RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484349.1

CHTF18-210, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-210ENST00000484349 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.41■■■■■ 4.86
CHTF18-210ENST00000484349 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.45■■■■■ 4.07
CHTF18-210ENST00000484349 ABCC9O60706 1549 aa39.8■■■■□ 3.96
CHTF18-210ENST00000484349 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.19■■■■□ 3.7
CHTF18-210ENST00000484349 NACADO15069 1562 aa38.09■■■■□ 3.69
CHTF18-210ENST00000484349 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.08■■■■□ 3.69
CHTF18-210ENST00000484349 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.78■■■■□ 3.64
CHTF18-210ENST00000484349 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.63
CHTF18-210ENST00000484349 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.55■■■■□ 3.6
CHTF18-210ENST00000484349 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.3■■■■□ 3.56
CHTF18-210ENST00000484349 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.18■■■■□ 3.54
CHTF18-210ENST00000484349 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.03■■■■□ 3.52
CHTF18-210ENST00000484349 SCRIBQ14160 1630 aa36.9■■■■□ 3.5
CHTF18-210ENST00000484349 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.74■■■■□ 3.47
CHTF18-210ENST00000484349 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.62■■■■□ 3.45
CHTF18-210ENST00000484349 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
CHTF18-210ENST00000484349 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.98■■■■□ 3.35
CHTF18-210ENST00000484349 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.79■■■■□ 3.32
CHTF18-210ENST00000484349 SMARCA4P51532 1647 aa35.27■■■■□ 3.24
CHTF18-210ENST00000484349 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
CHTF18-210ENST00000484349 NCAPD3P42695 1498 aa35.16■■■■□ 3.22
CHTF18-210ENST00000484349 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.14■■■■□ 3.22
CHTF18-210ENST00000484349 SMARCA2P51531 1590 aa35.08■■■■□ 3.21
CHTF18-210ENST00000484349 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.99■■■■□ 3.19
CHTF18-210ENST00000484349 HMGXB3Q12766 1538 aa34.94■■■■□ 3.18
CHTF18-210ENST00000484349 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.92■■■■□ 3.18
CHTF18-210ENST00000484349 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CHTF18-210ENST00000484349 WIZO95785 1651 aa34.61■■■■□ 3.13
CHTF18-210ENST00000484349 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
CHTF18-210ENST00000484349 NESP48681 1621 aa34.37■■■■□ 3.09
CHTF18-210ENST00000484349 ERCC6Q03468 1493 aa34.33■■■■□ 3.09
CHTF18-210ENST00000484349 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.26■■■■□ 3.07
CHTF18-210ENST00000484349 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
CHTF18-210ENST00000484349 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.13■■■■□ 3.05
CHTF18-210ENST00000484349 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.05■■■■□ 3.04
CHTF18-210ENST00000484349 CUX2O14529 1486 aa34.03■■■■□ 3.04
CHTF18-210ENST00000484349 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.95■■■■□ 3.03
CHTF18-210ENST00000484349 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
CHTF18-210ENST00000484349 CFTRP13569 1480 aa33.87■■■■□ 3.01
CHTF18-210ENST00000484349 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.83■■■■□ 3.01
CHTF18-210ENST00000484349 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.73■■■□□ 2.99
CHTF18-210ENST00000484349 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.7■■■□□ 2.99
CHTF18-210ENST00000484349 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.69■■■□□ 2.98
CHTF18-210ENST00000484349 WDR62O43379 1518 aa33.58■■■□□ 2.97
CHTF18-210ENST00000484349 PRDM2Q13029 1718 aa33.57■■■□□ 2.96
CHTF18-210ENST00000484349 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
CHTF18-210ENST00000484349 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
CHTF18-210ENST00000484349 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.26■■■□□ 2.91
CHTF18-210ENST00000484349 ABCC8Q09428 1581 aa33.17■■■□□ 2.9
CHTF18-210ENST00000484349 TOPBP1Q92547 1522 aa33.16■■■□□ 2.9
CHTF18-210ENST00000484349 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.1■■■□□ 2.89
CHTF18-210ENST00000484349 IFT140Q96RY7 1462 aa33.01■■■□□ 2.88
CHTF18-210ENST00000484349 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
CHTF18-210ENST00000484349 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
CHTF18-210ENST00000484349 CUX1P39880 1505 aa32.83■■■□□ 2.85
CHTF18-210ENST00000484349 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
CHTF18-210ENST00000484349 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.76■■■□□ 2.84
CHTF18-210ENST00000484349 SOGA1O94964 1423 aa32.76■■■□□ 2.83
CHTF18-210ENST00000484349 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.74■■■□□ 2.83
CHTF18-210ENST00000484349 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
CHTF18-210ENST00000484349 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.67■■■□□ 2.825e-7■■■■□ 19.7
CHTF18-210ENST00000484349 OSCARQ8IYS5 282 aa32.62■■■□□ 2.81
CHTF18-210ENST00000484349 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
CHTF18-210ENST00000484349 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.55■■■□□ 2.8
CHTF18-210ENST00000484349 WDR97A6NE52 1622 aa32.55■■■□□ 2.8
CHTF18-210ENST00000484349 TOP2BQ02880 1626 aa32.5■■■□□ 2.79
CHTF18-210ENST00000484349 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.49■■■□□ 2.79
CHTF18-210ENST00000484349 SYNJ1O43426 1573 aa32.47■■■□□ 2.79
CHTF18-210ENST00000484349 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.43■■■□□ 2.78
CHTF18-210ENST00000484349 GRIN2BQ13224 1484 aa32.38■■■□□ 2.77
CHTF18-210ENST00000484349 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.36■■■□□ 2.77
CHTF18-210ENST00000484349 FBLN2P98095 1184 aa32.36■■■□□ 2.77
CHTF18-210ENST00000484349 CHD1O14646 1710 aa32.36■■■□□ 2.77
CHTF18-210ENST00000484349 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.35■■■□□ 2.77
CHTF18-210ENST00000484349 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
CHTF18-210ENST00000484349 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.31■■■□□ 2.76
CHTF18-210ENST00000484349 PBRM1Q86U86 1689 aa32.29■■■□□ 2.76
CHTF18-210ENST00000484349 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
CHTF18-210ENST00000484349 SYNJ2O15056 1496 aa32.19■■■□□ 2.74
CHTF18-210ENST00000484349 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.09■■■□□ 2.73
CHTF18-210ENST00000484349 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.09■■■□□ 2.73
CHTF18-210ENST00000484349 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.09■■■□□ 2.73
CHTF18-210ENST00000484349 TRIM41Q8WV44 630 aa32.09■■■□□ 2.73
CHTF18-210ENST00000484349 ARHGEF11O15085 1522 aa32.05■■■□□ 2.72
CHTF18-210ENST00000484349 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.04■■■□□ 2.72
CHTF18-210ENST00000484349 ADAMTS12P58397 1594 aa32.02■■■□□ 2.72
CHTF18-210ENST00000484349 CLASP1Q7Z460 1538 aa32■■■□□ 2.71
CHTF18-210ENST00000484349 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.98■■■□□ 2.71
CHTF18-210ENST00000484349 GRIN2AQ12879 1464 aa31.96■■■□□ 2.71
CHTF18-210ENST00000484349 KIF27Q86VH2 1401 aa31.9■■■□□ 2.7
CHTF18-210ENST00000484349 NUP160Q12769 1436 aa31.82■■■□□ 2.68
CHTF18-210ENST00000484349 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.81■■■□□ 2.68
CHTF18-210ENST00000484349 CEP170Q5SW79 1584 aa31.81■■■□□ 2.68
CHTF18-210ENST00000484349 IGF1RP08069 1367 aa31.8■■■□□ 2.68
CHTF18-210ENST00000484349 ARAP1Q96P48 1450 aa31.78■■■□□ 2.68
CHTF18-210ENST00000484349 CUL7Q14999 1698 aa31.71■■■□□ 2.67
CHTF18-210ENST00000484349 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.61■■■□□ 2.65
CHTF18-210ENST00000484349 SHROOM2Q13796 1616 aa31.6■■■□□ 2.65
CHTF18-210ENST00000484349 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.56■■■□□ 2.64
CHTF18-210ENST00000484349 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.55■■■□□ 2.64
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