RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 ITGAEP38570 1179 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD12-202ENST00000406506 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.39■■■□□ 2.3
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HOXD12-202ENST00000406506 C3P01024 1663 aa29.39■■■□□ 2.29
HOXD12-202ENST00000406506 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
HOXD12-202ENST00000406506 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD12-202ENST00000406506 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXD12-202ENST00000406506 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXD12-202ENST00000406506 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXD12-202ENST00000406506 GGT6Q6P531 493 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXD12-202ENST00000406506 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXD12-202ENST00000406506 CEP152O94986 1710 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD12-202ENST00000406506 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.32■■■□□ 2.28
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HOXD12-202ENST00000406506 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD12-202ENST00000406506 ABCC3O15438 1527 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD12-202ENST00000406506 UNC13BO14795 1591 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD12-202ENST00000406506 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD12-202ENST00000406506 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD12-202ENST00000406506 NAIPQ13075 1403 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXD12-202ENST00000406506 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD12-202ENST00000406506 HFM1A2PYH4 1435 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD12-202ENST00000406506 ZMYM3Q14202 1370 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD12-202ENST00000406506 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.19■■■□□ 2.26
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HOXD12-202ENST00000406506 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.19■■■□□ 2.26
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HOXD12-202ENST00000406506 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD12-202ENST00000406506 KANK1Q14678 1352 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD12-202ENST00000406506 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.14■■■□□ 2.25
HOXD12-202ENST00000406506 NPATQ14207 1427 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD12-202ENST00000406506 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.25
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HOXD12-202ENST00000406506 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD12-202ENST00000406506 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD12-202ENST00000406506 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD12-202ENST00000406506 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.06■■■□□ 2.24
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HOXD12-202ENST00000406506 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD12-202ENST00000406506 ERVK-7P63135 1459 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD12-202ENST00000406506 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.01■■■□□ 2.24
HOXD12-202ENST00000406506 E9PCH4 1651 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD12-202ENST00000406506 NUP155O75694 1391 aa28.98■■■□□ 2.23
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HOXD12-202ENST00000406506 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD12-202ENST00000406506 TNRQ92752 1358 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD12-202ENST00000406506 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
HOXD12-202ENST00000406506 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD12-202ENST00000406506 SYNMO15061 1565 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD12-202ENST00000406506 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD12-202ENST00000406506 NLRP1Q9C000 1473 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD12-202ENST00000406506 NOS1P29475 1434 aa28.88■■■□□ 2.21
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HOXD12-202ENST00000406506 TRIM52Q96A61 297 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXD12-202ENST00000406506 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.81■■■□□ 2.2
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HOXD12-202ENST00000406506 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
HOXD12-202ENST00000406506 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.75■■■□□ 2.19
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HOXD12-202ENST00000406506 PTPRTO14522 1441 aa28.72■■■□□ 2.19
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HOXD12-202ENST00000406506 IDI1Q13907 227 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD12-202ENST00000406506 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.64■■■□□ 2.17
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HOXD12-202ENST00000406506 ZFYVE9O95405 1425 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXD12-202ENST00000406506 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXD12-202ENST00000406506 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
HOXD12-202ENST00000406506 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXD12-202ENST00000406506 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
HOXD12-202ENST00000406506 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXD12-202ENST00000406506 LTKP29376 864 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXD12-202ENST00000406506 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.42■■■□□ 2.14
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