RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444811.6

NELFE-206, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-206ENST00000444811 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.1■■■■■ 5.29
NELFE-206ENST00000444811 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.79■■■■■ 4.44
NELFE-206ENST00000444811 ABCC9O60706 1549 aa41.95■■■■■ 4.31
NELFE-206ENST00000444811 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.29■■■■■ 4.04
NELFE-206ENST00000444811 NACADO15069 1562 aa40.23■■■■■ 4.03
NELFE-206ENST00000444811 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.13■■■■■ 4.01
NELFE-206ENST00000444811 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4
NELFE-206ENST00000444811 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.99■■■■□ 3.99
NELFE-206ENST00000444811 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.79■■■■□ 3.96
NELFE-206ENST00000444811 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.67■■■■□ 3.94
NELFE-206ENST00000444811 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.44■■■■□ 3.9
NELFE-206ENST00000444811 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.19■■■■□ 3.86
NELFE-206ENST00000444811 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.16■■■■□ 3.86
NELFE-206ENST00000444811 SCRIBQ14160 1630 aa39.04■■■■□ 3.84
NELFE-206ENST00000444811 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.66■■■■□ 3.78
NELFE-206ENST00000444811 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
NELFE-206ENST00000444811 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.95■■■■□ 3.67
NELFE-206ENST00000444811 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.79■■■■□ 3.64
NELFE-206ENST00000444811 SMARCA4P51532 1647 aa37.34■■■■□ 3.57
NELFE-206ENST00000444811 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
NELFE-206ENST00000444811 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.16■■■■□ 3.54
NELFE-206ENST00000444811 NCAPD3P42695 1498 aa37.14■■■■□ 3.54
NELFE-206ENST00000444811 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.09■■■■□ 3.53
NELFE-206ENST00000444811 SMARCA2P51531 1590 aa37.08■■■■□ 3.53
NELFE-206ENST00000444811 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.99■■■■□ 3.51
NELFE-206ENST00000444811 HMGXB3Q12766 1538 aa36.95■■■■□ 3.51
NELFE-206ENST00000444811 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
NELFE-206ENST00000444811 WIZO95785 1651 aa36.67■■■■□ 3.46
NELFE-206ENST00000444811 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
NELFE-206ENST00000444811 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.5■■■■□ 3.43
NELFE-206ENST00000444811 NESP48681 1621 aa36.3■■■■□ 3.4
NELFE-206ENST00000444811 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
NELFE-206ENST00000444811 CUX2O14529 1486 aa36.19■■■■□ 3.38
NELFE-206ENST00000444811 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.16■■■■□ 3.38
NELFE-206ENST00000444811 ERCC6Q03468 1493 aa36.14■■■■□ 3.38
NELFE-206ENST00000444811 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.04■■■■□ 3.36
NELFE-206ENST00000444811 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.9■■■■□ 3.34
NELFE-206ENST00000444811 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.87■■■■□ 3.33
NELFE-206ENST00000444811 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.85■■■■□ 3.33
NELFE-206ENST00000444811 CFTRP13569 1480 aa35.83■■■■□ 3.33
NELFE-206ENST00000444811 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
NELFE-206ENST00000444811 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.63■■■■□ 3.29
NELFE-206ENST00000444811 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.58■■■■□ 3.29
NELFE-206ENST00000444811 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.57■■■■□ 3.28
NELFE-206ENST00000444811 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
NELFE-206ENST00000444811 PRDM2Q13029 1718 aa35.54■■■■□ 3.28
NELFE-206ENST00000444811 WDR62O43379 1518 aa35.47■■■■□ 3.27
NELFE-206ENST00000444811 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
NELFE-206ENST00000444811 TOPBP1Q92547 1522 aa35.07■■■■□ 3.21
NELFE-206ENST00000444811 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.01■■■■□ 3.2
NELFE-206ENST00000444811 ABCC8Q09428 1581 aa35■■■■□ 3.19
NELFE-206ENST00000444811 IFT140Q96RY7 1462 aa34.85■■■■□ 3.17
NELFE-206ENST00000444811 CUX1P39880 1505 aa34.79■■■■□ 3.16
NELFE-206ENST00000444811 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
NELFE-206ENST00000444811 TRIM41Q8WV44 630 aa34.74■■■■□ 3.15
NELFE-206ENST00000444811 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
NELFE-206ENST00000444811 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
NELFE-206ENST00000444811 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.67■■■■□ 3.14
NELFE-206ENST00000444811 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.63■■■■□ 3.13
NELFE-206ENST00000444811 SOGA1O94964 1423 aa34.6■■■■□ 3.13
NELFE-206ENST00000444811 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
NELFE-206ENST00000444811 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.52■■■■□ 3.121e-10■■■■□ 20.9
NELFE-206ENST00000444811 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.5■■■■□ 3.11
NELFE-206ENST00000444811 OSCARQ8IYS5 282 aa34.49■■■■□ 3.11
NELFE-206ENST00000444811 SYNJ1O43426 1573 aa34.46■■■■□ 3.11
NELFE-206ENST00000444811 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.46■■■■□ 3.11
NELFE-206ENST00000444811 TOP2BQ02880 1626 aa34.45■■■■□ 3.11
NELFE-206ENST00000444811 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
NELFE-206ENST00000444811 WDR97A6NE52 1622 aa34.41■■■■□ 3.1
NELFE-206ENST00000444811 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.34■■■■□ 3.09
NELFE-206ENST00000444811 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.22■■■■□ 3.07
NELFE-206ENST00000444811 GRIN2BQ13224 1484 aa34.2■■■■□ 3.07
NELFE-206ENST00000444811 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.2■■■■□ 3.06
NELFE-206ENST00000444811 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.2■■■■□ 3.06
NELFE-206ENST00000444811 CHD1O14646 1710 aa34.16■■■■□ 3.06
NELFE-206ENST00000444811 PBRM1Q86U86 1689 aa34.15■■■■□ 3.06
NELFE-206ENST00000444811 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.13■■■■□ 3.05
NELFE-206ENST00000444811 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.13■■■■□ 3.05
NELFE-206ENST00000444811 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.13■■■■□ 3.05
NELFE-206ENST00000444811 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
NELFE-206ENST00000444811 FBLN2P98095 1184 aa34.04■■■■□ 3.04
NELFE-206ENST00000444811 SYNJ2O15056 1496 aa34■■■■□ 3.03
NELFE-206ENST00000444811 ARHGEF11O15085 1522 aa33.99■■■■□ 3.03
NELFE-206ENST00000444811 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
NELFE-206ENST00000444811 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.9■■■■□ 3.02
NELFE-206ENST00000444811 ADAMTS12P58397 1594 aa33.89■■■■□ 3.02
NELFE-206ENST00000444811 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.82■■■■□ 3
NELFE-206ENST00000444811 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.8■■■■□ 3
NELFE-206ENST00000444811 GRIN2AQ12879 1464 aa33.78■■■■□ 3
NELFE-206ENST00000444811 KIF27Q86VH2 1401 aa33.76■■■□□ 2.99
NELFE-206ENST00000444811 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.73■■■□□ 2.99
NELFE-206ENST00000444811 IGF1RP08069 1367 aa33.68■■■□□ 2.98
NELFE-206ENST00000444811 ARAP1Q96P48 1450 aa33.67■■■□□ 2.98
NELFE-206ENST00000444811 NUP160Q12769 1436 aa33.65■■■□□ 2.98
NELFE-206ENST00000444811 CEP170Q5SW79 1584 aa33.64■■■□□ 2.98
NELFE-206ENST00000444811 CUL7Q14999 1698 aa33.57■■■□□ 2.96
NELFE-206ENST00000444811 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.51■■■□□ 2.95
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NELFE-206ENST00000444811 SHROOM2Q13796 1616 aa33.41■■■□□ 2.94
NELFE-206ENST00000444811 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.37■■■□□ 2.93
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