RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.73■■□□□ 1.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.73■■□□□ 1.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.73■■□□□ 1.55
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM5CP41229 1560 aa24.72■■□□□ 1.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.71■■□□□ 1.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.69■■□□□ 1.54
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.69■■□□□ 1.54
RALGPS1-208ENST00000424082 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
RALGPS1-208ENST00000424082 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.68■■□□□ 1.54
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF15Q9NS87 1388 aa24.67■■□□□ 1.54
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-208ENST00000424082 OSCARQ8IYS5 282 aa24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-208ENST00000424082 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-208ENST00000424082 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
RALGPS1-208ENST00000424082 TMC1Q8TDI8 760 aa24.64■■□□□ 1.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.62■■□□□ 1.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.61■■□□□ 1.53
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCH2O75038 1416 aa24.61■■□□□ 1.53
RALGPS1-208ENST00000424082 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.6■■□□□ 1.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP155O75694 1391 aa24.6■■□□□ 1.53
RALGPS1-208ENST00000424082 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-208ENST00000424082 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.57■■□□□ 1.52
RALGPS1-208ENST00000424082 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-208ENST00000424082 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-208ENST00000424082 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.55■■□□□ 1.52
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.53■■□□□ 1.52
RALGPS1-208ENST00000424082 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.52■■□□□ 1.52
RALGPS1-208ENST00000424082 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-208ENST00000424082 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCC1P33527 1531 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ASXL2Q76L83 1435 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-208ENST00000424082 RALBP1Q15311 655 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-208ENST00000424082 AFAP1Q8N556 730 aa24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-208ENST00000424082 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-208ENST00000424082 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-208ENST00000424082 E9PCH4 1651 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-208ENST00000424082 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-208ENST00000424082 PLXNC1O60486 1568 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-208ENST00000424082 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-208ENST00000424082 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.39■■□□□ 1.5
RALGPS1-208ENST00000424082 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 FANCAO15360 1455 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP13Q86W25 1043 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC13BO14795 1591 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE4AP27815 886 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 ERBINQ96RT1 1412 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 RGL3Q3MIN7 710 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 BACH2Q9BYV9 841 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRL1O94910 1474 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 MS4A1P11836 297 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 IL27Q8NEV9 243 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 USP35Q9P2H5 1018 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 NEFMP07197 916 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 PLA2R1Q13018 1463 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-208ENST00000424082 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-208ENST00000424082 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE3BQ13370 1112 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-208ENST00000424082 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-208ENST00000424082 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-208ENST00000424082 PLIN1O60240 522 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP7AQ04656 1500 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-208ENST00000424082 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-208ENST00000424082 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
RALGPS1-208ENST00000424082 A2MP01023 1474 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 CD109Q6YHK3 1445 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 TESK2Q96S53 571 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms