RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484349.1

CHTF18-210, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-210ENST00000484349 KIF15Q9NS87 1388 aa28.63■■■□□ 2.17
CHTF18-210ENST00000484349 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.63■■■□□ 2.17
CHTF18-210ENST00000484349 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CHTF18-210ENST00000484349 NPATQ14207 1427 aa28.62■■■□□ 2.17
CHTF18-210ENST00000484349 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.62■■■□□ 2.17
CHTF18-210ENST00000484349 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.62■■■□□ 2.17
CHTF18-210ENST00000484349 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.61■■■□□ 2.17
CHTF18-210ENST00000484349 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.6■■■□□ 2.17
CHTF18-210ENST00000484349 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.6■■■□□ 2.17
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CHTF18-210ENST00000484349 ADGRL2O95490 1459 aa28.52■■■□□ 2.16
CHTF18-210ENST00000484349 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.51■■■□□ 2.15
CHTF18-210ENST00000484349 PZPP20742 1482 aa28.49■■■□□ 2.15
CHTF18-210ENST00000484349 ABCC3O15438 1527 aa28.48■■■□□ 2.15
CHTF18-210ENST00000484349 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CHTF18-210ENST00000484349 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CHTF18-210ENST00000484349 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.47■■■□□ 2.15
CHTF18-210ENST00000484349 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
CHTF18-210ENST00000484349 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
CHTF18-210ENST00000484349 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CHTF18-210ENST00000484349 TNRQ92752 1358 aa28.42■■■□□ 2.14
CHTF18-210ENST00000484349 CEP152O94986 1710 aa28.41■■■□□ 2.14
CHTF18-210ENST00000484349 DEPDC5O75140 1603 aa28.41■■■□□ 2.14
CHTF18-210ENST00000484349 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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CHTF18-210ENST00000484349 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CHTF18-210ENST00000484349 KANK1Q14678 1352 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-210ENST00000484349 ITGAEP38570 1179 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-210ENST00000484349 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-210ENST00000484349 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.37■■■□□ 2.13
CHTF18-210ENST00000484349 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.37■■■□□ 2.13
CHTF18-210ENST00000484349 ROCK1Q13464 1354 aa28.37■■■□□ 2.13
CHTF18-210ENST00000484349 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.36■■■□□ 2.13
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CHTF18-210ENST00000484349 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.32■■■□□ 2.12
CHTF18-210ENST00000484349 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.32■■■□□ 2.12
CHTF18-210ENST00000484349 ERVK-7P63135 1459 aa28.31■■■□□ 2.12
CHTF18-210ENST00000484349 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.3■■■□□ 2.12
CHTF18-210ENST00000484349 NLRP1Q9C000 1473 aa28.3■■■□□ 2.12
CHTF18-210ENST00000484349 PTPRTO14522 1441 aa28.29■■■□□ 2.12
CHTF18-210ENST00000484349 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.28■■■□□ 2.12
CHTF18-210ENST00000484349 PLA2R1Q13018 1463 aa28.28■■■□□ 2.12
CHTF18-210ENST00000484349 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.27■■■□□ 2.12
CHTF18-210ENST00000484349 PKD2Q13563 968 aa28.25■■■□□ 2.11
CHTF18-210ENST00000484349 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CHTF18-210ENST00000484349 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CHTF18-210ENST00000484349 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.22■■■□□ 2.11
CHTF18-210ENST00000484349 UNC13BO14795 1591 aa28.2■■■□□ 2.1
CHTF18-210ENST00000484349 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.18■■■□□ 2.1
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CHTF18-210ENST00000484349 TET3O43151 1660 aa28.13■■■□□ 2.09
CHTF18-210ENST00000484349 CERKQ8TCT0 537 aa28.12■■■□□ 2.09
CHTF18-210ENST00000484349 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
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CHTF18-210ENST00000484349 NUP155O75694 1391 aa28.1■■■□□ 2.09
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CHTF18-210ENST00000484349 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.09■■■□□ 2.09
CHTF18-210ENST00000484349 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.08■■■□□ 2.09
CHTF18-210ENST00000484349 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.08■■■□□ 2.09
CHTF18-210ENST00000484349 SYNMO15061 1565 aa28.07■■■□□ 2.08
CHTF18-210ENST00000484349 IDI1Q13907 227 aa28.07■■■□□ 2.08
CHTF18-210ENST00000484349 FBXO41Q8TF61 875 aa28.07■■■□□ 2.08
CHTF18-210ENST00000484349 NAIPQ13075 1403 aa28.07■■■□□ 2.08
CHTF18-210ENST00000484349 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.07■■■□□ 2.08
CHTF18-210ENST00000484349 PIK3C2BO00750 1634 aa28.06■■■□□ 2.08
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CHTF18-210ENST00000484349 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.03■■■□□ 2.08
CHTF18-210ENST00000484349 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.02■■■□□ 2.08
CHTF18-210ENST00000484349 MED14O60244 1454 aa28.02■■■□□ 2.08
CHTF18-210ENST00000484349 HFM1A2PYH4 1435 aa28.01■■■□□ 2.07
CHTF18-210ENST00000484349 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CHTF18-210ENST00000484349 E9PCH4 1651 aa28■■■□□ 2.07
CHTF18-210ENST00000484349 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CHTF18-210ENST00000484349 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CHTF18-210ENST00000484349 SLIT1O75093 1534 aa27.99■■■□□ 2.07
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CHTF18-210ENST00000484349 EID1Q9Y6B2 187 aa27.96■■■□□ 2.07
CHTF18-210ENST00000484349 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
CHTF18-210ENST00000484349 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.95■■■□□ 2.06
CHTF18-210ENST00000484349 IQGAP1P46940 1657 aa27.94■■■□□ 2.06
CHTF18-210ENST00000484349 ADGRB3O60242 1522 aa27.94■■■□□ 2.06
CHTF18-210ENST00000484349 LTKP29376 864 aa27.94■■■□□ 2.06
CHTF18-210ENST00000484349 TRIM52Q96A61 297 aa27.9■■■□□ 2.06
CHTF18-210ENST00000484349 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.88■■■□□ 2.05
CHTF18-210ENST00000484349 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CHTF18-210ENST00000484349 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.85■■■□□ 2.05
CHTF18-210ENST00000484349 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.82■■■□□ 2.04
CHTF18-210ENST00000484349 CPS1P31327 1500 aa27.82■■■□□ 2.04
CHTF18-210ENST00000484349 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.81■■■□□ 2.04
CHTF18-210ENST00000484349 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CHTF18-210ENST00000484349 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CHTF18-210ENST00000484349 ZFYVE9O95405 1425 aa27.77■■■□□ 2.04
CHTF18-210ENST00000484349 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.77■■■□□ 2.04
CHTF18-210ENST00000484349 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CHTF18-210ENST00000484349 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
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