RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-205ENST00000468532 DUOX2Q9NRD8 1548 aa48.13■■■■■ 5.3
CHKB-205ENST00000468532 FAM135AQ9P2D6 1515 aa48.12■■■■■ 5.29
CHKB-205ENST00000468532 KIF15Q9NS87 1388 aa48.11■■■■■ 5.29
CHKB-205ENST00000468532 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP48.1■■■■■ 5.29
CHKB-205ENST00000468532 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
CHKB-205ENST00000468532 PTPRKQ15262 1439 aa48.08■■■■■ 5.29
CHKB-205ENST00000468532 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa48.06■■■■■ 5.28
CHKB-205ENST00000468532 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa48.05■■■■■ 5.28
CHKB-205ENST00000468532 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP48.03■■■■■ 5.28
CHKB-205ENST00000468532 CHIC2Q9UKJ5 165 aa48.03■■■■■ 5.28
CHKB-205ENST00000468532 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa47.99■■■■■ 5.27
CHKB-205ENST00000468532 ERBINQ96RT1 1412 aa47.98■■■■■ 5.27
CHKB-205ENST00000468532 MROH1Q8NDA8 1641 aa47.97■■■■■ 5.27
CHKB-205ENST00000468532 MYO3AQ8NEV4 1616 aa47.97■■■■■ 5.27
CHKB-205ENST00000468532 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP47.93■■■■■ 5.26
CHKB-205ENST00000468532 PZPP20742 1482 aa47.93■■■■■ 5.26
CHKB-205ENST00000468532 ABCC3O15438 1527 aa47.91■■■■■ 5.26
CHKB-205ENST00000468532 NCOA1Q15788 1441 aa47.9■■■■■ 5.26
CHKB-205ENST00000468532 STRCQ7RTU9 1775 aa47.9■■■■■ 5.26
CHKB-205ENST00000468532 ADGRL2O95490 1459 aa47.9■■■■■ 5.26
CHKB-205ENST00000468532 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP47.89■■■■■ 5.26
CHKB-205ENST00000468532 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP47.86■■■■■ 5.25
CHKB-205ENST00000468532 CEP152O94986 1710 aa47.85■■■■■ 5.25
CHKB-205ENST00000468532 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP47.84■■■■■ 5.25
CHKB-205ENST00000468532 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP47.83■■■■■ 5.25
CHKB-205ENST00000468532 TNRQ92752 1358 aa47.81■■■■■ 5.24
CHKB-205ENST00000468532 DEPDC5O75140 1603 aa47.79■■■■■ 5.24
CHKB-205ENST00000468532 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa47.78■■■■■ 5.24
CHKB-205ENST00000468532 A2ML1A8K2U0 1454 aa47.73■■■■■ 5.23
CHKB-205ENST00000468532 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP47.73■■■■■ 5.234e-8■■■□□ 18
CHKB-205ENST00000468532 DMRT2Q9Y5R5 561 aa47.73■■■■■ 5.23
CHKB-205ENST00000468532 KANK1Q14678 1352 aa47.67■■■■■ 5.22
CHKB-205ENST00000468532 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP47.66■■■■■ 5.22
CHKB-205ENST00000468532 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa47.65■■■■■ 5.22
CHKB-205ENST00000468532 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa47.64■■■■■ 5.22
CHKB-205ENST00000468532 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP47.64■■■■■ 5.22
CHKB-205ENST00000468532 ERVK-7P63135 1459 aa47.63■■■■■ 5.22
CHKB-205ENST00000468532 PLA2R1Q13018 1463 aa47.62■■■■■ 5.21
CHKB-205ENST00000468532 PTPRTO14522 1441 aa47.62■■■■■ 5.21
CHKB-205ENST00000468532 ITGAEP38570 1179 aa47.61■■■■■ 5.21
CHKB-205ENST00000468532 NLRP1Q9C000 1473 aa47.6■■■■■ 5.21
CHKB-205ENST00000468532 ROCK1Q13464 1354 aa47.58■■■■■ 5.21
CHKB-205ENST00000468532 VWDEQ8N2E2 1590 aa47.58■■■■■ 5.21
CHKB-205ENST00000468532 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa47.57■■■■■ 5.21
CHKB-205ENST00000468532 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa47.56■■■■■ 5.2
CHKB-205ENST00000468532 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP47.54■■■■■ 5.2
CHKB-205ENST00000468532 LMTK2Q8IWU2 1503 aa47.54■■■■■ 5.2
