RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539594.5

ESRRA-206, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-206ENST00000539594 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.11■■■■■ 4.49
ESRRA-206ENST00000539594 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.1■■■■■ 4.49
ESRRA-206ENST00000539594 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.48
ESRRA-206ENST00000539594 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.05■■■■■ 4.48
ESRRA-206ENST00000539594 NPATQ14207 1427 aa43.05■■■■■ 4.48
ESRRA-206ENST00000539594 ERBINQ96RT1 1412 aa43.05■■■■■ 4.48
ESRRA-206ENST00000539594 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.04■■■■■ 4.48
ESRRA-206ENST00000539594 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.03■■■■■ 4.48
ESRRA-206ENST00000539594 ADGRL2O95490 1459 aa43.02■■■■■ 4.48
ESRRA-206ENST00000539594 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.02■■■■■ 4.488e-7■■■■□ 22.9
ESRRA-206ENST00000539594 NCOA1Q15788 1441 aa43.01■■■■■ 4.48
ESRRA-206ENST00000539594 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43■■■■■ 4.47
ESRRA-206ENST00000539594 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.99■■■■■ 4.47
ESRRA-206ENST00000539594 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
ESRRA-206ENST00000539594 PTPRKQ15262 1439 aa42.92■■■■■ 4.46
ESRRA-206ENST00000539594 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.88■■■■■ 4.45
ESRRA-206ENST00000539594 HSPA2P54652 639 aa42.87■■■■■ 4.45
ESRRA-206ENST00000539594 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
ESRRA-206ENST00000539594 PZPP20742 1482 aa42.85■■■■■ 4.45
ESRRA-206ENST00000539594 ABCC3O15438 1527 aa42.85■■■■■ 4.45
ESRRA-206ENST00000539594 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
ESRRA-206ENST00000539594 DEPDC5O75140 1603 aa42.82■■■■■ 4.45
ESRRA-206ENST00000539594 ROCK1Q13464 1354 aa42.82■■■■■ 4.45
ESRRA-206ENST00000539594 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.77■■■■■ 4.44
ESRRA-206ENST00000539594 KANK1Q14678 1352 aa42.77■■■■■ 4.44
ESRRA-206ENST00000539594 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.75■■■■■ 4.43
ESRRA-206ENST00000539594 CEP152O94986 1710 aa42.74■■■■■ 4.43
ESRRA-206ENST00000539594 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
ESRRA-206ENST00000539594 ITGAEP38570 1179 aa42.71■■■■■ 4.43
ESRRA-206ENST00000539594 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.71■■■■■ 4.43
ESRRA-206ENST00000539594 TNRQ92752 1358 aa42.69■■■■■ 4.42
ESRRA-206ENST00000539594 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.69■■■■■ 4.42
ESRRA-206ENST00000539594 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
ESRRA-206ENST00000539594 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
ESRRA-206ENST00000539594 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.64■■■■■ 4.42
ESRRA-206ENST00000539594 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.64■■■■■ 4.42
ESRRA-206ENST00000539594 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.62■■■■■ 4.41
ESRRA-206ENST00000539594 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.62■■■■■ 4.41
ESRRA-206ENST00000539594 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.6■■■■■ 4.41
ESRRA-206ENST00000539594 STRCQ7RTU9 1775 aa42.58■■■■■ 4.41
ESRRA-206ENST00000539594 NLRP1Q9C000 1473 aa42.58■■■■■ 4.41
ESRRA-206ENST00000539594 ERVK-7P63135 1459 aa42.57■■■■■ 4.41
ESRRA-206ENST00000539594 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.57■■■■■ 4.41
ESRRA-206ENST00000539594 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
ESRRA-206ENST00000539594 UNC13BO14795 1591 aa42.52■■■■■ 4.4
ESRRA-206ENST00000539594 PLA2R1Q13018 1463 aa42.5■■■■■ 4.39
ESRRA-206ENST00000539594 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.46■■■■■ 4.39
ESRRA-206ENST00000539594 PTPRTO14522 1441 aa42.42■■■■■ 4.38
ESRRA-206ENST00000539594 TET3O43151 1660 aa42.41■■■■■ 4.38
ESRRA-206ENST00000539594 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.4■■■■■ 4.38
ESRRA-206ENST00000539594 PKD2Q13563 968 aa42.4■■■■■ 4.38
ESRRA-206ENST00000539594 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
ESRRA-206ENST00000539594 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
ESRRA-206ENST00000539594 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.36■■■■■ 4.37
ESRRA-206ENST00000539594 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.36■■■■■ 4.37
ESRRA-206ENST00000539594 NAIPQ13075 1403 aa42.35■■■■■ 4.37
ESRRA-206ENST00000539594 NUP155O75694 1391 aa42.32■■■■■ 4.37
ESRRA-206ENST00000539594 HFM1A2PYH4 1435 aa42.31■■■■■ 4.36
ESRRA-206ENST00000539594 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.31■■■■■ 4.36
ESRRA-206ENST00000539594 NOS1P29475 1434 aa42.29■■■■■ 4.36
ESRRA-206ENST00000539594 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
ESRRA-206ENST00000539594 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.25■■■■■ 4.35
ESRRA-206ENST00000539594 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.23■■■■■ 4.35
ESRRA-206ENST00000539594 SYNMO15061 1565 aa42.22■■■■■ 4.35
ESRRA-206ENST00000539594 SLC52A1Q9NWF4 448 aa42.21■■■■■ 4.35
ESRRA-206ENST00000539594 E9PCH4 1651 aa42.19■■■■■ 4.34
ESRRA-206ENST00000539594 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
ESRRA-206ENST00000539594 PIK3C2BO00750 1634 aa42.18■■■■■ 4.34
ESRRA-206ENST00000539594 IDI1Q13907 227 aa42.15■■■■■ 4.34
ESRRA-206ENST00000539594 STAG3Q9UJ98 1225 aa42.14■■■■■ 4.34
ESRRA-206ENST00000539594 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.12■■■■■ 4.33
ESRRA-206ENST00000539594 MED14O60244 1454 aa42.1■■■■■ 4.33
ESRRA-206ENST00000539594 SLIT1O75093 1534 aa42.09■■■■■ 4.33
ESRRA-206ENST00000539594 ARHGAP23Q9P227 1491 aa42.08■■■■■ 4.33
ESRRA-206ENST00000539594 ADGRB3O60242 1522 aa42.05■■■■■ 4.32
ESRRA-206ENST00000539594 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
ESRRA-206ENST00000539594 CERKQ8TCT0 537 aa42.02■■■■■ 4.32
ESRRA-206ENST00000539594 TRIM52Q96A61 297 aa42.02■■■■■ 4.32
ESRRA-206ENST00000539594 TMEM2Q9UHN6 1383 aa42.01■■■■■ 4.32
ESRRA-206ENST00000539594 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
ESRRA-206ENST00000539594 EID1Q9Y6B2 187 aa42.01■■■■■ 4.32
ESRRA-206ENST00000539594 IQGAP1P46940 1657 aa41.99■■■■■ 4.31
ESRRA-206ENST00000539594 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
ESRRA-206ENST00000539594 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.97■■■■■ 4.31
ESRRA-206ENST00000539594 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.97■■■■■ 4.31
ESRRA-206ENST00000539594 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.95■■■■■ 4.31
ESRRA-206ENST00000539594 LTKP29376 864 aa41.92■■■■■ 4.3
ESRRA-206ENST00000539594 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
ESRRA-206ENST00000539594 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.91■■■■■ 4.3
ESRRA-206ENST00000539594 FBXO41Q8TF61 875 aa41.9■■■■■ 4.3
ESRRA-206ENST00000539594 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
ESRRA-206ENST00000539594 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.87■■■■■ 4.29
ESRRA-206ENST00000539594 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
ESRRA-206ENST00000539594 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.87■■■■■ 4.29
ESRRA-206ENST00000539594 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
ESRRA-206ENST00000539594 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.83■■■■■ 4.29
ESRRA-206ENST00000539594 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
ESRRA-206ENST00000539594 TRPM2O94759 1503 aa41.8■■■■■ 4.28
ESRRA-206ENST00000539594 ZFYVE9O95405 1425 aa41.78■■■■■ 4.28
ESRRA-206ENST00000539594 CPS1P31327 1500 aa41.77■■■■■ 4.28
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