RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-223ENST00000577256 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.13■■□□□ 1.93
ATG13-223ENST00000577256 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.11■■□□□ 1.93
ATG13-223ENST00000577256 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
ATG13-223ENST00000577256 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.09■■□□□ 1.93
ATG13-223ENST00000577256 NPATQ14207 1427 aa27.08■■□□□ 1.93
ATG13-223ENST00000577256 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.08■■□□□ 1.93
ATG13-223ENST00000577256 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.08■■□□□ 1.93
ATG13-223ENST00000577256 ERBINQ96RT1 1412 aa27.07■■□□□ 1.92
ATG13-223ENST00000577256 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.07■■□□□ 1.92
ATG13-223ENST00000577256 ADGRL2O95490 1459 aa27.06■■□□□ 1.92
ATG13-223ENST00000577256 NCOA1Q15788 1441 aa27.06■■□□□ 1.92
ATG13-223ENST00000577256 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.05■■□□□ 1.92
ATG13-223ENST00000577256 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
ATG13-223ENST00000577256 PTPRKQ15262 1439 aa27.01■■□□□ 1.91
ATG13-223ENST00000577256 HSPA2P54652 639 aa27■■□□□ 1.91
ATG13-223ENST00000577256 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
ATG13-223ENST00000577256 MROH1Q8NDA8 1641 aa27■■□□□ 1.91
ATG13-223ENST00000577256 ABCC3O15438 1527 aa26.97■■□□□ 1.91
ATG13-223ENST00000577256 PZPP20742 1482 aa26.97■■□□□ 1.91
ATG13-223ENST00000577256 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
ATG13-223ENST00000577256 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
ATG13-223ENST00000577256 DEPDC5O75140 1603 aa26.94■■□□□ 1.9
ATG13-223ENST00000577256 ROCK1Q13464 1354 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG13-223ENST00000577256 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.91■■□□□ 1.9
ATG13-223ENST00000577256 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.91■■□□□ 1.9
ATG13-223ENST00000577256 CEP152O94986 1710 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG13-223ENST00000577256 KANK1Q14678 1352 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG13-223ENST00000577256 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
ATG13-223ENST00000577256 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.88■■□□□ 1.89
ATG13-223ENST00000577256 ITGAEP38570 1179 aa26.88■■□□□ 1.89
ATG13-223ENST00000577256 TNRQ92752 1358 aa26.87■■□□□ 1.89
ATG13-223ENST00000577256 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ATG13-223ENST00000577256 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
ATG13-223ENST00000577256 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ATG13-223ENST00000577256 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.83■■□□□ 1.89
ATG13-223ENST00000577256 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.82■■□□□ 1.88
ATG13-223ENST00000577256 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.81■■□□□ 1.88
ATG13-223ENST00000577256 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.81■■□□□ 1.88
ATG13-223ENST00000577256 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.81■■□□□ 1.88
ATG13-223ENST00000577256 STRCQ7RTU9 1775 aa26.8■■□□□ 1.88
ATG13-223ENST00000577256 ERVK-7P63135 1459 aa26.8■■□□□ 1.88
ATG13-223ENST00000577256 NLRP1Q9C000 1473 aa26.79■■□□□ 1.88
ATG13-223ENST00000577256 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.77■■□□□ 1.88
ATG13-223ENST00000577256 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
ATG13-223ENST00000577256 UNC13BO14795 1591 aa26.75■■□□□ 1.87
ATG13-223ENST00000577256 PLA2R1Q13018 1463 aa26.74■■□□□ 1.87
ATG13-223ENST00000577256 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.72■■□□□ 1.87
ATG13-223ENST00000577256 PTPRTO14522 1441 aa26.69■■□□□ 1.86
ATG13-223ENST00000577256 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.68■■□□□ 1.86
ATG13-223ENST00000577256 PKD2Q13563 968 aa26.68■■□□□ 1.86
ATG13-223ENST00000577256 TET3O43151 1660 aa26.68■■□□□ 1.86
ATG13-223ENST00000577256 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ATG13-223ENST00000577256 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
ATG13-223ENST00000577256 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.66■■□□□ 1.86
ATG13-223ENST00000577256 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.65■■□□□ 1.86
ATG13-223ENST00000577256 NAIPQ13075 1403 aa26.65■■□□□ 1.86
ATG13-223ENST00000577256 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.64■■□□□ 1.85
ATG13-223ENST00000577256 NUP155O75694 1391 aa26.62■■□□□ 1.85
ATG13-223ENST00000577256 NOS1P29475 1434 aa26.62■■□□□ 1.85
ATG13-223ENST00000577256 HFM1A2PYH4 1435 aa26.61■■□□□ 1.85
ATG13-223ENST00000577256 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ATG13-223ENST00000577256 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.59■■□□□ 1.85
ATG13-223ENST00000577256 SYNMO15061 1565 aa26.58■■□□□ 1.85
ATG13-223ENST00000577256 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.57■■□□□ 1.84
ATG13-223ENST00000577256 PIK3C2BO00750 1634 aa26.55■■□□□ 1.84
ATG13-223ENST00000577256 E9PCH4 1651 aa26.55■■□□□ 1.84
ATG13-223ENST00000577256 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.54■■□□□ 1.84
ATG13-223ENST00000577256 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ATG13-223ENST00000577256 IDI1Q13907 227 aa26.52■■□□□ 1.84
ATG13-223ENST00000577256 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.52■■□□□ 1.84
ATG13-223ENST00000577256 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.51■■□□□ 1.83
ATG13-223ENST00000577256 SLIT1O75093 1534 aa26.49■■□□□ 1.83
ATG13-223ENST00000577256 MED14O60244 1454 aa26.49■■□□□ 1.83
ATG13-223ENST00000577256 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.48■■□□□ 1.83
ATG13-223ENST00000577256 ADGRB3O60242 1522 aa26.47■■□□□ 1.83
ATG13-223ENST00000577256 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
ATG13-223ENST00000577256 CERKQ8TCT0 537 aa26.45■■□□□ 1.82
ATG13-223ENST00000577256 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ATG13-223ENST00000577256 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.44■■□□□ 1.82
ATG13-223ENST00000577256 TRIM52Q96A61 297 aa26.43■■□□□ 1.82
ATG13-223ENST00000577256 IQGAP1P46940 1657 aa26.43■■□□□ 1.82
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ATG13-223ENST00000577256 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.42■■□□□ 1.82
ATG13-223ENST00000577256 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.4■■□□□ 1.82
ATG13-223ENST00000577256 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.39■■□□□ 1.82
ATG13-223ENST00000577256 LTKP29376 864 aa26.39■■□□□ 1.82
ATG13-223ENST00000577256 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
ATG13-223ENST00000577256 FBXO41Q8TF61 875 aa26.38■■□□□ 1.81
ATG13-223ENST00000577256 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.37■■□□□ 1.81
ATG13-223ENST00000577256 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ATG13-223ENST00000577256 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ATG13-223ENST00000577256 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.35■■□□□ 1.81
ATG13-223ENST00000577256 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ATG13-223ENST00000577256 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.33■■□□□ 1.81
ATG13-223ENST00000577256 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
ATG13-223ENST00000577256 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.31■■□□□ 1.8
ATG13-223ENST00000577256 TRPM2O94759 1503 aa26.3■■□□□ 1.8
ATG13-223ENST00000577256 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
ATG13-223ENST00000577256 ZFYVE9O95405 1425 aa26.29■■□□□ 1.8
ATG13-223ENST00000577256 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.28■■□□□ 1.8
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