RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 NCOA1Q15788 1441 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-205ENST00000558534 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-205ENST00000558534 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-205ENST00000558534 NPATQ14207 1427 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-205ENST00000558534 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-205ENST00000558534 ROCK1Q13464 1354 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-205ENST00000558534 ZMYM3Q14202 1370 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-205ENST00000558534 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-205ENST00000558534 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-205ENST00000558534 DEPDC5O75140 1603 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-205ENST00000558534 KANK1Q14678 1352 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-205ENST00000558534 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-205ENST00000558534 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
RABGGTA-205ENST00000558534 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RABGGTA-205ENST00000558534 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.97■■□□□ 1.43
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.97■■□□□ 1.43
RABGGTA-205ENST00000558534 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.95■■□□□ 1.43
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC3O15438 1527 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-205ENST00000558534 PZPP20742 1482 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-205ENST00000558534 CEP152O94986 1710 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-205ENST00000558534 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-205ENST00000558534 ITGAEP38570 1179 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPRKQ15262 1439 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
RABGGTA-205ENST00000558534 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-205ENST00000558534 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-205ENST00000558534 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.414e-6■■□□□ 14.1
RABGGTA-205ENST00000558534 UNC13BO14795 1591 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-205ENST00000558534 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-205ENST00000558534 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.84■■□□□ 1.41
RABGGTA-205ENST00000558534 TNRQ92752 1358 aa23.84■■□□□ 1.41
RABGGTA-205ENST00000558534 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 NLRP1Q9C000 1473 aa23.82■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.82■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.8■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 TET3O43151 1660 aa23.79■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.79■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 ERVK-7P63135 1459 aa23.78■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.77■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.77■■□□□ 1.4
RABGGTA-205ENST00000558534 HFM1A2PYH4 1435 aa23.76■■□□□ 1.39
RABGGTA-205ENST00000558534 HSPA2P54652 639 aa23.76■■□□□ 1.39
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
RABGGTA-205ENST00000558534 NAIPQ13075 1403 aa23.74■■□□□ 1.39
RABGGTA-205ENST00000558534 PLA2R1Q13018 1463 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-205ENST00000558534 NUP155O75694 1391 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-205ENST00000558534 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-205ENST00000558534 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-205ENST00000558534 STRCQ7RTU9 1775 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-205ENST00000558534 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-205ENST00000558534 PKD2Q13563 968 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-205ENST00000558534 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.64■■□□□ 1.37
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPRTO14522 1441 aa23.63■■□□□ 1.37
RABGGTA-205ENST00000558534 NOS1P29475 1434 aa23.63■■□□□ 1.37
RABGGTA-205ENST00000558534 E9PCH4 1651 aa23.63■■□□□ 1.37
RABGGTA-205ENST00000558534 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.62■■□□□ 1.37
RABGGTA-205ENST00000558534 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.6■■□□□ 1.37
RABGGTA-205ENST00000558534 SYNMO15061 1565 aa23.59■■□□□ 1.37
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-205ENST00000558534 PIK3C2BO00750 1634 aa23.58■■□□□ 1.36
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM52Q96A61 297 aa23.57■■□□□ 1.36
RABGGTA-205ENST00000558534 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.56■■□□□ 1.36
RABGGTA-205ENST00000558534 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-205ENST00000558534 ADGRB3O60242 1522 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-205ENST00000558534 SLIT1O75093 1534 aa23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-205ENST00000558534 EID1Q9Y6B2 187 aa23.51■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 IDI1Q13907 227 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 MED14O60244 1454 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 IQGAP1P46940 1657 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-205ENST00000558534 TRPM2O94759 1503 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-205ENST00000558534 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-205ENST00000558534 HRCP23327 699 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF1BO60333 1816 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-205ENST00000558534 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-205ENST00000558534 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-205ENST00000558534 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-205ENST00000558534 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-205ENST00000558534 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.36■■□□□ 1.33
RABGGTA-205ENST00000558534 CLTCL1P53675 1640 aa23.34■■□□□ 1.33
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
RABGGTA-205ENST00000558534 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.34■■□□□ 1.33
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