1603 aa41.03■■■■■ 4.16
AC005559.1-201ENST00000589661 TNRQ92752 1358 aa41.02■■■■■ 4.16
AC005559.1-201ENST00000589661 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41■■■■■ 4.15
AC005559.1-201ENST00000589661 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41■■■■■ 4.15
AC005559.1-201ENST00000589661 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.99■■■■■ 4.15
AC005559.1-201ENST00000589661 KANK1Q14678 1352 aa40.97■■■■■ 4.15
AC005559.1-201ENST00000589661 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.96■■■■■ 4.15
AC005559.1-201ENST00000589661 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.96■■■■■ 4.15
AC005559.1-201ENST00000589661 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
AC005559.1-201ENST00000589661 ITGAEP38570 1179 aa40.91■■■■■ 4.14
AC005559.1-201ENST00000589661 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.91■■■■■ 4.14
AC005559.1-201ENST00000589661 ROCK1Q13464 1354 aa40.87■■■■■ 4.13
AC005559.1-201ENST00000589661 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.87■■■■■ 4.13
AC005559.1-201ENST00000589661 ERVK-7P63135 1459 aa40.86■■■■■ 4.13
AC005559.1-201ENST00000589661 NLRP1Q9C000 1473 aa40.86■■■■■ 4.13
AC005559.1-201ENST00000589661 PLA2R1Q13018 1463 aa40.85■■■■■ 4.13
AC005559.1-201ENST00000589661 PTPRTO14522 1441 aa40.84■■■■■ 4.13
AC005559.1-201ENST00000589661 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.84■■■■■ 4.13
AC005559.1-201ENST00000589661 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
AC005559.1-201ENST00000589661 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.82■■■■■ 4.12
AC005559.1-201ENST00000589661 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.79■■■■■ 4.12
AC005559.1-201ENST00000589661 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.79■■■■■ 4.12
AC005559.1-201ENST00000589661 PKD2Q13563 968 aa40.77■■■■■ 4.12
AC005559.1-201ENST00000589661 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.76■■■■■ 4.12
AC005559.1-201ENST00000589661 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
AC005559.1-201ENST00000589661 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
AC005559.1-201ENST00000589661 UNC13BO14795 1591 aa40.69■■■■■ 4.11
AC005559.1-201ENST00000589661 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.69■■■■■ 4.1
AC005559.1-201ENST00000589661 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
AC005559.1-201ENST00000589661 TET3O43151 1660 aa40.62■■■■■ 4.09
AC005559.1-201ENST00000589661 CERKQ8TCT0 537 aa40.62■■■■■ 4.09
AC005559.1-201ENST00000589661 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.61■■■■■ 4.09
AC005559.1-201ENST00000589661 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.6■■■■■ 4.09
AC005559.1-201ENST00000589661 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.59■■■■■ 4.09
AC005559.1-201ENST00000589661 FBXO41Q8TF61 875 aa40.58■■■■■ 4.09
AC005559.1-201ENST00000589661 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
AC005559.1-201ENST00000589661 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.55■■■■■ 4.08
AC005559.1-201ENST00000589661 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.54■■■■■ 4.08
AC005559.1-201ENST00000589661 PIK3C2BO00750 1634 aa40.53■■■■■ 4.08
AC005559.1-201ENST00000589661 SYNMO15061 1565 aa40.52■■■■■ 4.08
AC005559.1-201ENST00000589661 NOS1P29475 1434 aa40.51■■■■■ 4.08
AC005559.1-201ENST00000589661 NUP155O75694 1391 aa40.5■■■■■ 4.07
AC005559.1-201ENST00000589661 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.49■■■■■ 4.07
AC005559.1-201ENST00000589661 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.48■■■■■ 4.07
AC005559.1-201ENST00000589661 IDI1Q13907 227 aa40.45■■■■■ 4.07
AC005559.1-201ENST00000589661 E9PCH4 1651 aa40.45■■■■■ 4.07
AC005559.1-201ENST00000589661 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
AC005559.1-201ENST00000589661 MED14O60244 1454 aa40.44■■■■■ 4.06
AC005559.1-201ENST00000589661 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
AC005559.1-201ENST00000589661 NAIPQ13075 1403 aa40.43■■■■■ 4.06
AC005559.1-201ENST00000589661 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.43■■■■■ 4.06
AC005559.1-201ENST00000589661 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
AC005559.1-201ENST00000589661 IQGAP1P46940 1657 aa40.41■■■■■ 4.06
AC005559.1-201ENST00000589661 SLIT1O75093 1534 aa40.4■■■■■ 4.06
AC005559.1-201ENST00000589661 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.38■■■■■ 4.05
AC005559.1-201ENST00000589661 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
AC005559.1-201ENST00000589661 HFM1A2PYH4 1435 aa40.35■■■■■ 4.05
AC005559.1-201ENST00000589661 ADGRB3O60242 1522 aa40.35■■■■■ 4.05
AC005559.1-201ENST00000589661 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.34■■■■■ 4.05
AC005559.1-201ENST00000589661 EID1Q9Y6B2 187 aa40.34■■■■■ 4.05
AC005559.1-201ENST00000589661 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.32■■■■■ 4.04
AC005559.1-201ENST00000589661 LTKP29376 864 aa40.29■■■■■ 4.04
AC005559.1-201ENST00000589661 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.28■■■■■ 4.04
AC005559.1-201ENST00000589661 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.26■■■■■ 4.03
AC005559.1-201ENST00000589661 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.2■■■■■ 4.03
AC005559.1-201ENST00000589661 TRIM52Q96A61 297 aa40.2■■■■■ 4.03
AC005559.1-201ENST00000589661 CPS1P31327 1500 aa40.2■■■■■ 4.03
AC005559.1-201ENST00000589661 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.2■■■■■ 4.03
AC005559.1-201ENST00000589661 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
AC005559.1-201ENST00000589661 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
AC005559.1-201ENST00000589661 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.07■■■■■ 4.01
AC005559.1-201ENST00000589661 ZFYVE9O95405 1425 aa40.07■■■■■ 4
AC005559.1-201ENST00000589661 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.07■■■■■ 4
AC005559.1-201ENST00000589661 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
AC005559.1-201ENST00000589661 BCANQ96GW7 911 aa40.04■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms