RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 ATP10AO60312 1499 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 MYT1Q01538 1121 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 FKBP8Q14318 412 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 ERICH6BQ5W0A0 696 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 ABCC1P33527 1531 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 LAMC1P11047 1609 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 MRS2Q9HD23 443 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-205ENST00000546891 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.39□□□□□ -0.27
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CS-205ENST00000546891 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
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CS-205ENST00000546891 BCORL1Q5H9F3 1711 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-205ENST00000546891 STAC3Q96MF2 364 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-205ENST00000546891 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-205ENST00000546891 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-205ENST00000546891 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-205ENST00000546891 A2MP01023 1474 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 PLA2R1Q13018 1463 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 RALBP1Q15311 655 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 E9PCH4 1651 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
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CS-205ENST00000546891 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 TRPM2O94759 1503 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 BCANQ96GW7 911 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 POLR3GLQ9BT43 218 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 KANK1Q14678 1352 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 DEPDC5O75140 1603 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 CCDC184Q52MB2 194 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CS-205ENST00000546891 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 FANCAO15360 1455 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 TET3O43151 1660 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 INSRP06213 1382 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 ATP7AQ04656 1500 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 PTPRTO14522 1441 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 TMC1Q8TDI8 760 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 TMF1P82094 1093 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 ADGRL1O94910 1474 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 SLC24A1O60721 1099 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 RGL3Q3MIN7 710 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 CEP152O94986 1710 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 PARD3Q8TEW0 1356 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 MADDQ8WXG6 1647 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 CDCA8Q53HL2 280 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 NLRP13Q86W25 1043 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 NUDCQ9Y266 331 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-205ENST00000546891 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 ASXL2Q76L83 1435 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 MYOM2P54296 1465 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 TESK2Q96S53 571 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 IQGAP1P46940 1657 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 PDE3BQ13370 1112 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 AFAP1Q8N556 730 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 CLTCL1P53675 1640 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-205ENST00000546891 RNF123Q5XPI4 1314 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 SYNMO15061 1565 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
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