RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-228ENST00000551473 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CS-228ENST00000551473 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-228ENST00000551473 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-228ENST00000551473 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CS-228ENST00000551473 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CS-228ENST00000551473 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 PZPP20742 1482 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 NEURL4Q96JN8 1562 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 KDM5DQ9BY66 1539 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 MBD5Q9P267 1494 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 KIF3BO15066 747 aa19.29■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 NLRP1Q9C000 1473 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
CS-228ENST00000551473 TIAM1Q13009 1591 aa19.27■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 MIA2Q96PC5 1412 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 MED14O60244 1454 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 UGGT1Q9NYU2 1555 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 CEP162Q5TB80 1403 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 VWDEQ8N2E2 1590 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 CCDC141Q6ZP82 1450 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 DEPDC5O75140 1603 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-228ENST00000551473 TSPY4P0CV99 314 aa19.18■□□□□ 0.66
CS-228ENST00000551473 TSPY10P0CW01 314 aa19.18■□□□□ 0.66
CS-228ENST00000551473 SYNMO15061 1565 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-228ENST00000551473 IQGAP1P46940 1657 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-228ENST00000551473 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CS-228ENST00000551473 ALKQ9UM73 1620 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-228ENST00000551473 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-228ENST00000551473 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-228ENST00000551473 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CS-228ENST00000551473 NCOA2Q15596 1464 aa19.11■□□□□ 0.65
CS-228ENST00000551473 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-228ENST00000551473 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CS-228ENST00000551473 ABCC3O15438 1527 aa19.09■□□□□ 0.65
CS-228ENST00000551473 ERVK-7P63135 1459 aa19.09■□□□□ 0.65
CS-228ENST00000551473 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CS-228ENST00000551473 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.05■□□□□ 0.64
CS-228ENST00000551473 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CS-228ENST00000551473 EID1Q9Y6B2 187 aa19.03■□□□□ 0.64
CS-228ENST00000551473 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.02■□□□□ 0.64
CS-228ENST00000551473 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.02■□□□□ 0.64
CS-228ENST00000551473 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.01■□□□□ 0.63
CS-228ENST00000551473 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19■□□□□ 0.63
CS-228ENST00000551473 SLIT1O75093 1534 aa19■□□□□ 0.63
CS-228ENST00000551473 UBR1Q8IWV7 1749 aa19■□□□□ 0.63
CS-228ENST00000551473 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CS-228ENST00000551473 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.98■□□□□ 0.63
CS-228ENST00000551473 LTKP29376 864 aa18.97■□□□□ 0.63
CS-228ENST00000551473 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.96■□□□□ 0.63
CS-228ENST00000551473 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.95■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.94■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 CEP152O94986 1710 aa18.93■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.93■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.92■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.92■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 TMEM94Q12767 1356 aa18.92■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 KCNA6P17658 529 aa18.91■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 POTEAQ6S8J7 498 aa18.9■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 ERBINQ96RT1 1412 aa18.9■□□□□ 0.62
CS-228ENST00000551473 KANK1Q14678 1352 aa18.89■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 KIF15Q9NS87 1388 aa18.88■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.86■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 PIK3C2BO00750 1634 aa18.85■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.85■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.84■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 MSH6P52701 1360 aa18.84■□□□□ 0.61
CS-228ENST00000551473 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.66e-9■□□□□ 10
CS-228ENST00000551473 MAP3K1Q13233 1512 aa18.83■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 JCADQ9P266 1359 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 IDI1Q13907 227 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 TET3O43151 1660 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 BCANQ96GW7 911 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 NWD1Q149M9 1564 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 SLAIN2Q9P270 581 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 ABCC5O15440 1437 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-228ENST00000551473 ADGRB3O60242 1522 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.75■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 NOS1P29475 1434 aa18.74■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 PHLPP1O60346 1717 aa18.74■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.74■□□□□ 0.59
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