RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536405.5

DKFZP434K028-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DKFZP434K028, Length 2,466 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NEFLP07196 543 aa23.7■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.7■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.69■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FANCAO15360 1455 aa23.69■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.68■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ERBINQ96RT1 1412 aa23.68■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.66■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.66■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.66■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.66■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.65■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.64■■□□□ 1.38
DKFZP434K028-202ENST00000536405 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.64■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.63■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KDM5CP41229 1560 aa23.62■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.62■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CCDC184Q52MB2 194 aa23.62■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.62■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.62■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.6■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ADGRL1O94910 1474 aa23.6■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.57■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.56■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 A2MP01023 1474 aa23.55■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ATP7AQ04656 1500 aa23.55■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.54■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KIF3BO15066 747 aa23.53■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ATP10AO60312 1499 aa23.5■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 E9PCH4 1651 aa23.5■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.47■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CD109Q6YHK3 1445 aa23.47■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MRS2Q9HD23 443 aa23.44■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DEPDC5O75140 1603 aa23.44■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.43■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.42■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KANK1Q14678 1352 aa23.4■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.39■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.38■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PTPRTO14522 1441 aa23.37■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.37■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.37■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.37■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TET3O43151 1660 aa23.37■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TRPM2O94759 1503 aa23.37■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.36■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CLTCL1P53675 1640 aa23.36■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RAPGEF3O95398 923 aa23.35■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.34■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.33■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-202ENST00000536405 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TESK2Q96S53 571 aa23.32■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-202ENST00000536405 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.31■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GGT6Q6P531 493 aa23.31■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CEP152O94986 1710 aa23.3■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.29■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.29■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.27■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MADDQ8WXG6 1647 aa23.26■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 LAMC1P11047 1609 aa23.26■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.25■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.25■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.23■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.23■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.21■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ABCA6Q8N139 1617 aa23.21■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.2■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NEO1Q92859 1461 aa23.2■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TMF1P82094 1093 aa23.19■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.19■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.18■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.17■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TMC1Q8TDI8 760 aa23.17■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.17■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PANK3Q9H999 370 aa23.16■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.16■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NPATQ14207 1427 aa23.16■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.15■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.15■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.15■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 STAC3Q96MF2 364 aa23.15■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KIF1BO60333 1816 aa23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms