RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-209ENST00000587957 HSPA2P54652 639 aa16.73■□□□□ 0.27
EFTUD2-209ENST00000587957 C3P01024 1663 aa16.72■□□□□ 0.27
EFTUD2-209ENST00000587957 PLXNC1O60486 1568 aa16.72■□□□□ 0.27
EFTUD2-209ENST00000587957 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.71■□□□□ 0.27
EFTUD2-209ENST00000587957 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.7■□□□□ 0.26
EFTUD2-209ENST00000587957 GGT6Q6P531 493 aa16.69■□□□□ 0.26
EFTUD2-209ENST00000587957 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
EFTUD2-209ENST00000587957 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-209ENST00000587957 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.67■□□□□ 0.26
EFTUD2-209ENST00000587957 TSPY4P0CV99 314 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-209ENST00000587957 TSPY10P0CW01 314 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-209ENST00000587957 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.66■□□□□ 0.26
EFTUD2-209ENST00000587957 POLA2Q14181 598 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 MROH2AA6NES4 1674 aa16.64■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 MIA2Q96PC5 1412 aa16.63■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.63■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.63■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF3BO15066 747 aa16.62■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 ZBTB22O15209 634 aa16.61■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 ZMYM3Q14202 1370 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 POTEHQ6S545 545 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
EFTUD2-209ENST00000587957 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-209ENST00000587957 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.55■□□□□ 0.24
EFTUD2-209ENST00000587957 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.55■□□□□ 0.24
EFTUD2-209ENST00000587957 NPATQ14207 1427 aa16.54■□□□□ 0.24
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
EFTUD2-209ENST00000587957 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
EFTUD2-209ENST00000587957 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.53■□□□□ 0.24
EFTUD2-209ENST00000587957 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCC5O15440 1437 aa16.53■□□□□ 0.24
EFTUD2-209ENST00000587957 DAPK1P53355 1430 aa16.53■□□□□ 0.24
EFTUD2-209ENST00000587957 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.52■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPRKQ15262 1439 aa16.52■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF15Q9NS87 1388 aa16.51■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.51■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.51■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 STRCQ7RTU9 1775 aa16.51■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16.5■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.49■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.49■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP152O94986 1710 aa16.48■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 PZPP20742 1482 aa16.47■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 TNRQ92752 1358 aa16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCC3O15438 1527 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 NCOA1Q15788 1441 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 ERBINQ96RT1 1412 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 ITGAEP38570 1179 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXO41Q8TF61 875 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 KANK1Q14678 1352 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPRTO14522 1441 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 DEPDC5O75140 1603 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 ADGRL2O95490 1459 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 ERVK-7P63135 1459 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 PLA2R1Q13018 1463 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 CERKQ8TCT0 537 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 NLRP1Q9C000 1473 aa16.35■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.35■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.35■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 PKD2Q13563 968 aa16.34■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
EFTUD2-209ENST00000587957 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.33■□□□□ 0.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-209ENST00000587957 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-209ENST00000587957 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-209ENST00000587957 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-209ENST00000587957 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-209ENST00000587957 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-209ENST00000587957 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.27■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 PIK3C2BO00750 1634 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 UNC13BO14795 1591 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 ROCK1Q13464 1354 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 IQGAP1P46940 1657 aa16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms