RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381124.9

H2AFV-205, Transcript of H2A histone family member V, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene H2AFV, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFV-205ENST00000381124 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.66■■■■■ 4.26
H2AFV-205ENST00000381124 KIF15Q9NS87 1388 aa41.65■■■■■ 4.26
H2AFV-205ENST00000381124 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
H2AFV-205ENST00000381124 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
H2AFV-205ENST00000381124 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.64■■■■■ 4.26
H2AFV-205ENST00000381124 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.64■■■■■ 4.26
H2AFV-205ENST00000381124 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.64■■■■■ 4.26
H2AFV-205ENST00000381124 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.62■■■■■ 4.25
H2AFV-205ENST00000381124 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.6■■■■■ 4.25
H2AFV-205ENST00000381124 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
H2AFV-205ENST00000381124 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
H2AFV-205ENST00000381124 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
H2AFV-205ENST00000381124 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.56■■■■■ 4.24
H2AFV-205ENST00000381124 STRCQ7RTU9 1775 aa41.55■■■■■ 4.24
H2AFV-205ENST00000381124 PZPP20742 1482 aa41.55■■■■■ 4.24
H2AFV-205ENST00000381124 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
H2AFV-205ENST00000381124 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.54■■■■■ 4.24
H2AFV-205ENST00000381124 TNRQ92752 1358 aa41.51■■■■■ 4.24
H2AFV-205ENST00000381124 ERBINQ96RT1 1412 aa41.51■■■■■ 4.24
H2AFV-205ENST00000381124 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.5■■■■■ 4.23
H2AFV-205ENST00000381124 NCOA1Q15788 1441 aa41.5■■■■■ 4.23
H2AFV-205ENST00000381124 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
H2AFV-205ENST00000381124 ABCC3O15438 1527 aa41.49■■■■■ 4.23
H2AFV-205ENST00000381124 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
H2AFV-205ENST00000381124 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.45■■■■■ 4.23
H2AFV-205ENST00000381124 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
H2AFV-205ENST00000381124 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.43■■■■■ 4.223e-6■□□□□ 11.3
H2AFV-205ENST00000381124 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.42■■■■■ 4.22
H2AFV-205ENST00000381124 PTPRTO14522 1441 aa41.42■■■■■ 4.22
H2AFV-205ENST00000381124 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.39■■■■■ 4.22
H2AFV-205ENST00000381124 FBXO41Q8TF61 875 aa41.37■■■■■ 4.21
H2AFV-205ENST00000381124 ADGRL2O95490 1459 aa41.36■■■■■ 4.21
H2AFV-205ENST00000381124 CEP152O94986 1710 aa41.35■■■■■ 4.21
H2AFV-205ENST00000381124 PLA2R1Q13018 1463 aa41.34■■■■■ 4.21
H2AFV-205ENST00000381124 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
H2AFV-205ENST00000381124 CERKQ8TCT0 537 aa41.33■■■■■ 4.21
H2AFV-205ENST00000381124 KANK1Q14678 1352 aa41.33■■■■■ 4.21
H2AFV-205ENST00000381124 PKD2Q13563 968 aa41.32■■■■■ 4.21
H2AFV-205ENST00000381124 NLRP1Q9C000 1473 aa41.28■■■■■ 4.2
H2AFV-205ENST00000381124 ERVK-7P63135 1459 aa41.28■■■■■ 4.2
H2AFV-205ENST00000381124 DEPDC5O75140 1603 aa41.26■■■■■ 4.19
H2AFV-205ENST00000381124 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.25■■■■■ 4.19
H2AFV-205ENST00000381124 ITGAEP38570 1179 aa41.24■■■■■ 4.19
H2AFV-205ENST00000381124 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.23■■■■■ 4.19
H2AFV-205ENST00000381124 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
H2AFV-205ENST00000381124 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.19■■■■■ 4.18
H2AFV-205ENST00000381124 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.19■■■■■ 4.18
H2AFV-205ENST00000381124 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.181e-30■■■□□ 14.6
H2AFV-205ENST00000381124 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
