RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455982.2

DENR-202, Transcript of density regulated re-initiation and release factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene DENR, Length 1,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENR-202ENST00000455982 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.25■■■■■ 4.19
DENR-202ENST00000455982 C3P01024 1663 aa41.25■■■■■ 4.19
DENR-202ENST00000455982 PTPRKQ15262 1439 aa41.25■■■■■ 4.19
DENR-202ENST00000455982 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.24■■■■■ 4.19
DENR-202ENST00000455982 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
DENR-202ENST00000455982 ROCK1Q13464 1354 aa41.18■■■■■ 4.18
DENR-202ENST00000455982 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.18■■■■■ 4.18
DENR-202ENST00000455982 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.16■■■■■ 4.18
DENR-202ENST00000455982 ZMYM3Q14202 1370 aa41.12■■■■■ 4.17
DENR-202ENST00000455982 DEPDC5O75140 1603 aa41.12■■■■■ 4.17
DENR-202ENST00000455982 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
DENR-202ENST00000455982 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
DENR-202ENST00000455982 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
DENR-202ENST00000455982 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
DENR-202ENST00000455982 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.09■■■■■ 4.17
DENR-202ENST00000455982 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.06■■■■■ 4.16
DENR-202ENST00000455982 NPATQ14207 1427 aa41.05■■■■■ 4.16
DENR-202ENST00000455982 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.04■■■■■ 4.16
DENR-202ENST00000455982 ABCC3O15438 1527 aa41.04■■■■■ 4.16
DENR-202ENST00000455982 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.04■■■■■ 4.16
DENR-202ENST00000455982 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.04■■■■■ 4.16
DENR-202ENST00000455982 ITGAEP38570 1179 aa41.02■■■■■ 4.16
DENR-202ENST00000455982 PZPP20742 1482 aa40.96■■■■■ 4.15
DENR-202ENST00000455982 CEP152O94986 1710 aa40.96■■■■■ 4.15
DENR-202ENST00000455982 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.94■■■■■ 4.14
DENR-202ENST00000455982 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.92■■■■■ 4.14
DENR-202ENST00000455982 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.91■■■■■ 4.14
DENR-202ENST00000455982 KANK1Q14678 1352 aa40.89■■■■■ 4.14
DENR-202ENST00000455982 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.88■■■■■ 4.13
DENR-202ENST00000455982 UNC13BO14795 1591 aa40.87■■■■■ 4.13
DENR-202ENST00000455982 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.83■■■■■ 4.13
DENR-202ENST00000455982 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.13
DENR-202ENST00000455982 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.83■■■■■ 4.13
DENR-202ENST00000455982 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.82■■■■■ 4.13
DENR-202ENST00000455982 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
DENR-202ENST00000455982 NAIPQ13075 1403 aa40.78■■■■■ 4.12
DENR-202ENST00000455982 HFM1A2PYH4 1435 aa40.77■■■■■ 4.12
DENR-202ENST00000455982 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.76■■■■■ 4.12
DENR-202ENST00000455982 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
DENR-202ENST00000455982 TNRQ92752 1358 aa40.74■■■■■ 4.11
DENR-202ENST00000455982 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.73■■■■■ 4.11
DENR-202ENST00000455982 ERVK-7P63135 1459 aa40.73■■■■■ 4.11
DENR-202ENST00000455982 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
DENR-202ENST00000455982 HSPA2P54652 639 aa40.7■■■■■ 4.11
DENR-202ENST00000455982 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.7■■■■■ 4.11
DENR-202ENST00000455982 TET3O43151 1660 aa40.69■■■■■ 4.1
DENR-202ENST00000455982 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
DENR-202ENST00000455982 NLRP1Q9C000 1473 aa40.65■■■■■ 4.1
