RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527549.5

TSTA3-206, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
TSTA3-206ENST00000527549 PZPP20742 1482 aa25.61■■□□□ 1.69
TSTA3-206ENST00000527549 TNRQ92752 1358 aa25.61■■□□□ 1.69
TSTA3-206ENST00000527549 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.6■■□□□ 1.69
TSTA3-206ENST00000527549 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
TSTA3-206ENST00000527549 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.58■■□□□ 1.69
TSTA3-206ENST00000527549 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.57■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.57■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 NLRP1Q9C000 1473 aa25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 SYNMO15061 1565 aa25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.685e-6■■■■■ 46.2
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TSTA3-206ENST00000527549 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 IQGAP1P46940 1657 aa25.54■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.53■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-206ENST00000527549 MIA2Q96PC5 1412 aa25.51■■□□□ 1.67
TSTA3-206ENST00000527549 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.51■■□□□ 1.67
TSTA3-206ENST00000527549 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.47■■□□□ 1.67
TSTA3-206ENST00000527549 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.47■■□□□ 1.67
TSTA3-206ENST00000527549 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-206ENST00000527549 TIAM1Q13009 1591 aa25.41■■□□□ 1.66
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-206ENST00000527549 KIF3BO15066 747 aa25.39■■□□□ 1.66
TSTA3-206ENST00000527549 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TSTA3-206ENST00000527549 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-206ENST00000527549 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.33■■□□□ 1.65
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TSTA3-206ENST00000527549 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 CEP162Q5TB80 1403 aa25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 ABCC3O15438 1527 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 ERVK-7P63135 1459 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-206ENST00000527549 SLIT1O75093 1534 aa25.26■■□□□ 1.63
TSTA3-206ENST00000527549 NCOA2Q15596 1464 aa25.25■■□□□ 1.63
TSTA3-206ENST00000527549 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.22■■□□□ 1.63
TSTA3-206ENST00000527549 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.21■■□□□ 1.63
TSTA3-206ENST00000527549 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.19■■□□□ 1.62
TSTA3-206ENST00000527549 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TSTA3-206ENST00000527549 LTKP29376 864 aa25.18■■□□□ 1.62
TSTA3-206ENST00000527549 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TSTA3-206ENST00000527549 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.17■■□□□ 1.62
TSTA3-206ENST00000527549 MAP3K1Q13233 1512 aa25.13■■□□□ 1.61
TSTA3-206ENST00000527549 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.13■■□□□ 1.61
TSTA3-206ENST00000527549 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TSTA3-206ENST00000527549 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-206ENST00000527549 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-206ENST00000527549 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-206ENST00000527549 CEP152O94986 1710 aa25.09■■□□□ 1.61
TSTA3-206ENST00000527549 TMEM94Q12767 1356 aa25.09■■□□□ 1.61
TSTA3-206ENST00000527549 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.09■■□□□ 1.61
TSTA3-206ENST00000527549 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 TET3O43151 1660 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 TSPY4P0CV99 314 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 TSPY10P0CW01 314 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 KCNA6P17658 529 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 NWD1Q149M9 1564 aa25.02■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.02■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 EID1Q9Y6B2 187 aa25.02■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 JCADQ9P266 1359 aa25.02■■□□□ 1.6
TSTA3-206ENST00000527549 PIK3C2BO00750 1634 aa25.01■■□□□ 1.59
TSTA3-206ENST00000527549 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TSTA3-206ENST00000527549 PHLPP1O60346 1717 aa25■■□□□ 1.59
TSTA3-206ENST00000527549 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TSTA3-206ENST00000527549 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.95■■□□□ 1.58
TSTA3-206ENST00000527549 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-206ENST00000527549 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-206ENST00000527549 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-206ENST00000527549 LRP6O75581 1613 aa24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-206ENST00000527549 SLAIN2Q9P270 581 aa24.92■■□□□ 1.58
TSTA3-206ENST00000527549 MSH6P52701 1360 aa24.9■■□□□ 1.58
TSTA3-206ENST00000527549 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.89■■□□□ 1.58
TSTA3-206ENST00000527549 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 SHPRHQ149N8 1683 aa24.86■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 ERBINQ96RT1 1412 aa24.86■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.85■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 IDI1Q13907 227 aa24.84■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.84■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.83■■□□□ 1.57
TSTA3-206ENST00000527549 ADGRB3O60242 1522 aa24.81■■□□□ 1.56
TSTA3-206ENST00000527549 NOS1P29475 1434 aa24.8■■□□□ 1.56
TSTA3-206ENST00000527549 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.78■■□□□ 1.56
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