H2AFV-205ENST00000381124 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.12■■■■■ 4.17
H2AFV-205ENST00000381124 ROCK1Q13464 1354 aa41.12■■■■■ 4.17
H2AFV-205ENST00000381124 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.11■■■■■ 4.17
H2AFV-205ENST00000381124 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.11■■■■■ 4.17
H2AFV-205ENST00000381124 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
H2AFV-205ENST00000381124 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.05■■■■■ 4.16
H2AFV-205ENST00000381124 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
H2AFV-205ENST00000381124 NEURL4Q96JN8 1562 aa41■■■■■ 4.15
H2AFV-205ENST00000381124 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.99■■■■■ 4.15
H2AFV-205ENST00000381124 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
H2AFV-205ENST00000381124 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.95■■■■■ 4.15
H2AFV-205ENST00000381124 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
H2AFV-205ENST00000381124 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.93■■■■■ 4.14
H2AFV-205ENST00000381124 UNC13BO14795 1591 aa40.91■■■■■ 4.14
H2AFV-205ENST00000381124 IDI1Q13907 227 aa40.89■■■■■ 4.14
H2AFV-205ENST00000381124 NOS1P29475 1434 aa40.89■■■■■ 4.14
H2AFV-205ENST00000381124 MED14O60244 1454 aa40.89■■■■■ 4.14
H2AFV-205ENST00000381124 PIK3C2BO00750 1634 aa40.87■■■■■ 4.13
H2AFV-205ENST00000381124 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
H2AFV-205ENST00000381124 SYNMO15061 1565 aa40.86■■■■■ 4.13
H2AFV-205ENST00000381124 TET3O43151 1660 aa40.85■■■■■ 4.13
H2AFV-205ENST00000381124 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.84■■■■■ 4.13
H2AFV-205ENST00000381124 NUP155O75694 1391 aa40.84■■■■■ 4.13
H2AFV-205ENST00000381124 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.83■■■■■ 4.13
H2AFV-205ENST00000381124 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
H2AFV-205ENST00000381124 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.81■■■■■ 4.12
H2AFV-205ENST00000381124 EID1Q9Y6B2 187 aa40.81■■■■■ 4.12
H2AFV-205ENST00000381124 IQGAP1P46940 1657 aa40.8■■■■■ 4.12
H2AFV-205ENST00000381124 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.8■■■■■ 4.12
H2AFV-205ENST00000381124 SLIT1O75093 1534 aa40.79■■■■■ 4.12
H2AFV-205ENST00000381124 LTKP29376 864 aa40.79■■■■■ 4.12
H2AFV-205ENST00000381124 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.77■■■■■ 4.12
H2AFV-205ENST00000381124 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.76■■■■■ 4.12
H2AFV-205ENST00000381124 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.75■■■■■ 4.11
H2AFV-205ENST00000381124 ADGRB3O60242 1522 aa40.7■■■■■ 4.11
H2AFV-205ENST00000381124 CPS1P31327 1500 aa40.7■■■■■ 4.11
H2AFV-205ENST00000381124 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
H2AFV-205ENST00000381124 E9PCH4 1651 aa40.67■■■■■ 4.1
H2AFV-205ENST00000381124 NAIPQ13075 1403 aa40.67■■■■■ 4.1
H2AFV-205ENST00000381124 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.66■■■■■ 4.1
H2AFV-205ENST00000381124 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
H2AFV-205ENST00000381124 HFM1A2PYH4 1435 aa40.55■■■■■ 4.08
H2AFV-205ENST00000381124 BCANQ96GW7 911 aa40.54■■■■■ 4.08
H2AFV-205ENST00000381124 TRIM52Q96A61 297 aa40.52■■■■■ 4.08
H2AFV-205ENST00000381124 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
H2AFV-205ENST00000381124 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
H2AFV-205ENST00000381124 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.49■■■■■ 4.07
H2AFV-205ENST00000381124 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.49■■■■■ 4.07
H2AFV-205ENST00000381124 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
H2AFV-205ENST00000381124 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.49■■■■■ 4.07
H2AFV-205ENST00000381124 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.47■■■■■ 4.07
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