RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538716.6

TMUB2-204, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene TMUB2, Length 1,953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-204ENST00000538716 ERCC6Q03468 1493 aa22.78■■□□□ 1.24
TMUB2-204ENST00000538716 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.76■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.76■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.73■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 FBLN2P98095 1184 aa22.73■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.72■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.72■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.72■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.72■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.71■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 INSRP06213 1382 aa22.71■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
TMUB2-204ENST00000538716 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.7■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 PREX2Q70Z35 1606 aa22.7■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.69■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 LAMC1P11047 1609 aa22.69■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.69■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.69■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 BCL11AQ9H165 835 aa22.69■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.68■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 PDE3BQ13370 1112 aa22.68■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 NLRP13Q86W25 1043 aa22.67■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 UNC13BO14795 1591 aa22.67■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.66■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.66■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.65■■□□□ 1.22
TMUB2-204ENST00000538716 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 PLA2R1Q13018 1463 aa22.62■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 ATP10AO60312 1499 aa22.61■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.59■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 PLXNC1O60486 1568 aa22.59■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 A2MP01023 1474 aa22.58■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TMUB2-204ENST00000538716 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.58■■□□□ 1.2
TMUB2-204ENST00000538716 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.56■■□□□ 1.2
TMUB2-204ENST00000538716 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.54■■□□□ 1.2
TMUB2-204ENST00000538716 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TMUB2-204ENST00000538716 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.54■■□□□ 1.2
TMUB2-204ENST00000538716 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TMUB2-204ENST00000538716 TESK2Q96S53 571 aa22.54■■□□□ 1.2
TMUB2-204ENST00000538716 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TMUB2-204ENST00000538716 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.52■■□□□ 1.2
TMUB2-204ENST00000538716 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.52■■□□□ 1.2
TMUB2-204ENST00000538716 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 ERBINQ96RT1 1412 aa22.51■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.51■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.48■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.48■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.47■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 TMF1P82094 1093 aa22.47■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 MS4A1P11836 297 aa22.46■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 RGL3Q3MIN7 710 aa22.46■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 SHROOM2Q13796 1616 aa22.46■■□□□ 1.19
TMUB2-204ENST00000538716 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TMUB2-204ENST00000538716 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.44■■□□□ 1.18
TMUB2-204ENST00000538716 PANK3Q9H999 370 aa22.43■■□□□ 1.18
TMUB2-204ENST00000538716 ABCC2Q92887 1545 aa22.42■■□□□ 1.18
TMUB2-204ENST00000538716 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.42■■□□□ 1.18
TMUB2-204ENST00000538716 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TMUB2-204ENST00000538716 STAC3Q96MF2 364 aa22.41■■□□□ 1.18
TMUB2-204ENST00000538716 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.184e-8■■□□□ 12.4
TMUB2-204ENST00000538716 PLCH2O75038 1416 aa22.38■■□□□ 1.17
TMUB2-204ENST00000538716 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TMUB2-204ENST00000538716 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TMUB2-204ENST00000538716 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.36■■□□□ 1.17
TMUB2-204ENST00000538716 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.34■■□□□ 1.17
TMUB2-204ENST00000538716 PDE4AP27815 886 aa22.34■■□□□ 1.17
TMUB2-204ENST00000538716 BACH2Q9BYV9 841 aa22.34■■□□□ 1.17
TMUB2-204ENST00000538716 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TMUB2-204ENST00000538716 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.33■■□□□ 1.17
TMUB2-204ENST00000538716 CDCA8Q53HL2 280 aa22.32■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.32■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 MADDQ8WXG6 1647 aa22.32■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 IQGAP1P46940 1657 aa22.31■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.31■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 ABCC1P33527 1531 aa22.31■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 CHD1O14646 1710 aa22.31■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.3■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 TRPM2O94759 1503 aa22.3■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 PTPRTO14522 1441 aa22.3■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.29■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 SYNMO15061 1565 aa22.29■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.28■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TMUB2-204ENST00000538716 PPP2R1AP30153 589 aa22.27■■□□□ 1.15
TMUB2-204ENST00000538716 NBR1Q14596 966 aa22.27■■□□□ 1.15
TMUB2-204ENST00000538716 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.27■■□□□ 1.15
TMUB2-204ENST00000538716 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.26■■□□□ 1.15
TMUB2-204ENST00000538716 PIK3C2GO75747 1445 aa22.26■■□□□ 1.15
TMUB2-204ENST00000538716 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TMUB2-204ENST00000538716 CRBNQ96SW2 442 aa22.26■■□□□ 1.15
TMUB2-204ENST00000538716 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.25■■□□□ 1.15
TMUB2-204ENST00000538716 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.25■■□□□ 1.15
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