RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.67■■■■□ 3.78
TM7SF3-212ENST00000543088 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.66■■■■□ 3.78
TM7SF3-212ENST00000543088 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.78
TM7SF3-212ENST00000543088 KIF15Q9NS87 1388 aa38.6■■■■□ 3.77
TM7SF3-212ENST00000543088 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.58■■■■□ 3.77
TM7SF3-212ENST00000543088 PTPRKQ15262 1439 aa38.57■■■■□ 3.77
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
TM7SF3-212ENST00000543088 ERBINQ96RT1 1412 aa38.55■■■■□ 3.76
TM7SF3-212ENST00000543088 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
TM7SF3-212ENST00000543088 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.54■■■■□ 3.76
TM7SF3-212ENST00000543088 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.52■■■■□ 3.76
TM7SF3-212ENST00000543088 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.52■■■■□ 3.76
TM7SF3-212ENST00000543088 PZPP20742 1482 aa38.5■■■■□ 3.75
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
TM7SF3-212ENST00000543088 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.47■■■■□ 3.75
TM7SF3-212ENST00000543088 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.45■■■■□ 3.75
TM7SF3-212ENST00000543088 ABCC3O15438 1527 aa38.45■■■■□ 3.75
TM7SF3-212ENST00000543088 ADGRL2O95490 1459 aa38.45■■■■□ 3.75
TM7SF3-212ENST00000543088 NCOA1Q15788 1441 aa38.43■■■■□ 3.74
TM7SF3-212ENST00000543088 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
TM7SF3-212ENST00000543088 DMRT2Q9Y5R5 561 aa38.41■■■■□ 3.74
TM7SF3-212ENST00000543088 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
TM7SF3-212ENST00000543088 STRCQ7RTU9 1775 aa38.41■■■■□ 3.74
TM7SF3-212ENST00000543088 TNRQ92752 1358 aa38.38■■■■□ 3.73
TM7SF3-212ENST00000543088 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
TM7SF3-212ENST00000543088 CEP152O94986 1710 aa38.37■■■■□ 3.73
TM7SF3-212ENST00000543088 DEPDC5O75140 1603 aa38.37■■■■□ 3.73
TM7SF3-212ENST00000543088 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.35■■■■□ 3.73
TM7SF3-212ENST00000543088 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.34■■■■□ 3.73
TM7SF3-212ENST00000543088 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
TM7SF3-212ENST00000543088 KANK1Q14678 1352 aa38.32■■■■□ 3.73
TM7SF3-212ENST00000543088 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.29■■■■□ 3.72
TM7SF3-212ENST00000543088 PLA2R1Q13018 1463 aa38.28■■■■□ 3.72
TM7SF3-212ENST00000543088 PTPRTO14522 1441 aa38.27■■■■□ 3.72
TM7SF3-212ENST00000543088 NLRP1Q9C000 1473 aa38.27■■■■□ 3.72
TM7SF3-212ENST00000543088 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.26■■■■□ 3.72
TM7SF3-212ENST00000543088 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.26■■■■□ 3.72
TM7SF3-212ENST00000543088 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.24■■■■□ 3.71
TM7SF3-212ENST00000543088 ERVK-7P63135 1459 aa38.22■■■■□ 3.71
TM7SF3-212ENST00000543088 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa38.21■■■■□ 3.71
TM7SF3-212ENST00000543088 ROCK1Q13464 1354 aa38.21■■■■□ 3.71
TM7SF3-212ENST00000543088 PKD2Q13563 968 aa38.18■■■■□ 3.7
TM7SF3-212ENST00000543088 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.18■■■■□ 3.7
TM7SF3-212ENST00000543088 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38.17■■■■□ 3.7
TM7SF3-212ENST00000543088 UGGT1Q9NYU2 1555 aa38.14■■■■□ 3.7
TM7SF3-212ENST00000543088 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.7
TM7SF3-212ENST00000543088 ITGAEP38570 1179 aa38.13■■■■□ 3.69
TM7SF3-212ENST00000543088 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
TM7SF3-212ENST00000543088 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.12■■■■□ 3.69
TM7SF3-212ENST00000543088 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
