RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444811.6

NELFE-206, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-206ENST00000444811 ZMYM3Q14202 1370 aa30.31■■■□□ 2.44
NELFE-206ENST00000444811 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.3■■■□□ 2.44
NELFE-206ENST00000444811 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
NELFE-206ENST00000444811 ADGRL2O95490 1459 aa30.28■■■□□ 2.44
NELFE-206ENST00000444811 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.28■■■□□ 2.44
NELFE-206ENST00000444811 NCOA1Q15788 1441 aa30.26■■■□□ 2.43
NELFE-206ENST00000444811 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.26■■■□□ 2.43
NELFE-206ENST00000444811 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.26■■■□□ 2.43
NELFE-206ENST00000444811 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.26■■■□□ 2.43
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NELFE-206ENST00000444811 ERBINQ96RT1 1412 aa30.24■■■□□ 2.43
NELFE-206ENST00000444811 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.24■■■□□ 2.43
NELFE-206ENST00000444811 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.24■■■□□ 2.43
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NELFE-206ENST00000444811 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.18■■■□□ 2.42
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NELFE-206ENST00000444811 PZPP20742 1482 aa30.12■■■□□ 2.41
NELFE-206ENST00000444811 CEP152O94986 1710 aa30.1■■■□□ 2.41
NELFE-206ENST00000444811 ROCK1Q13464 1354 aa30.09■■■□□ 2.41
NELFE-206ENST00000444811 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.07■■■□□ 2.4
NELFE-206ENST00000444811 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
NELFE-206ENST00000444811 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.07■■■□□ 2.4
NELFE-206ENST00000444811 ITGAEP38570 1179 aa30.06■■■□□ 2.4
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NELFE-206ENST00000444811 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.03■■■□□ 2.4
NELFE-206ENST00000444811 STRCQ7RTU9 1775 aa30.03■■■□□ 2.4
NELFE-206ENST00000444811 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.44e-10■■□□□ 12.8
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NELFE-206ENST00000444811 TNRQ92752 1358 aa30■■■□□ 2.39
NELFE-206ENST00000444811 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
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NELFE-206ENST00000444811 KANK1Q14678 1352 aa29.97■■■□□ 2.39
NELFE-206ENST00000444811 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.97■■■□□ 2.39
NELFE-206ENST00000444811 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.96■■■□□ 2.39
NELFE-206ENST00000444811 ERVK-7P63135 1459 aa29.95■■■□□ 2.39
NELFE-206ENST00000444811 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.93■■■□□ 2.38
NELFE-206ENST00000444811 UNC13BO14795 1591 aa29.93■■■□□ 2.38
NELFE-206ENST00000444811 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
NELFE-206ENST00000444811 NLRP1Q9C000 1473 aa29.87■■■□□ 2.37
NELFE-206ENST00000444811 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.86■■■□□ 2.37
NELFE-206ENST00000444811 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.85■■■□□ 2.37
NELFE-206ENST00000444811 PLA2R1Q13018 1463 aa29.84■■■□□ 2.37
NELFE-206ENST00000444811 NAIPQ13075 1403 aa29.83■■■□□ 2.37
NELFE-206ENST00000444811 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.82■■■□□ 2.36
NELFE-206ENST00000444811 TET3O43151 1660 aa29.81■■■□□ 2.36
NELFE-206ENST00000444811 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.8■■■□□ 2.36
NELFE-206ENST00000444811 PTPRTO14522 1441 aa29.79■■■□□ 2.36
NELFE-206ENST00000444811 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.78■■■□□ 2.36
NELFE-206ENST00000444811 HFM1A2PYH4 1435 aa29.77■■■□□ 2.36
NELFE-206ENST00000444811 NOS1P29475 1434 aa29.77■■■□□ 2.36
NELFE-206ENST00000444811 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.76■■■□□ 2.36
NELFE-206ENST00000444811 SYNMO15061 1565 aa29.75■■■□□ 2.35
NELFE-206ENST00000444811 NUP155O75694 1391 aa29.75■■■□□ 2.35
NELFE-206ENST00000444811 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
NELFE-206ENST00000444811 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.71■■■□□ 2.35
NELFE-206ENST00000444811 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.71■■■□□ 2.35
NELFE-206ENST00000444811 PKD2Q13563 968 aa29.71■■■□□ 2.35
NELFE-206ENST00000444811 E9PCH4 1651 aa29.71■■■□□ 2.35
NELFE-206ENST00000444811 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
NELFE-206ENST00000444811 PIK3C2BO00750 1634 aa29.68■■■□□ 2.34
NELFE-206ENST00000444811 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.67■■■□□ 2.34
NELFE-206ENST00000444811 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
NELFE-206ENST00000444811 IDI1Q13907 227 aa29.65■■■□□ 2.34
NELFE-206ENST00000444811 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
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NELFE-206ENST00000444811 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.6■■■□□ 2.33
NELFE-206ENST00000444811 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.59■■■□□ 2.33
NELFE-206ENST00000444811 SLIT1O75093 1534 aa29.59■■■□□ 2.33
NELFE-206ENST00000444811 MED14O60244 1454 aa29.57■■■□□ 2.32
NELFE-206ENST00000444811 ADGRB3O60242 1522 aa29.56■■■□□ 2.32
NELFE-206ENST00000444811 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.54■■■□□ 2.32
NELFE-206ENST00000444811 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
NELFE-206ENST00000444811 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.52■■■□□ 2.32
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NELFE-206ENST00000444811 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.52■■■□□ 2.32
NELFE-206ENST00000444811 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
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NELFE-206ENST00000444811 ILDR2Q71H61 639 aa29.51■■■□□ 2.31
NELFE-206ENST00000444811 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.5■■■□□ 2.31
NELFE-206ENST00000444811 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.5■■■□□ 2.31
NELFE-206ENST00000444811 IQGAP1P46940 1657 aa29.5■■■□□ 2.31
NELFE-206ENST00000444811 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.49■■■□□ 2.31
NELFE-206ENST00000444811 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
NELFE-206ENST00000444811 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.48■■■□□ 2.31
NELFE-206ENST00000444811 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.47■■■□□ 2.31
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NELFE-206ENST00000444811 EID1Q9Y6B2 187 aa29.42■■■□□ 2.3
NELFE-206ENST00000444811 TRPM2O94759 1503 aa29.41■■■□□ 2.3
NELFE-206ENST00000444811 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
NELFE-206ENST00000444811 ZFYVE9O95405 1425 aa29.4■■■□□ 2.3
NELFE-206ENST00000444811 CLTCL1P53675 1640 aa29.38■■■□□ 2.29
NELFE-206ENST00000444811 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.38■■■□□ 2.29
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