RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556705.5

SRP54-AS1-204, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 580 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.53■□□□□ 0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PTPRKQ15262 1439 aa20.52■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 STRCQ7RTU9 1775 aa20.51■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.5■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.5■□□□□ 0.87
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 KIF15Q9NS87 1388 aa20.48■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.48■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.46■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.45■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CEP152O94986 1710 aa20.43■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.43■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NCOA1Q15788 1441 aa20.43■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PZPP20742 1482 aa20.43■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ERBINQ96RT1 1412 aa20.42■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ABCC3O15438 1527 aa20.42■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.4■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ADGRL2O95490 1459 aa20.39■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TNRQ92752 1358 aa20.39■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.37■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DEPDC5O75140 1603 aa20.37■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.36■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.33■□□□□ 0.85
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PTPRTO14522 1441 aa20.33■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.31■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PLA2R1Q13018 1463 aa20.3■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ERVK-7P63135 1459 aa20.3■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.29■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ITGAEP38570 1179 aa20.29■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KANK1Q14678 1352 aa20.29■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.29■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.28■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NLRP1Q9C000 1473 aa20.28■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ROCK1Q13464 1354 aa20.26■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PKD2Q13563 968 aa20.26■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CERKQ8TCT0 537 aa20.26■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.26■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.25■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FBXO41Q8TF61 875 aa20.24■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-204ENST00000556705 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-204ENST00000556705 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.19■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UNC13BO14795 1591 aa20.19■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.19■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.19■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.18■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PIK3C2BO00750 1634 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TET3O43151 1660 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SYNMO15061 1565 aa20.15■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.14■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NOS1P29475 1434 aa20.14■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IDI1Q13907 227 aa20.13■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MED14O60244 1454 aa20.11■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.11■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-204ENST00000556705 E9PCH4 1651 aa20.1■□□□□ 0.81
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 NUP155O75694 1391 aa20.09■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IQGAP1P46940 1657 aa20.09■□□□□ 0.81
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.08■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLIT1O75093 1534 aa20.07■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LTKP29376 864 aa20.07■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-204ENST00000556705 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.07■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.06■□□□□ 0.8
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SRP54-AS1-204ENST00000556705 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.06■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.06■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.04■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.03■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ADGRB3O60242 1522 aa20.02■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EID1Q9Y6B2 187 aa20.01■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 STRCP1A6NGW2 1772 aa20■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HFM1A2PYH4 1435 aa19.99■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa19.98■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CPS1P31327 1500 aa19.97■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa19.96■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MSH5O43196 834 aa19.95■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRIM52Q96A61 297 aa19.94■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZFYVE9O95405 1425 aa19.92■□□□□ 0.78
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