TM7SF3-212ENST00000543088 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
TM7SF3-212ENST00000543088 EFCAB6Q5THR3 1501 aa38.07■■■■□ 3.68
TM7SF3-212ENST00000543088 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
TM7SF3-212ENST00000543088 UNC13BO14795 1591 aa38.06■■■■□ 3.68
TM7SF3-212ENST00000543088 FBXO41Q8TF61 875 aa38.04■■■■□ 3.68
TM7SF3-212ENST00000543088 CERKQ8TCT0 537 aa38.02■■■■□ 3.68
TM7SF3-212ENST00000543088 TET3O43151 1660 aa37.98■■■■□ 3.67
TM7SF3-212ENST00000543088 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.97■■■■□ 3.67
TM7SF3-212ENST00000543088 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
TM7SF3-212ENST00000543088 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.96■■■■□ 3.67
TM7SF3-212ENST00000543088 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.94■■■■□ 3.66
TM7SF3-212ENST00000543088 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.94■■■■□ 3.66
TM7SF3-212ENST00000543088 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.9■■■■□ 3.66
TM7SF3-212ENST00000543088 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.9■■■■□ 3.66
TM7SF3-212ENST00000543088 NOS1P29475 1434 aa37.89■■■■□ 3.66
TM7SF3-212ENST00000543088 PIK3C2BO00750 1634 aa37.89■■■■□ 3.66
TM7SF3-212ENST00000543088 SYNMO15061 1565 aa37.88■■■■□ 3.65
TM7SF3-212ENST00000543088 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
TM7SF3-212ENST00000543088 MED14O60244 1454 aa37.86■■■■□ 3.65
TM7SF3-212ENST00000543088 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.84■■■■□ 3.65
TM7SF3-212ENST00000543088 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
TM7SF3-212ENST00000543088 NUP155O75694 1391 aa37.83■■■■□ 3.65
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
TM7SF3-212ENST00000543088 SLIT1O75093 1534 aa37.82■■■■□ 3.64
TM7SF3-212ENST00000543088 IQGAP1P46940 1657 aa37.81■■■■□ 3.64
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.8■■■■□ 3.64
TM7SF3-212ENST00000543088 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.79■■■■□ 3.64
TM7SF3-212ENST00000543088 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
TM7SF3-212ENST00000543088 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.78■■■■□ 3.64
TM7SF3-212ENST00000543088 IDI1Q13907 227 aa37.78■■■■□ 3.64
TM7SF3-212ENST00000543088 E9PCH4 1651 aa37.78■■■■□ 3.64
TM7SF3-212ENST00000543088 ADGRB3O60242 1522 aa37.77■■■■□ 3.64
TM7SF3-212ENST00000543088 NAIPQ13075 1403 aa37.76■■■■□ 3.63
TM7SF3-212ENST00000543088 EID1Q9Y6B2 187 aa37.74■■■■□ 3.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.72■■■■□ 3.63
TM7SF3-212ENST00000543088 HFM1A2PYH4 1435 aa37.71■■■■□ 3.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.7■■■■□ 3.63
TM7SF3-212ENST00000543088 CPS1P31327 1500 aa37.66■■■■□ 3.62
TM7SF3-212ENST00000543088 LTKP29376 864 aa37.64■■■■□ 3.62
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.58■■■■□ 3.61
TM7SF3-212ENST00000543088 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.56■■■■□ 3.6
TM7SF3-212ENST00000543088 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.55■■■■□ 3.6
TM7SF3-212ENST00000543088 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
TM7SF3-212ENST00000543088 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
TM7SF3-212ENST00000543088 TRIM52Q96A61 297 aa37.51■■■■□ 3.6
TM7SF3-212ENST00000543088 ZFYVE9O95405 1425 aa37.47■■■■□ 3.59
TM7SF3-212ENST00000543088 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.47■■■■□ 3.59
TM7SF3-212ENST00000543088 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
TM7SF3-212ENST00000543088 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.44■■■■□ 3.58
TM7SF3-212ENST00000543088 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.43■■■■□ 3.58
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