RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482507.5

ATG4B-220, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4B, Length 2,414 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-220ENST00000482507 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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ATG4B-220ENST00000482507 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.54■□□□□ 0.88
ATG4B-220ENST00000482507 GLI2P10070 1586 aa20.53■□□□□ 0.88
ATG4B-220ENST00000482507 KIF15Q9NS87 1388 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-220ENST00000482507 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.52■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 TSPOAP1O95153 1857 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 ADGRL2O95490 1459 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 MRS2Q9HD23 443 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.48■□□□□ 0.87
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ATG4B-220ENST00000482507 PKD2Q13563 968 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 NEO1Q92859 1461 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-220ENST00000482507 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-220ENST00000482507 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-220ENST00000482507 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.866e-14■■□□□ 12
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ATG4B-220ENST00000482507 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-220ENST00000482507 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-220ENST00000482507 USP47Q96K76 1375 aa20.41■□□□□ 0.86
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ATG4B-220ENST00000482507 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-220ENST00000482507 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-220ENST00000482507 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-220ENST00000482507 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.37■□□□□ 0.85
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ATG4B-220ENST00000482507 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-220ENST00000482507 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-220ENST00000482507 NUP155O75694 1391 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-220ENST00000482507 ATP7AQ04656 1500 aa20.36■□□□□ 0.85
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ATG4B-220ENST00000482507 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4B-220ENST00000482507 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.32■□□□□ 0.84
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ATG4B-220ENST00000482507 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-220ENST00000482507 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-220ENST00000482507 PLXNC1O60486 1568 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-220ENST00000482507 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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ATG4B-220ENST00000482507 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.3■□□□□ 0.84
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ATG4B-220ENST00000482507 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.29■□□□□ 0.84
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ATG4B-220ENST00000482507 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-220ENST00000482507 A2MP01023 1474 aa20.25■□□□□ 0.83
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ATG4B-220ENST00000482507 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-220ENST00000482507 ABCA6Q8N139 1617 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-220ENST00000482507 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.21■□□□□ 0.83
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ATG4B-220ENST00000482507 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-220ENST00000482507 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-220ENST00000482507 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-220ENST00000482507 NUDCQ9Y266 331 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-220ENST00000482507 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-220ENST00000482507 ATP10AO60312 1499 aa20.13■□□□□ 0.81
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ATG4B-220ENST00000482507 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-220ENST00000482507 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-220ENST00000482507 UNC13BO14795 1591 aa20.12■□□□□ 0.81
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ATG4B-220ENST00000482507 PLA2R1Q13018 1463 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-220ENST00000482507 KANK1Q14678 1352 aa20.11■□□□□ 0.81
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ATG4B-220ENST00000482507 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.08■□□□□ 0.81
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ATG4B-220ENST00000482507 RGL3Q3MIN7 710 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-220ENST00000482507 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-220ENST00000482507 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-220ENST00000482507 RALBP1Q15311 655 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-220ENST00000482507 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-220ENST00000482507 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-220ENST00000482507 DEPDC5O75140 1603 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-220ENST00000482507 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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ATG4B-220ENST00000482507 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20■□□□□ 0.79
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