RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 NUP155O75694 1391 aa35.74■■■■□ 3.31
NME4-209ENST00000460297 ATP10AO60312 1499 aa35.74■■■■□ 3.31
NME4-209ENST00000460297 KIF3BO15066 747 aa35.72■■■■□ 3.31
NME4-209ENST00000460297 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.72■■■■□ 3.31
NME4-209ENST00000460297 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.72■■■■□ 3.31
NME4-209ENST00000460297 REREQ9P2R6 1566 aa35.7■■■■□ 3.3
NME4-209ENST00000460297 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.68■■■■□ 3.3
NME4-209ENST00000460297 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.68■■■■□ 3.3
NME4-209ENST00000460297 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
NME4-209ENST00000460297 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.67■■■■□ 3.3
NME4-209ENST00000460297 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
NME4-209ENST00000460297 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.66■■■■□ 3.3
NME4-209ENST00000460297 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.64■■■■□ 3.3
NME4-209ENST00000460297 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
NME4-209ENST00000460297 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.64■■■■□ 3.3
NME4-209ENST00000460297 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.6■■■■□ 3.29
NME4-209ENST00000460297 AGLP35573 1532 aa35.58■■■■□ 3.29
NME4-209ENST00000460297 FOXD1Q16676 465 aa35.56■■■■□ 3.28
NME4-209ENST00000460297 PKD2Q13563 968 aa35.54■■■■□ 3.28
NME4-209ENST00000460297 GGT6Q6P531 493 aa35.53■■■■□ 3.28
NME4-209ENST00000460297 KANK1Q14678 1352 aa35.52■■■■□ 3.28
NME4-209ENST00000460297 CEP152O94986 1710 aa35.48■■■■□ 3.27
NME4-209ENST00000460297 TET3O43151 1660 aa35.47■■■■□ 3.27
NME4-209ENST00000460297 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.45■■■■□ 3.27
NME4-209ENST00000460297 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.44■■■■□ 3.26
NME4-209ENST00000460297 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.43■■■■□ 3.26
NME4-209ENST00000460297 E9PCH4 1651 aa35.43■■■■□ 3.26
NME4-209ENST00000460297 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
NME4-209ENST00000460297 ABCC3O15438 1527 aa35.41■■■■□ 3.26
NME4-209ENST00000460297 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
NME4-209ENST00000460297 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.38■■■■□ 3.25
NME4-209ENST00000460297 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.38■■■■□ 3.25
NME4-209ENST00000460297 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
NME4-209ENST00000460297 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.33■■■■□ 3.25
NME4-209ENST00000460297 NEUROD1Q13562 356 aa35.33■■■■□ 3.25
NME4-209ENST00000460297 MLECQ14165 292 aa35.32■■■■□ 3.24
NME4-209ENST00000460297 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.3■■■■□ 3.24
NME4-209ENST00000460297 PLA2R1Q13018 1463 aa35.3■■■■□ 3.24
NME4-209ENST00000460297 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
NME4-209ENST00000460297 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.25■■■■□ 3.23
NME4-209ENST00000460297 NPATQ14207 1427 aa35.25■■■■□ 3.23
NME4-209ENST00000460297 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
NME4-209ENST00000460297 PTPRTO14522 1441 aa35.22■■■■□ 3.23
NME4-209ENST00000460297 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
NME4-209ENST00000460297 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.2■■■■□ 3.23
NME4-209ENST00000460297 TRPM2O94759 1503 aa35.19■■■■□ 3.22
NME4-209ENST00000460297 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.15■■■■□ 3.22
NME4-209ENST00000460297 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.12■■■■□ 3.21
NME4-209ENST00000460297 TONSLQ96HA7 1378 aa35.11■■■■□ 3.21
NME4-209ENST00000460297 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
NME4-209ENST00000460297 CLTCL1P53675 1640 aa35.09■■■■□ 3.21
NME4-209ENST00000460297 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.09■■■■□ 3.21
NME4-209ENST00000460297 NOS1P29475 1434 aa35.09■■■■□ 3.21
NME4-209ENST00000460297 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.08■■■■□ 3.21
NME4-209ENST00000460297 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.07■■■■□ 3.2
NME4-209ENST00000460297 MROH2AA6NES4 1674 aa35.07■■■■□ 3.2
NME4-209ENST00000460297 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.06■■■■□ 3.2
NME4-209ENST00000460297 ZMYM3Q14202 1370 aa35.05■■■■□ 3.2
NME4-209ENST00000460297 SYNMO15061 1565 aa35.04■■■■□ 3.2
NME4-209ENST00000460297 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
NME4-209ENST00000460297 ERVK-7P63135 1459 aa35■■■■□ 3.19
NME4-209ENST00000460297 L3MBTL2Q969R5 705 aa35■■■■□ 3.19
NME4-209ENST00000460297 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.99■■■■□ 3.19
NME4-209ENST00000460297 PIK3C2BO00750 1634 aa34.97■■■■□ 3.19
NME4-209ENST00000460297 MADDQ8WXG6 1647 aa34.97■■■■□ 3.19
NME4-209ENST00000460297 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.97■■■■□ 3.19
NME4-209ENST00000460297 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.95■■■■□ 3.18
NME4-209ENST00000460297 KIF1BO60333 1816 aa34.94■■■■□ 3.18
NME4-209ENST00000460297 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
NME4-209ENST00000460297 C3P01024 1663 aa34.94■■■■□ 3.18
NME4-209ENST00000460297 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
NME4-209ENST00000460297 RGL3Q3MIN7 710 aa34.89■■■■□ 3.18
NME4-209ENST00000460297 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.88■■■■□ 3.17
NME4-209ENST00000460297 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
NME4-209ENST00000460297 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.86■■■■□ 3.17
NME4-209ENST00000460297 IDI1Q13907 227 aa34.86■■■■□ 3.17
NME4-209ENST00000460297 ADGRB3O60242 1522 aa34.84■■■■□ 3.17
NME4-209ENST00000460297 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.79■■■■□ 3.16
NME4-209ENST00000460297 TNRQ92752 1358 aa34.78■■■■□ 3.16
NME4-209ENST00000460297 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.77■■■■□ 3.16
NME4-209ENST00000460297 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.77■■■■□ 3.16
NME4-209ENST00000460297 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
NME4-209ENST00000460297 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.75■■■■□ 3.15
NME4-209ENST00000460297 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.73■■■■□ 3.15
NME4-209ENST00000460297 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.73■■■■□ 3.15
NME4-209ENST00000460297 IFT172Q9UG01 1749 aa34.73■■■■□ 3.15
NME4-209ENST00000460297 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.71■■■■□ 3.15
NME4-209ENST00000460297 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
NME4-209ENST00000460297 PPLO60437 1756 aa34.67■■■■□ 3.14
NME4-209ENST00000460297 PTPRMP28827 1452 aa34.64■■■■□ 3.14
NME4-209ENST00000460297 NLRP1Q9C000 1473 aa34.64■■■■□ 3.14
NME4-209ENST00000460297 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.64■■■■□ 3.14
NME4-209ENST00000460297 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.64■■■■□ 3.14
NME4-209ENST00000460297 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
NME4-209ENST00000460297 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.61■■■■□ 3.13
NME4-209ENST00000460297 STAC3Q96MF2 364 aa34.61■■■■□ 3.13
NME4-209ENST00000460297 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa34.61■■■■□ 3.13
NME4-209ENST00000460297 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.61■■■■□ 3.13
NME4-209ENST00000460297 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.6■■■■□ 3.13
NME4-209ENST00000460297 MYOM2P54296 1465 aa34.6■■■■□ 3.13
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