RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453632.5

TTC28-AS1-218, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TNRQ92752 1358 aa19.54■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.51■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.51■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa19.51■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 IQGAP1P46940 1657 aa19.5■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DEPDC5O75140 1603 aa19.5■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.48■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PZPP20742 1482 aa19.48■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MED14O60244 1454 aa19.47■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SYNMO15061 1565 aa19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 UGGT1Q9NYU2 1555 aa19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KDM5DQ9BY66 1539 aa19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-218ENST00000453632 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NLRP1Q9C000 1473 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIF3BO15066 747 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MIA2Q96PC5 1412 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 POTEAQ6S8J7 498 aa19.39■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MBD5Q9P267 1494 aa19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TIAM1Q13009 1591 aa19.37■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.37■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-218ENST00000453632 UBR1Q8IWV7 1749 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.29■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CCDC141Q6ZP82 1450 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa19.26■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ERVK-7P63135 1459 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCC3O15438 1527 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.23■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CEP152O94986 1710 aa19.23■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.23■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LTKP29376 864 aa19.21■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NCOA2Q15596 1464 aa19.21■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.19■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CEP162Q5TB80 1403 aa19.17■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.17■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SLIT1O75093 1534 aa19.17■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TMEM94Q12767 1356 aa19.17■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PHLPP1O60346 1717 aa19.17■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MROH1Q8NDA8 1641 aa19.16■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.15■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MAP3K1Q13233 1512 aa19.15■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.13■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PIK3C2BO00750 1634 aa19.12■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-218ENST00000453632 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TSPY4P0CV99 314 aa19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TSPY10P0CW01 314 aa19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EID1Q9Y6B2 187 aa19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.1■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TRIM52Q96A61 297 aa19.08■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 JCADQ9P266 1359 aa19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KCNA6P17658 529 aa19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LRP6O75581 1613 aa19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TET3O43151 1660 aa19.03■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NWD1Q149M9 1564 aa19.02■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.02■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MSH6P52701 1360 aa19.02■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EFCAB6Q5THR3 1501 aa19.01■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SLAIN2Q9P270 581 aa19.01■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa19■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa18.98■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.98■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SHPRHQ149N8 1683 aa18.96■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BCANQ96GW7 911 aa18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-218ENST00000453632 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RXRBP28702 533 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-218ENST00000453632 IDI1Q13907 227 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ADGRB3O60242 1522 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-218ENST00000453632 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms