RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421939.5

CDK9-202, Transcript of cyclin dependent kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene CDK9, Length 702 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9-202ENST00000421939 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
CDK9-202ENST00000421939 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.69■■■■■ 4.1
CDK9-202ENST00000421939 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
CDK9-202ENST00000421939 NPATQ14207 1427 aa40.66■■■■■ 4.1
CDK9-202ENST00000421939 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.65■■■■■ 4.1
CDK9-202ENST00000421939 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.65■■■■■ 4.1
CDK9-202ENST00000421939 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.64■■■■■ 4.1
CDK9-202ENST00000421939 ERBINQ96RT1 1412 aa40.64■■■■■ 4.1
CDK9-202ENST00000421939 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.63■■■■■ 4.09
CDK9-202ENST00000421939 ADGRL2O95490 1459 aa40.63■■■■■ 4.09
CDK9-202ENST00000421939 NCOA1Q15788 1441 aa40.59■■■■■ 4.09
CDK9-202ENST00000421939 HSPA2P54652 639 aa40.59■■■■■ 4.09
CDK9-202ENST00000421939 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.59■■■■■ 4.09
CDK9-202ENST00000421939 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.57■■■■■ 4.08
CDK9-202ENST00000421939 PTPRKQ15262 1439 aa40.57■■■■■ 4.08
CDK9-202ENST00000421939 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
CDK9-202ENST00000421939 ABCC3O15438 1527 aa40.52■■■■■ 4.08
CDK9-202ENST00000421939 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.52■■■■■ 4.08
CDK9-202ENST00000421939 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
CDK9-202ENST00000421939 PZPP20742 1482 aa40.5■■■■■ 4.07
CDK9-202ENST00000421939 DEPDC5O75140 1603 aa40.47■■■■■ 4.07
CDK9-202ENST00000421939 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.46■■■■■ 4.07
CDK9-202ENST00000421939 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
CDK9-202ENST00000421939 CEP152O94986 1710 aa40.42■■■■■ 4.06
CDK9-202ENST00000421939 ROCK1Q13464 1354 aa40.39■■■■■ 4.06
CDK9-202ENST00000421939 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
CDK9-202ENST00000421939 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.38■■■■■ 4.05
CDK9-202ENST00000421939 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.38■■■■■ 4.05
CDK9-202ENST00000421939 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CDK9-202ENST00000421939 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CDK9-202ENST00000421939 TNRQ92752 1358 aa40.35■■■■■ 4.05
CDK9-202ENST00000421939 ITGAEP38570 1179 aa40.34■■■■■ 4.05
CDK9-202ENST00000421939 KANK1Q14678 1352 aa40.33■■■■■ 4.05
CDK9-202ENST00000421939 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.32■■■■■ 4.052e-7■■□□□ 11.9
CDK9-202ENST00000421939 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.29■■■■■ 4.04
CDK9-202ENST00000421939 STRCQ7RTU9 1775 aa40.28■■■■■ 4.04
CDK9-202ENST00000421939 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.27■■■■■ 4.04
CDK9-202ENST00000421939 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.26■■■■■ 4.04
CDK9-202ENST00000421939 ERVK-7P63135 1459 aa40.26■■■■■ 4.03
CDK9-202ENST00000421939 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.25■■■■■ 4.03
CDK9-202ENST00000421939 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.25■■■■■ 4.03
CDK9-202ENST00000421939 NLRP1Q9C000 1473 aa40.2■■■■■ 4.03
CDK9-202ENST00000421939 UNC13BO14795 1591 aa40.18■■■■■ 4.02
CDK9-202ENST00000421939 PLA2R1Q13018 1463 aa40.16■■■■■ 4.02
CDK9-202ENST00000421939 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.15■■■■■ 4.02
CDK9-202ENST00000421939 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.12■■■■■ 4.01
CDK9-202ENST00000421939 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
CDK9-202ENST00000421939 PTPRTO14522 1441 aa40.08■■■■■ 4.01
CDK9-202ENST00000421939 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.06■■■■■ 4
CDK9-202ENST00000421939 TET3O43151 1660 aa40.05■■■■■ 4
CDK9-202ENST00000421939 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.01■■■■■ 4
CDK9-202ENST00000421939 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.01■■■■■ 4
CDK9-202ENST00000421939 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40■■■■□ 3.99
CDK9-202ENST00000421939 PKD2Q13563 968 aa40■■■■□ 3.99
CDK9-202ENST00000421939 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
CDK9-202ENST00000421939 NAIPQ13075 1403 aa39.99■■■■□ 3.99
CDK9-202ENST00000421939 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
CDK9-202ENST00000421939 NOS1P29475 1434 aa39.96■■■■□ 3.99
CDK9-202ENST00000421939 SYNMO15061 1565 aa39.95■■■■□ 3.99
CDK9-202ENST00000421939 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
CDK9-202ENST00000421939 NUP155O75694 1391 aa39.94■■■■□ 3.98
CDK9-202ENST00000421939 HFM1A2PYH4 1435 aa39.93■■■■□ 3.98
CDK9-202ENST00000421939 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.93■■■■□ 3.98
CDK9-202ENST00000421939 PIK3C2BO00750 1634 aa39.89■■■■□ 3.98
CDK9-202ENST00000421939 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.88■■■■□ 3.97
CDK9-202ENST00000421939 E9PCH4 1651 aa39.86■■■■□ 3.97
CDK9-202ENST00000421939 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.83■■■■□ 3.97
CDK9-202ENST00000421939 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
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CDK9-202ENST00000421939 SLIT1O75093 1534 aa39.77■■■■□ 3.96
CDK9-202ENST00000421939 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.77■■■■□ 3.96
CDK9-202ENST00000421939 ADGRB3O60242 1522 aa39.76■■■■□ 3.96
CDK9-202ENST00000421939 MED14O60244 1454 aa39.76■■■■□ 3.96
CDK9-202ENST00000421939 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.76■■■■□ 3.96
CDK9-202ENST00000421939 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.74■■■■□ 3.95
CDK9-202ENST00000421939 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
CDK9-202ENST00000421939 CERKQ8TCT0 537 aa39.72■■■■□ 3.95
CDK9-202ENST00000421939 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.72■■■■□ 3.95
CDK9-202ENST00000421939 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
CDK9-202ENST00000421939 IQGAP1P46940 1657 aa39.69■■■■□ 3.94
CDK9-202ENST00000421939 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.69■■■■□ 3.94
CDK9-202ENST00000421939 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
CDK9-202ENST00000421939 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
CDK9-202ENST00000421939 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.62■■■■□ 3.93
CDK9-202ENST00000421939 TRIM52Q96A61 297 aa39.62■■■■□ 3.93
CDK9-202ENST00000421939 LTKP29376 864 aa39.61■■■■□ 3.93
CDK9-202ENST00000421939 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.61■■■■□ 3.93
CDK9-202ENST00000421939 FBXO41Q8TF61 875 aa39.61■■■■□ 3.93
CDK9-202ENST00000421939 EID1Q9Y6B2 187 aa39.61■■■■□ 3.93
CDK9-202ENST00000421939 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.6■■■■□ 3.93
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CDK9-202ENST00000421939 TRPM2O94759 1503 aa39.5■■■■□ 3.91
CDK9-202ENST00000421939 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.5■■■■□ 3.91
CDK9-202ENST00000421939 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
CDK9-202ENST00000421939 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
CDK9-202ENST00000421939 ZFYVE9O95405 1425 aa39.48■■■■□ 3.91
CDK9-202ENST00000421939 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.48■■■■□ 3.91
CDK9-202ENST00000421939 CPS1P31327 1500 aa39.46■■■■□ 3.91
CDK9-202ENST00000421939 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.46■■■■□ 3.91
CDK9-202ENST00000421939 CLTCL1P53675 1640 aa39.43■■■■□ 3.9
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