CHKB-205ENST00000468532 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
CHKB-205ENST00000468532 PKD2Q13563 968 aa47.49■■■■■ 5.19
CHKB-205ENST00000468532 UGGT1Q9NYU2 1555 aa47.49■■■■■ 5.19
CHKB-205ENST00000468532 EFCAB6Q5THR3 1501 aa47.41■■■■■ 5.18
CHKB-205ENST00000468532 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
CHKB-205ENST00000468532 UNC13BO14795 1591 aa47.41■■■■■ 5.18
CHKB-205ENST00000468532 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP47.4■■■■■ 5.18
CHKB-205ENST00000468532 CERKQ8TCT0 537 aa47.36■■■■■ 5.17
CHKB-205ENST00000468532 FBXO41Q8TF61 875 aa47.33■■■■■ 5.17
CHKB-205ENST00000468532 UBR1Q8IWV7 1749 aa47.31■■■■■ 5.16
CHKB-205ENST00000468532 TET3O43151 1660 aa47.3■■■■■ 5.16
CHKB-205ENST00000468532 NEURL4Q96JN8 1562 aa47.3■■■■■ 5.16
CHKB-205ENST00000468532 ANKLE2Q86XL3 938 aa47.27■■■■■ 5.16
CHKB-205ENST00000468532 GCC2Q8IWJ2 1684 aa47.25■■■■■ 5.15
CHKB-205ENST00000468532 SYNMO15061 1565 aa47.24■■■■■ 5.15
CHKB-205ENST00000468532 PIK3C2BO00750 1634 aa47.23■■■■■ 5.15
CHKB-205ENST00000468532 LTBP4Q8N2S1 1624 aa47.23■■■■■ 5.15
CHKB-205ENST00000468532 NOS1P29475 1434 aa47.22■■■■■ 5.15
CHKB-205ENST00000468532 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
CHKB-205ENST00000468532 IQGAP3Q86VI3 1631 aa47.21■■■■■ 5.15
CHKB-205ENST00000468532 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP47.16■■■■■ 5.14
CHKB-205ENST00000468532 NUP155O75694 1391 aa47.15■■■■■ 5.14
CHKB-205ENST00000468532 MED14O60244 1454 aa47.13■■■■■ 5.13
CHKB-205ENST00000468532 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP47.13■■■■■ 5.13
CHKB-205ENST00000468532 IDI1Q13907 227 aa47.12■■■■■ 5.13
CHKB-205ENST00000468532 E9PCH4 1651 aa47.11■■■■■ 5.13
CHKB-205ENST00000468532 STAG3Q9UJ98 1225 aa47.11■■■■■ 5.13
CHKB-205ENST00000468532 NAIPQ13075 1403 aa47.09■■■■■ 5.13
CHKB-205ENST00000468532 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
CHKB-205ENST00000468532 IQGAP1P46940 1657 aa47.08■■■■■ 5.13
CHKB-205ENST00000468532 SLIT1O75093 1534 aa47.08■■■■■ 5.13
CHKB-205ENST00000468532 ARHGAP23Q9P227 1491 aa47.08■■■■■ 5.13
CHKB-205ENST00000468532 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP47.04■■■■■ 5.12
CHKB-205ENST00000468532 SLC52A1Q9NWF4 448 aa47.04■■■■■ 5.12
CHKB-205ENST00000468532 ADGRB3O60242 1522 aa47.02■■■■■ 5.12
CHKB-205ENST00000468532 HFM1A2PYH4 1435 aa46.99■■■■■ 5.11
CHKB-205ENST00000468532 TMEM2Q9UHN6 1383 aa46.98■■■■■ 5.11
CHKB-205ENST00000468532 LTKP29376 864 aa46.97■■■■■ 5.11
CHKB-205ENST00000468532 TXNDC2Q86VQ3 553 aa46.97■■■■■ 5.11
CHKB-205ENST00000468532 IQSEC2Q5JU85 1478 aa46.95■■■■■ 5.11
CHKB-205ENST00000468532 EID1Q9Y6B2 187 aa46.95■■■■■ 5.11
CHKB-205ENST00000468532 MYO5BQ9ULV0 1848 aa46.88■■■■■ 5.09
CHKB-205ENST00000468532 CPS1P31327 1500 aa46.84■■■■■ 5.09
CHKB-205ENST00000468532 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa46.83■■■■■ 5.09
CHKB-205ENST00000468532 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa46.79■■■■■ 5.08
CHKB-205ENST00000468532 TRIM52Q96A61 297 aa46.78■■■■■ 5.08
CHKB-205ENST00000468532 CHGAP10645 457 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
CHKB-205ENST00000468532 STRCP1A6NGW2 1772 aa46.73■■■■■ 5.07
CHKB-205ENST00000468532 ZFYVE9O95405 1425 aa46.71■■■■■ 5.07
CHKB-205ENST00000468532 RIMS2Q9UQ26 1411 aa46.7■■■■■ 5.07
CHKB-205ENST00000468532 UBAP1LF5GYI3 381 aa46.61■■■■■ 5.05
CHKB-205ENST00000468532 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP46.61■■■■■ 5.05
CHKB-205ENST00000468532 HDGFP51858 240 aaKnown RBP46.61■■■■■ 5.05
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