RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402613.3

VSTM2A-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VSTM2A, Length 1,076 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-202ENST00000402613 KIF15Q9NS87 1388 aa36.77■■■■□ 3.48
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
VSTM2A-202ENST00000402613 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.75■■■■□ 3.47
VSTM2A-202ENST00000402613 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.75■■■■□ 3.47
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.75■■■■□ 3.47
VSTM2A-202ENST00000402613 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.75■■■■□ 3.47
VSTM2A-202ENST00000402613 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.73■■■■□ 3.47
VSTM2A-202ENST00000402613 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
VSTM2A-202ENST00000402613 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
VSTM2A-202ENST00000402613 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.67■■■■□ 3.46
VSTM2A-202ENST00000402613 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
VSTM2A-202ENST00000402613 ERBINQ96RT1 1412 aa36.66■■■■□ 3.46
VSTM2A-202ENST00000402613 PZPP20742 1482 aa36.64■■■■□ 3.46
VSTM2A-202ENST00000402613 NCOA1Q15788 1441 aa36.64■■■■□ 3.46
VSTM2A-202ENST00000402613 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.62■■■■□ 3.45
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCC3O15438 1527 aa36.6■■■■□ 3.45
VSTM2A-202ENST00000402613 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.59■■■■□ 3.45
VSTM2A-202ENST00000402613 STRCQ7RTU9 1775 aa36.58■■■■□ 3.45
VSTM2A-202ENST00000402613 TNRQ92752 1358 aa36.58■■■■□ 3.45
VSTM2A-202ENST00000402613 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.58■■■■□ 3.45
VSTM2A-202ENST00000402613 ADGRL2O95490 1459 aa36.57■■■■□ 3.45
VSTM2A-202ENST00000402613 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
VSTM2A-202ENST00000402613 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
VSTM2A-202ENST00000402613 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.52■■■■□ 3.44
VSTM2A-202ENST00000402613 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
VSTM2A-202ENST00000402613 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.52■■■■□ 3.44
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
VSTM2A-202ENST00000402613 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.5■■■■□ 3.43
VSTM2A-202ENST00000402613 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
VSTM2A-202ENST00000402613 PTPRTO14522 1441 aa36.48■■■■□ 3.43
VSTM2A-202ENST00000402613 KANK1Q14678 1352 aa36.44■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.44■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 PLA2R1Q13018 1463 aa36.43■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 DEPDC5O75140 1603 aa36.43■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.42■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 PKD2Q13563 968 aa36.41■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 CEP152O94986 1710 aa36.41■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 NLRP1Q9C000 1473 aa36.41■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 ERVK-7P63135 1459 aa36.4■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.4■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.4■■■■□ 3.42
VSTM2A-202ENST00000402613 ROCK1Q13464 1354 aa36.38■■■■□ 3.41
VSTM2A-202ENST00000402613 ITGAEP38570 1179 aa36.37■■■■□ 3.41
VSTM2A-202ENST00000402613 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
VSTM2A-202ENST00000402613 CERKQ8TCT0 537 aa36.34■■■■□ 3.41
VSTM2A-202ENST00000402613 FBXO41Q8TF61 875 aa36.34■■■■□ 3.41
VSTM2A-202ENST00000402613 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.33■■■■□ 3.41
VSTM2A-202ENST00000402613 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.32■■■■□ 3.4
VSTM2A-202ENST00000402613 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.29■■■■□ 3.4
VSTM2A-202ENST00000402613 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.23■■■■□ 3.39
VSTM2A-202ENST00000402613 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
VSTM2A-202ENST00000402613 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.17■■■■□ 3.38
VSTM2A-202ENST00000402613 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.16■■■■□ 3.38
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
VSTM2A-202ENST00000402613 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.13■■■■□ 3.37
VSTM2A-202ENST00000402613 UNC13BO14795 1591 aa36.12■■■■□ 3.37
VSTM2A-202ENST00000402613 NOS1P29475 1434 aa36.12■■■■□ 3.37
VSTM2A-202ENST00000402613 IDI1Q13907 227 aa36.11■■■■□ 3.37
VSTM2A-202ENST00000402613 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
VSTM2A-202ENST00000402613 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
VSTM2A-202ENST00000402613 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.08■■■■□ 3.37
VSTM2A-202ENST00000402613 MED14O60244 1454 aa36.07■■■■□ 3.37
VSTM2A-202ENST00000402613 NUP155O75694 1391 aa36.06■■■■□ 3.36
VSTM2A-202ENST00000402613 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
VSTM2A-202ENST00000402613 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.05■■■■□ 3.36
VSTM2A-202ENST00000402613 SYNMO15061 1565 aa36.05■■■■□ 3.36
VSTM2A-202ENST00000402613 TET3O43151 1660 aa36.04■■■■□ 3.36
VSTM2A-202ENST00000402613 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.04■■■■□ 3.36
VSTM2A-202ENST00000402613 PIK3C2BO00750 1634 aa36.02■■■■□ 3.36
VSTM2A-202ENST00000402613 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.01■■■■□ 3.36
VSTM2A-202ENST00000402613 LTKP29376 864 aa36■■■■□ 3.35
VSTM2A-202ENST00000402613 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36■■■■□ 3.35
VSTM2A-202ENST00000402613 SLIT1O75093 1534 aa35.99■■■■□ 3.35
VSTM2A-202ENST00000402613 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.98■■■■□ 3.35
VSTM2A-202ENST00000402613 NAIPQ13075 1403 aa35.98■■■■□ 3.35
VSTM2A-202ENST00000402613 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.97■■■■□ 3.35
VSTM2A-202ENST00000402613 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
VSTM2A-202ENST00000402613 EID1Q9Y6B2 187 aa35.96■■■■□ 3.35
VSTM2A-202ENST00000402613 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.95■■■■□ 3.35
VSTM2A-202ENST00000402613 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.94■■■■□ 3.34
VSTM2A-202ENST00000402613 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
VSTM2A-202ENST00000402613 IQGAP1P46940 1657 aa35.91■■■■□ 3.34
VSTM2A-202ENST00000402613 E9PCH4 1651 aa35.9■■■■□ 3.34
VSTM2A-202ENST00000402613 HFM1A2PYH4 1435 aa35.89■■■■□ 3.34
VSTM2A-202ENST00000402613 ADGRB3O60242 1522 aa35.88■■■■□ 3.33
VSTM2A-202ENST00000402613 CPS1P31327 1500 aa35.83■■■■□ 3.33
VSTM2A-202ENST00000402613 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
VSTM2A-202ENST00000402613 TRIM52Q96A61 297 aa35.75■■■■□ 3.31
VSTM2A-202ENST00000402613 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.75■■■■□ 3.31
VSTM2A-202ENST00000402613 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.73■■■■□ 3.31
VSTM2A-202ENST00000402613 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
VSTM2A-202ENST00000402613 ZFYVE9O95405 1425 aa35.72■■■■□ 3.31
VSTM2A-202ENST00000402613 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.7■■■■□ 3.31
VSTM2A-202ENST00000402613 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.68■■■■□ 3.3
VSTM2A-202ENST00000402613 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.65■■■■□ 3.3
VSTM2A-202ENST00000402613 BCANQ96GW7 911 aa35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms