RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NCOA1Q15788 1441 aa41.57■■■■■ 4.25
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTPRKQ15262 1439 aa41.56■■■■■ 4.24
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.54■■■■■ 4.24
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ERBINQ96RT1 1412 aa41.52■■■■■ 4.24
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.47■■■■■ 4.23
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.45■■■■■ 4.23
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.45■■■■■ 4.23
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZMYM3Q14202 1370 aa41.45■■■■■ 4.23
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ITGAEP38570 1179 aa41.44■■■■■ 4.22
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ROCK1Q13464 1354 aa41.39■■■■■ 4.22
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DEPDC5O75140 1603 aa41.38■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.37■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.37■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.35■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.33■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABCC3O15438 1527 aa41.33■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CEP152O94986 1710 aa41.32■■■■■ 4.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NPATQ14207 1427 aa41.29■■■■■ 4.2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PZPP20742 1482 aa41.23■■■■■ 4.19
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.23■■■■■ 4.19
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.22■■■■■ 4.19
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KANK1Q14678 1352 aa41.19■■■■■ 4.18
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.19■■■■■ 4.18
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.15■■■■■ 4.18
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UNC13BO14795 1591 aa41.14■■■■■ 4.18
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HSPA2P54652 639 aa41.12■■■■■ 4.17
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.11■■■■■ 4.17
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.11■■■■■ 4.17
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NAIPQ13075 1403 aa41.05■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.05■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TNRQ92752 1358 aa41.05■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.04■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ERVK-7P63135 1459 aa41.02■■■■■ 4.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HFM1A2PYH4 1435 aa41■■■■■ 4.15
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.99■■■■■ 4.15
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.97■■■■■ 4.15
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TET3O43151 1660 aa40.97■■■■■ 4.15
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.94■■■■■ 4.14
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NLRP1Q9C000 1473 aa40.9■■■■■ 4.14
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUP155O75694 1391 aa40.9■■■■■ 4.14
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STRCQ7RTU9 1775 aa40.88■■■■■ 4.13
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
HOXD-AS2-202ENST00000440016 E9PCH4 1651 aa40.83■■■■■ 4.13
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NOS1P29475 1434 aa40.79■■■■■ 4.12
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SYNMO15061 1565 aa40.78■■■■■ 4.12
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.78■■■■■ 4.12
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLA2R1Q13018 1463 aa40.76■■■■■ 4.12
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.73■■■■■ 4.11
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PIK3C2BO00750 1634 aa40.71■■■■■ 4.11
HOXD-AS2-202ENST00000440016 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM52Q96A61 297 aa40.67■■■■■ 4.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.64■■■■■ 4.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.63■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.63■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IDI1Q13907 227 aa40.62■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PKD2Q13563 968 aa40.6■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTPRTO14522 1441 aa40.59■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.59■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.59■■■■■ 4.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADGRB3O60242 1522 aa40.55■■■■■ 4.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.53■■■■■ 4.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.52■■■■■ 4.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLIT1O75093 1534 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.49■■■■■ 4.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.48■■■■■ 4.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.45■■■■■ 4.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.42■■■■■ 4.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MED14O60244 1454 aa40.42■■■■■ 4.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRPM2O94759 1503 aa40.42■■■■■ 4.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.38■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IQGAP1P46940 1657 aa40.37■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLTCL1P53675 1640 aa40.37■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LTKP29376 864 aa40.36■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.35■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EID1Q9Y6B2 187 aa40.32■■■■■ 4.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FOXD1Q16676 465 aa40.3■■■■■ 4.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HRCP23327 699 aa40.28■■■■■ 4.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIF1BO60333 1816 aa40.27■■■■■ 4.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZFYVE9O95405 1425 aa40.26■■■■■ 4.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.25■■■■■ 4.03
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