DENR-202ENST00000455982 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.64■■■■■ 4.1
DENR-202ENST00000455982 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
DENR-202ENST00000455982 NUP155O75694 1391 aa40.59■■■■■ 4.09
DENR-202ENST00000455982 STRCQ7RTU9 1775 aa40.53■■■■■ 4.08
DENR-202ENST00000455982 NOS1P29475 1434 aa40.52■■■■■ 4.08
DENR-202ENST00000455982 E9PCH4 1651 aa40.51■■■■■ 4.08
DENR-202ENST00000455982 PLA2R1Q13018 1463 aa40.51■■■■■ 4.07
DENR-202ENST00000455982 SYNMO15061 1565 aa40.48■■■■■ 4.07
DENR-202ENST00000455982 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.48■■■■■ 4.07
DENR-202ENST00000455982 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.4■■■■■ 4.06
DENR-202ENST00000455982 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
DENR-202ENST00000455982 PIK3C2BO00750 1634 aa40.38■■■■■ 4.05
DENR-202ENST00000455982 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
DENR-202ENST00000455982 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.36■■■■■ 4.05
DENR-202ENST00000455982 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.34■■■■■ 4.05
DENR-202ENST00000455982 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.33■■■■■ 4.05
DENR-202ENST00000455982 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
DENR-202ENST00000455982 PTPRTO14522 1441 aa40.32■■■■■ 4.04
DENR-202ENST00000455982 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
DENR-202ENST00000455982 PKD2Q13563 968 aa40.31■■■■■ 4.04
DENR-202ENST00000455982 TRIM52Q96A61 297 aa40.3■■■■■ 4.04
DENR-202ENST00000455982 IDI1Q13907 227 aa40.29■■■■■ 4.04
DENR-202ENST00000455982 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.28■■■■■ 4.04
DENR-202ENST00000455982 ADGRB3O60242 1522 aa40.26■■■■■ 4.04
DENR-202ENST00000455982 SLIT1O75093 1534 aa40.24■■■■■ 4.03
DENR-202ENST00000455982 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.23■■■■■ 4.03
DENR-202ENST00000455982 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.23■■■■■ 4.03
DENR-202ENST00000455982 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.23■■■■■ 4.03
DENR-202ENST00000455982 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.22■■■■■ 4.03
DENR-202ENST00000455982 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.19■■■■■ 4.02
DENR-202ENST00000455982 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
DENR-202ENST00000455982 TRPM2O94759 1503 aa40.16■■■■■ 4.02
DENR-202ENST00000455982 MED14O60244 1454 aa40.16■■■■■ 4.02
DENR-202ENST00000455982 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.16■■■■■ 4.02
DENR-202ENST00000455982 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.16■■■■■ 4.02
DENR-202ENST00000455982 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.14■■■■■ 4.02
DENR-202ENST00000455982 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
DENR-202ENST00000455982 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.12■■■■■ 4.01
DENR-202ENST00000455982 HRCP23327 699 aa40.09■■■■■ 4.01
DENR-202ENST00000455982 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.07■■■■■ 4.01
DENR-202ENST00000455982 IQGAP1P46940 1657 aa40.06■■■■■ 4
DENR-202ENST00000455982 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
DENR-202ENST00000455982 CLTCL1P53675 1640 aa40.05■■■■■ 4
DENR-202ENST00000455982 EID1Q9Y6B2 187 aa40.02■■■■■ 4
DENR-202ENST00000455982 LTKP29376 864 aa40.01■■■■■ 4
DENR-202ENST00000455982 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40■■■■□ 3.99
DENR-202ENST00000455982 ZFYVE9O95405 1425 aa39.99■■■■□ 3.99
DENR-202ENST00000455982 KIF1BO60333 1816 aa39.95■■■■□ 3.99
DENR-202ENST00000455982 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.93■■■■□ 3.98
DENR-202ENST00000455982 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
DENR-202ENST00000455982 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.92■■■■□ 3.98
DENR-202ENST00000455982 FOXD1Q16676 465 aa39.92■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms