RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.59■■□□□ 1.85
USP11-202ENST00000377078 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
USP11-202ENST00000377078 ABCC5O15440 1437 aa26.58■■□□□ 1.85
USP11-202ENST00000377078 STRCQ7RTU9 1775 aa26.57■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.57■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 KIF15Q9NS87 1388 aa26.57■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.57■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 DAPK1P53355 1430 aa26.56■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 PZPP20742 1482 aa26.55■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 FBXO41Q8TF61 875 aa26.55■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 NCOA1Q15788 1441 aa26.55■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 PTPRTO14522 1441 aa26.53■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.53■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 TNRQ92752 1358 aa26.52■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.52■■□□□ 1.84
USP11-202ENST00000377078 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 ERBINQ96RT1 1412 aa26.51■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.5■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.49■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 ABCC3O15438 1527 aa26.48■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 PLA2R1Q13018 1463 aa26.48■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 CERKQ8TCT0 537 aa26.47■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 PKD2Q13563 968 aa26.46■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.46■■□□□ 1.83
USP11-202ENST00000377078 NLRP1Q9C000 1473 aa26.42■■□□□ 1.82
USP11-202ENST00000377078 KANK1Q14678 1352 aa26.42■■□□□ 1.82
USP11-202ENST00000377078 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.42■■□□□ 1.82
USP11-202ENST00000377078 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.41■■□□□ 1.82
USP11-202ENST00000377078 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
USP11-202ENST00000377078 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.811e-6■■■□□ 16.6
USP11-202ENST00000377078 ADGRL2O95490 1459 aa26.37■■□□□ 1.81
USP11-202ENST00000377078 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
USP11-202ENST00000377078 CEP152O94986 1710 aa26.36■■□□□ 1.81
USP11-202ENST00000377078 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.35■■□□□ 1.81
USP11-202ENST00000377078 ERVK-7P63135 1459 aa26.35■■□□□ 1.81
USP11-202ENST00000377078 DEPDC5O75140 1603 aa26.34■■□□□ 1.81
USP11-202ENST00000377078 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.33■■□□□ 1.81
USP11-202ENST00000377078 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.32■■□□□ 1.8
USP11-202ENST00000377078 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.3■■□□□ 1.8
USP11-202ENST00000377078 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
USP11-202ENST00000377078 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.28■■□□□ 1.8
USP11-202ENST00000377078 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
USP11-202ENST00000377078 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
USP11-202ENST00000377078 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.25■■□□□ 1.79
USP11-202ENST00000377078 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.24■■□□□ 1.79
USP11-202ENST00000377078 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
USP11-202ENST00000377078 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.23■■□□□ 1.79
USP11-202ENST00000377078 ROCK1Q13464 1354 aa26.22■■□□□ 1.79
USP11-202ENST00000377078 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.21■■□□□ 1.79
USP11-202ENST00000377078 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
USP11-202ENST00000377078 ITGAEP38570 1179 aa26.19■■□□□ 1.78
USP11-202ENST00000377078 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.19■■□□□ 1.78
USP11-202ENST00000377078 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.17■■□□□ 1.78
USP11-202ENST00000377078 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.17■■□□□ 1.78
USP11-202ENST00000377078 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
USP11-202ENST00000377078 MED14O60244 1454 aa26.16■■□□□ 1.78
USP11-202ENST00000377078 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.14■■□□□ 1.78
USP11-202ENST00000377078 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 EID1Q9Y6B2 187 aa26.12■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 IQGAP1P46940 1657 aa26.09■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 UNC13BO14795 1591 aa26.09■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.09■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 CPS1P31327 1500 aa26.09■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 NOS1P29475 1434 aa26.08■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 PIK3C2BO00750 1634 aa26.08■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 TET3O43151 1660 aa26.08■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 SLIT1O75093 1534 aa26.08■■□□□ 1.77
USP11-202ENST00000377078 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
USP11-202ENST00000377078 IDI1Q13907 227 aa26.07■■□□□ 1.76
USP11-202ENST00000377078 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.07■■□□□ 1.76
USP11-202ENST00000377078 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.06■■□□□ 1.76
USP11-202ENST00000377078 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
USP11-202ENST00000377078 SYNMO15061 1565 aa26.04■■□□□ 1.76
USP11-202ENST00000377078 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.04■■□□□ 1.76
USP11-202ENST00000377078 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.03■■□□□ 1.76
USP11-202ENST00000377078 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.02■■□□□ 1.76
USP11-202ENST00000377078 NUP155O75694 1391 aa26.02■■□□□ 1.76
USP11-202ENST00000377078 LTKP29376 864 aa26.01■■□□□ 1.75
USP11-202ENST00000377078 ADGRB3O60242 1522 aa26■■□□□ 1.75
USP11-202ENST00000377078 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.99■■□□□ 1.75
USP11-202ENST00000377078 TOM1O60784 492 aa25.93■■□□□ 1.74
USP11-202ENST00000377078 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
USP11-202ENST00000377078 E9PCH4 1651 aa25.92■■□□□ 1.74
USP11-202ENST00000377078 BCANQ96GW7 911 aa25.89■■□□□ 1.74
USP11-202ENST00000377078 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
USP11-202ENST00000377078 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
USP11-202ENST00000377078 NAIPQ13075 1403 aa25.88■■□□□ 1.73
USP11-202ENST00000377078 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
USP11-202ENST00000377078 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.84■■□□□ 1.73
USP11-202ENST00000377078 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
USP11-202ENST00000377078 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.84■■□□□ 1.73
USP11-202ENST00000377078 HFM1A2PYH4 1435 aa25.83■■□□□ 1.73
USP11-202ENST00000377078 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.83■■□□□ 1.73
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